MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 6074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017249	GGTGG	2	10	3650	3659	0 %	20 %	80 %	0 %	384213731
2	NC_017249	CGCGG	2	10	6268	6277	0 %	0 %	60 %	40 %	384213734
3	NC_017249	GCCGC	2	10	7348	7357	0 %	0 %	40 %	60 %	384213734
4	NC_017249	CATCG	2	10	9153	9162	20 %	20 %	20 %	40 %	384213736
5	NC_017249	GACGG	2	10	10919	10928	20 %	0 %	60 %	20 %	384213738
6	NC_017249	AACTC	2	10	13091	13100	40 %	20 %	0 %	40 %	384213742
7	NC_017249	CCTTG	2	10	15141	15150	0 %	40 %	20 %	40 %	384213746
8	NC_017249	AGCGC	2	10	17500	17509	20 %	0 %	40 %	40 %	384213748
9	NC_017249	GGGCG	2	10	19495	19504	0 %	0 %	80 %	20 %	384213749
10	NC_017249	TCGCC	2	10	19533	19542	0 %	20 %	20 %	60 %	384213749
11	NC_017249	AGCGC	2	10	19901	19910	20 %	0 %	40 %	40 %	384213749
12	NC_017249	AGTCG	2	10	21703	21712	20 %	20 %	40 %	20 %	384213750
13	NC_017249	ACGCA	2	10	22305	22314	40 %	0 %	20 %	40 %	384213751
14	NC_017249	CCGCA	2	10	22397	22406	20 %	0 %	20 %	60 %	384213751
15	NC_017249	CAACC	2	10	23745	23754	40 %	0 %	0 %	60 %	384213752
16	NC_017249	GCTGG	2	10	25274	25283	0 %	20 %	60 %	20 %	384213753
17	NC_017249	TAAGA	2	10	26607	26616	60 %	20 %	20 %	0 %	384213755
18	NC_017249	CGGCT	2	10	26662	26671	0 %	20 %	40 %	40 %	384213755
19	NC_017249	GCGAC	2	10	29106	29115	20 %	0 %	40 %	40 %	384213757
20	NC_017249	GTCTT	2	10	38479	38488	0 %	60 %	20 %	20 %	384213770
21	NC_017249	ATTCC	2	10	45365	45374	20 %	40 %	0 %	40 %	384213778
22	NC_017249	GCGAC	2	10	45858	45867	20 %	0 %	40 %	40 %	384213778
23	NC_017249	GGCGC	2	10	48267	48276	0 %	0 %	60 %	40 %	384213784
24	NC_017249	TCGTC	2	10	48453	48462	0 %	40 %	20 %	40 %	384213784
25	NC_017249	TCGGC	2	10	49890	49899	0 %	20 %	40 %	40 %	384213787
26	NC_017249	ATCGC	2	10	50988	50997	20 %	20 %	20 %	40 %	384213789
27	NC_017249	GCCGA	2	10	52392	52401	20 %	0 %	40 %	40 %	384213791
28	NC_017249	GCATC	2	10	53111	53120	20 %	20 %	20 %	40 %	384213792
29	NC_017249	GGCGT	2	10	53478	53487	0 %	20 %	60 %	20 %	384213792
30	NC_017249	GATTT	2	10	53584	53593	20 %	60 %	20 %	0 %	384213792
31	NC_017249	CGATC	2	10	55599	55608	20 %	20 %	20 %	40 %	384213794
32	NC_017249	GCTCG	2	10	58423	58432	0 %	20 %	40 %	40 %	384213795
33	NC_017249	TCGGT	2	10	61803	61812	0 %	40 %	40 %	20 %	384213799
34	NC_017249	CGATC	2	10	64853	64862	20 %	20 %	20 %	40 %	384213804
35	NC_017249	CGAAG	2	10	65234	65243	40 %	0 %	40 %	20 %	384213804
