MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella suis 1330 chromosome II

Total Repeats: 471

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017250	GAAA	2	8	147	154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017250	CGAT	2	8	9010	9017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017250	TGAT	2	8	20651	20658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017250	AAAC	2	8	27883	27890	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017250	CCTT	2	8	27907	27914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017250	GACA	2	8	30154	30161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017250	ATCT	2	8	31448	31455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017250	TCAA	2	8	33122	33129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017250	GCCT	2	8	39229	39236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017250	GTCC	2	8	39974	39981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017250	GTTC	2	8	43187	43194	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017250	GAAT	2	8	46688	46695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017250	AAAC	2	8	54715	54722	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017250	ATGG	2	8	56085	56092	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017250	CCAG	2	8	62062	62069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017250	TGCT	2	8	66141	66148	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017250	CAAA	2	8	66346	66353	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017250	CCGC	2	8	66442	66449	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_017250	GCCG	2	8	69149	69156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017250	ATGA	2	8	69360	69367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017250	AGTA	2	8	73025	73032	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017250	GGGC	2	8	83766	83773	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017250	GCTC	2	8	86482	86489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017250	CTTC	2	8	87201	87208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017250	TTAA	2	8	92480	92487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017250	ATAA	2	8	96959	96966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017250	GATA	2	8	103486	103493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017250	TCTT	2	8	112613	112620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017250	TGCC	2	8	112628	112635	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017250	CAGT	2	8	116008	116015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017250	TTCA	2	8	117117	117124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017250	CTGG	2	8	120937	120944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017250	GAAG	2	8	127476	127483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017250	TTTA	2	8	129298	129305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017250	TTAA	2	8	134483	134490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017250	ACGA	2	8	134581	134588	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017250	GATG	2	8	141492	141499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017250	ATAC	2	8	142001	142008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017250	CGGA	2	8	142145	142152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017250	GCCG	2	8	145098	145105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017250	CATG	2	8	154049	154056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017250	CCCA	2	8	154173	154180	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_017250	TAGG	2	8	155472	155479	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017250	TTTC	2	8	159670	159677	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017250	GTTC	2	8	161106	161113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017250	TGAA	2	8	161306	161313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017250	ACGG	2	8	163337	163344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017250	GGGC	2	8	163532	163539	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017250	ATGA	2	8	169901	169908	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017250	CACG	2	8	170627	170634	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017250	TTCC	2	8	171382	171389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017250	CAGG	2	8	171416	171423	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017250	TCAA	2	8	174778	174785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017250	CTGG	2	8	174999	175006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017250	CGAG	2	8	175595	175602	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017250	GGCT	2	8	178271	178278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017250	TTGA	2	8	178385	178392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017250	AGGC	2	8	178809	178816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017250	GCCT	2	8	178821	178828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017250	TATT	2	8	179237	179244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017250	ATTC	2	8	184144	184151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017250	GGCT	2	8	187245	187252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017250	TCGC	2	8	189439	189446	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017250	CAGC	2	8	192042	192049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017250	GCAG	2	8	192077	192084	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017250	CAAT	2	8	192638	192645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017250	CTGG	2	8	193641	193648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017250	CCGA	2	8	194552	194559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017250	GAAA	2	8	199900	199907	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017250	ATAG	2	8	211858	211865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017250	CGCC	2	8	213248	213255	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_017250	TGCC	2	8	213517	213524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017250	GGCG	2	8	213638	213645	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017250	CGGC	2	8	214041	214048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017250	TGCC	2	8	217932	217939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017250	GCCT	2	8	218471	218478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017250	CGGG	2	8	218500	218507	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017250	AAAT	2	8	222266	222273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017250	ATCA	2	8	223690	223697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017250	ATTT	2	8	223713	223720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017250	CTGC	2	8	223730	223737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017250	TCGA	2	8	225618	225625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017250	GCCG	2	8	225642	225649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017250	CTGC	2	8	230897	230904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017250	CGGG	2	8	232899	232906	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017250	TTTG	2	8	238474	238481	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017250	ATTG	2	8	241210	241217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017250	AGTA	2	8	246943	246950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017250	CCGG	2	8	247150	247157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017250	CATG	2	8	253469	253476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017250	GGAA	2	8	253790	253797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017250	TGAA	2	8	254178	