MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella suis 1330 chromosome I

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017251	GCTGCC	2	12	18960	18971	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017251	ACGGTT	2	12	34841	34852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017251	CCTGGC	2	12	81350	81361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017251	TTTTGC	2	12	94495	94506	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017251	GCTTTT	2	12	103273	103284	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017251	CTGGCG	2	12	146702	146713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017251	GCCGAG	2	12	162530	162541	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017251	GGGGAA	2	12	169743	169754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017251	TCTGGC	2	12	186233	186244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017251	CCAGTG	2	12	209131	209142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017251	TTCCGA	2	12	218457	218468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017251	CTGATG	2	12	275432	275443	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017251	GGCACA	2	12	285852	285863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017251	CTGAAA	2	12	331590	331601	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017251	CTGTCT	2	12	342364	342375	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017251	TTGCCT	2	12	342669	342680	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017251	TCGATA	2	12	425023	425034	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017251	TTTAAC	2	12	433012	433023	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017251	CGTTTT	2	12	506712	506723	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017251	CGTCAC	2	12	514541	514552	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017251	ACGGTC	2	12	526812	526823	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017251	TTACGT	2	12	557102	557113	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017251	CAGTTC	2	12	588927	588938	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017251	GAATAT	2	12	717411	717422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017251	CGGGAT	2	12	729889	729900	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017251	ATTGAA	2	12	752190	752201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017251	CTTTTC	2	12	768176	768187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017251	TCGCGC	2	12	808009	808020	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017251	GGCGTT	2	12	836559	836570	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017251	GAAATT	2	12	900053	900064	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017251	TGCCGG	2	12	980220	980231	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017251	GCTGAT	2	12	998337	998348	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017251	TTTCCT	2	12	1009684	1009695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017251	GGATGG	2	12	1009864	1009875	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017251	CGCCAG	2	12	1010257	1010268	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017251	TATTTT	2	12	1017699	1017710	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017251	TTTTCC	2	12	1142289	1142300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017251	CAAAAA	2	12	1180012	1180023	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017251	TGAATT	2	12	1235585	1235596	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017251	CAGCGC	2	12	1272985	1272996	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017251	CGGGTT	2	12	1273052	1273063	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017251	GCCTGC	2	12	1280179	1280190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017251	TCAATT	2	12	1283691	1283702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017251	CGTTTC	2	12	1292557	1292568	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017251	CACCGC	2	12	1293610	1293621	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017251	AAAACA	2	12	1293799	1293810	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017251	AAAGCG	2	12	1332619	1332630	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017251	ATAGCC	2	12	1332869	1332880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017251	CCGCGC	2	12	1384429	1384440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017251	GTAAAA	2	12	1402654	1402665	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017251	GCATTT	2	12	1408629	1408640	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017251	GCGCAT	2	12	1426727	1426738	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017251	CATCGG	2	12	1434268	1434279	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017251	ATGCCA	2	12	1436683	1436694	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017251	AAGGAA	2	12	1468951	1468962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017251	GCTCTG	2	12	1471029	1471040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017251	AAAAGC	2	12	1543559	1543570	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017251	TGAAAA	2	12	1573481	1573492	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017251	TCGCCG	2	12	1575729	1575740	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017251	TGGAGG	2	12	1583607	1583618	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017251	CTGCCG	2	12	1590599	1590610	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017251	GCATCC	2	12	1615816	1615827	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017251	GGAGCC	2	12	1615848	1615859	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017251	AATGCC	2	12	1650273	1650284	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017251	CGACCA	2	12	1660376	1660387	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017251	CTGGCG	2	12	1698950	1698961	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017251	TTGCGG	2	12	1698975	1698986	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017251	ATGCCG	2	12	1708970	1708981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017251	GCTTCT	2	12	1709298	1709309	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017251	TAAAAA	2	12	1778797	1778808	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017251	CTGCCG	2	12	1795661	1795672	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017251	CGGCTG	2	12	1827495	1827506	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017251	AGAAAC	2	12	1841976	1841987	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017251	AACTCA	2	12	1858109	1858120	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017251	GAAGCC	2	12	1897366	1897377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017251	TTCTTT	2	12	2062243	2062254	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017251	GGAAAC	2	12	2086253	2086264	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017251	TCTTTG	2	12	2099986	2099997	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.