MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella suis 1330 chromosome II

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017250	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017250	AGCGG	2	10	22099	22108	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017250	GGCCT	2	10	37492	37501	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017250	ATGAA	2	10	40063	40072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017250	TTTGT	2	10	41224	41233	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017250	CGCTC	2	10	43433	43442	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_017250	TGCGG	2	10	60812	60821	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017250	TATCT	2	10	73049	73058	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017250	TCGGT	2	10	81758	81767	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017250	TTCTC	2	10	81787	81796	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017250	CGCGG	2	10	81995	82004	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017250	ACTTG	2	10	87314	87323	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017250	CGGTA	2	10	97183	97192	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017250	CCAAG	2	10	97358	97367	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017250	CTTGC	2	10	108017	108026	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017250	CCTGC	2	10	112691	112700	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_017250	GCCCG	2	10	115951	115960	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_017250	GCACA	2	10	117242	117251	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017250	GTTCG	2	10	117263	117272	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017250	GAAAA	2	10	119195	119204	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017250	CGATA	2	10	121432	121441	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017250	GCCCG	2	10	121846	121855	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017250	AGATA	2	10	134535	134544	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017250	GCCGC	2	10	141642	141651	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_017250	TTGGC	2	10	145173	145182	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017250	CCGGG	2	10	152323	152332	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017250	CGGAT	2	10	159694	159703	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017250	TGGGC	2	10	159825	159834	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017250	TGTTT	2	10	160278	160287	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017250	CCCGT	2	10	161003	161012	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_017250	GCCGA	2	10	175195	175204	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017250	GCCCC	2	10	175222	175231	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33	NC_017250	GGATA	2	10	188116	188125	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017250	TGACG	2	10	191862	191871	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017250	GATCA	2	10	193310	193319	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017250	AGCAG	2	10	203630	203639	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017250	AAATT	2	10	209238	209247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017250	ATCAA	2	10	209381	209390	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017250	TGAAA	2	10	209391	209400	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017250	TAAGT	2	10	214413	214422	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017250	CGCTG	2	10	253206	253215	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017250	CGTCC	2	10	254369	254378	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_017250	GCTTT	2	10	304919	304928	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017250	GCCGG	2	10	319942	319951	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017250	TTTGT	2	10	322910	322919	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017250	GGTGG	2	10	340410	340419	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017250	CTCCC	2	10	346890	346899	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
48	NC_017250	GCGCC	2	10	347185	347194	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_017250	AGGGC	2	10	347365	347374	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017250	AAAAC	2	10	347551	347560	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017250	AGTTG	2	10	361076	361085	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017250	TGCGC	2	10	361509	361518	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_017250	GGCAT	2	10	361575	361584	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017250	TTTGT	2	10	365360	365369	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017250	GCTTC	2	10	375054	375063	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017250	GGTGC	2	10	375806	375815	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017250	TGGAG	2	10	395811	395820	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017250	TGGAG	2	10	408876	408885	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017250	TCATA	2	10	409967	409976	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017250	GCCCA	2	10	411478	411487	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_017250	AGCAA	2	10	416329	416338	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017250	CGGAA	2	10	443020	443029	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017250	GCGCC	2	10	448072	448081	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_017250	CTGAT	2	10	448151	448160	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017250	GGCAA	2	10	450393	450402	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017250	AGTGA	2	10	450986	450995	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017250	ATCCC	2	10	455565	455574	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_017250	AAAGC	2	10	475348	475357	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017250	ACTGG	2	10	502246	502255	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017250	TCGCA	2	10	531901	531910	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017250	GTCGA	2	10	538367	538376	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017250	AGCGG	2	10	572797	572806	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017250	ACAAA	2	10	575103	575112	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017250	TTTGC	2	10	599051	599060	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017250	ATTTC	2	10	601883	601892	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017250	GCAGA	2	10	605779	605788	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017250	GCCTT	2	10	607226	607235	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017250	GTTTT	2	10	617621	617630	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017250	ACAAA	2	10	629857	629866	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017250	TCGCT	2	10	636375	636384	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017250	GCCGC	2	10	645452	645461	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_017250	CCAGC	2	10	645531	645540	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_017250	GGCTC	2	10	647635	647644	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017250	TGGCT	2	10	669723	669732	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017250	CCGGC	2	10	675287	675296	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_017250	ACGGC	2	10	692653	692662	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017250	AAGGC	2	10	697351	697360	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017250	TTACG	2	10	708720	708729	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017250	CTCTC	2	10	714105	714114	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_017250	TCAGG	2	10	719983	719992	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017250	ATTAT	2	10	753814	753823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017250	CATGA	2	10	755329	755338	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017250	GGCCG	2	10	755874	755883	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017250	TCAAA	2	10	778324	778333	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017250	CATCG	2	10	781693	781702	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017250	ACAAA	2	10	781809	781818	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017250	TCCCC	2	10	790600	790609	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_017250	TCCCC	2	10	792220	792229	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
99	NC_017250	GAGGT	2	10	795250	795259	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017250	CATTC	2	10	804646	804655	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017250	GCAGT	2	10	820604	820613	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017250	GCCGC	2	10	839488	839497	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_017250	ACGCC	2	10	839772	839781	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_017250	AGAGG	2	10	843481	843490	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017250	CAATT	2	10	868614	868623	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017250	CGTAT	2	10	868625	868634	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017250	GAAAA	2	10	873799	873808	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017250	GGTTT	2	10	881734	881743	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017250	TGATA	2	10	888710	888719	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017250	CCCTC	2	10	911450	911459	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
111	NC_017250	ACAAA	2	10	922180	922189	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017250	GGTGG	2	10	950566	950575	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017250	CATGG	2	10	954334	954343	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017250	CCGGG	4	20	954344	954363	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017250	GCCTC	2	10	954403	954412	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_017250	GCCTG	2	10	954895	954904	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_017250	TGGAA	2	10	964447	964456	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017250	AGGCC	2	10	969080	969089	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017250	CGCGC	3	15	972231	972245	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_017250	CCCTT	2	10	973672	973681	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
121	NC_017250	CCCCG	2	10	989334	989343	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
122	NC_017250	TAAAA	2	10	993410	993419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017250	AGCGA	2	10	1024188	1024197	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017250	CGCTT	2	10	1034029	1034038	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017250	TGCGC	2	10	1037741	1037750	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017250	CGCCT	2	10	1053368	1053377	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_017250	ATTAA	2	10	1054776	1054785	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017250	AACCG	2	10	1056606	1056615	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017250	TTTTC	2	10	1066733	1066742	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017250	GTTGA	2	10	1072976	1072985	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017250	CAGCT	2	10	1091444	1091453	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017250	GCGCT	2	10	1093968	1093977	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017250	CTATT	2	10	1095132	1095141	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017250	GAAAG	2	10	1101701	1101710	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017250	TTTTC	2	10	1102040	1102049	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017250	TTCAA	2	10	1105460	1105469	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017250	CCTCT	2	10	1105478	1105487	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_017250	GCTGT	2	10	1107089	1107098	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017250	CGAAG	2	10	1107902	1107911	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017250	AGCCC	2	10	1108456	1108465	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
141	NC_017250	CACGA	2	10	1108601	1108610	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017250	TTATT	2	10	1114399	1114408	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017250	AGCCG	2	10	1131598	1131607	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017250	TGCGG	2	10	1135946	1135955	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017250	TTCTG	2	10	1150623	1150632	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017250	CGATG	2	10	1159777	1159786	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017250	GGAAG	2	10	1182774	1182783	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017250	ACGGC	2	10	1194647	1194656	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.