254185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017250	CTTC	2	8	255106	255113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017250	TCAA	2	8	255226	255233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017250	TTTG	2	8	265664	265671	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017250	ATTG	2	8	286453	286460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017250	CTGT	2	8	288571	288578	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017250	AGGC	2	8	294829	294836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017250	CTTG	2	8	301978	301985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017250	GGCG	2	8	301994	302001	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017250	AATG	2	8	302032	302039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017250	AAAT	2	8	302371	302378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017250	CCGG	2	8	302709	302716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017250	GCGG	2	8	307040	307047	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017250	GCCG	2	8	310276	310283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017250	AGGA	2	8	311034	311041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017250	TTTG	2	8	311674	311681	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017250	TTGG	2	8	317415	317422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017250	GGAG	2	8	317451	317458	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017250	CAAT	2	8	319026	319033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017250	TCTT	2	8	319751	319758	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017250	TGGG	2	8	319825	319832	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017250	CGGG	2	8	320560	320567	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017250	AAGG	2	8	321055	321062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017250	GCGG	2	8	322613	322620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017250	TCCA	2	8	325089	325096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017250	CTTG	2	8	325289	325296	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017250	TAGT	2	8	334107	334114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017250	GTGA	2	8	346564	346571	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017250	TTGA	2	8	346608	346615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017250	CTTC	2	8	346717	346724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017250	TCCA	2	8	347144	347151	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017250	GGGC	2	8	347261	347268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017250	GCTG	2	8	347592	347599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017250	CTTG	2	8	351397	351404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017250	ACGA	2	8	351531	351538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017250	GGTC	2	8	351586	351593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017250	ATCC	2	8	361028	361035	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017250	AATT	2	8	361612	361619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017250	TAAT	2	8	361646	361653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017250	GGGC	2	8	369224	369231	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017250	TAAG	2	8	369311	369318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017250	GGGC	2	8	372742	372749	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017250	GGCG	2	8	374037	374044	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017250	GTGG	2	8	375156	375163	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017250	CATT	2	8	375705	375712	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017250	TCGC	2	8	375731	375738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017250	TGGC	2	8	375789	375796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017250	ATTA	2	8	394115	394122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017250	CGAT	2	8	396339	396346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017250	AGTG	2	8	396625	396632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017250	TGGC	2	8	396672	396679	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017250	ATTT	2	8	398195	398202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017250	CGGG	2	8	405371	405378	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017250	CTGT	2	8	405477	405484	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017250	GGCT	2	8	405601	405608	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017250	AAAT	2	8	409804	409811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017250	GAGC	2	8	414616	414623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017250	CTTT	2	8	425839	425846	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017250	GTAT	2	8	425978	425985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017250	TTTG	2	8	428894	428901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017250	AAGC	2	8	432045	432052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_017250	GACG	2	8	432073	432080	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_017250	GCCT	2	8	433388	433395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
155	NC_017250	CCAT	2	8	442908	442915	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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159	NC_017250	GATA	2	8	448558	448565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017250	AATC	2	8	448646	448653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_017250	GATT	2	8	448654	448661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017250	CGGA	2	8	450555	450562	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
163	NC_017250	AGGC	2	8	451188	451195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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170	NC_017250	ATGG	2	8	475303	475310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017250	GATT	2	8	477273	477280	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017250	GGAC	2	8	477454	477461	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_017250	ATGG	2	8	489777	489784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_017250	TGAC	2	8	522134	522141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_017250	GATT	2	8	538781	538788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017250	ATTT	2	8	539074	539081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_017250	GATT	2	8	539324	539331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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225	NC_017250	GATC	2	8	645734	645741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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269	NC_017250	CACG	2	8	753032	753039	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
270	NC_017250	GGGA	2	8	753118	753125	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017250	CGAA	2	8	755138	755145	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
272	NC_017250	GGCA	2	8	755850	755857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
273	NC_017250	GCGG	2	8	755938	755945	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
274	NC_017250	CCTG	2	8	756554	756561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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444	NC_017250	ATGA	2	8	1129133	1129140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
445	NC_017250	TGCG	2	8	1129249	1129256	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
446	NC_017250	CTGC	2	8	1131413	1131420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
447	NC_017250	GATG	2	8	1131898	1131905	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.