36	NC_017249	CCAGC	2	10	73356	73365	20 %	0 %	20 %	60 %	384213810
37	NC_017249	GGCCG	2	10	73983	73992	0 %	0 %	60 %	40 %	384213811
38	NC_017249	GCGAA	2	10	74557	74566	40 %	0 %	40 %	20 %	384213811
39	NC_017249	TGCGC	2	10	76074	76083	0 %	20 %	40 %	40 %	384213813
40	NC_017249	CGATC	2	10	79587	79596	20 %	20 %	20 %	40 %	384213817
41	NC_017249	GCCGA	2	10	82773	82782	20 %	0 %	40 %	40 %	384213821
42	NC_017249	TCGGC	2	10	82834	82843	0 %	20 %	40 %	40 %	384213821
43	NC_017249	TGGCC	2	10	83146	83155	0 %	20 %	40 %	40 %	384213821
44	NC_017249	GCGCA	2	10	85089	85098	20 %	0 %	40 %	40 %	384213823
45	NC_017249	CGTTC	2	10	90609	90618	0 %	40 %	20 %	40 %	384213828
46	NC_017249	AGGCG	2	10	90888	90897	20 %	0 %	60 %	20 %	384213828
47	NC_017249	GTCTG	2	10	91736	91745	0 %	40 %	40 %	20 %	384213828
48	NC_017249	CGGCT	2	10	91780	91789	0 %	20 %	40 %	40 %	384213828
49	NC_017249	ATCCA	2	10	92458	92467	40 %	20 %	0 %	40 %	384213829
50	NC_017249	CCGAA	2	10	92577	92586	40 %	0 %	20 %	40 %	384213829
51	NC_017249	GTCGC	2	10	94821	94830	0 %	20 %	40 %	40 %	384213832
52	NC_017249	GCGTG	2	10	95161	95170	0 %	20 %	60 %	20 %	384213833
53	NC_017249	ACGCG	2	10	100680	100689	20 %	0 %	40 %	40 %	384213837
54	NC_017249	AGCCG	2	10	100920	100929	20 %	0 %	40 %	40 %	384213837
55	NC_017249	TCCGC	2	10	103935	103944	0 %	20 %	20 %	60 %	384213840
56	NC_017249	CGGCG	2	10	106663	106672	0 %	0 %	60 %	40 %	384213843
57	NC_017249	CGCGT	2	10	109645	109654	0 %	20 %	40 %	40 %	384213845
58	NC_017249	GCGCT	2	10	110994	111003	0 %	20 %	40 %	40 %	384213847
59	NC_017249	GTCGT	2	10	112604	112613	0 %	40 %	40 %	20 %	384213848
60	NC_017249	TTGTC	2	10	113724	113733	0 %	60 %	20 %	20 %	384213850
61	NC_017249	GCGAA	2	10	113853	113862	40 %	0 %	40 %	20 %	384213850
62	NC_017249	ATGGC	2	10	115148	115157	20 %	20 %	40 %	20 %	384213851
63	NC_017249	GGGAC	2	10	121266	121275	20 %	0 %	60 %	20 %	384213856
64	NC_017249	GCCCC	2	10	122070	122079	0 %	0 %	20 %	80 %	384213856
65	NC_017249	GGCGC	2	10	124523	124532	0 %	0 %	60 %	40 %	384213859
66	NC_017249	GGCCG	2	10	126406	126415	0 %	0 %	60 %	40 %	384213861
67	NC_017249	GGCTC	2	10	126942	126951	0 %	20 %	40 %	40 %	384213861
68	NC_017249	GCGCC	2	10	130912	130921	0 %	0 %	40 %	60 %	384213867
69	NC_017249	CATCG	2	10	131006	131015	20 %	20 %	20 %	40 %	384213867
70	NC_017249	TGGCC	2	10	132443	132452	0 %	20 %	40 %	40 %	384213870
71	NC_017249	CGGCG	2	10	132699	132708	0 %	0 %	60 %	40 %	384213870
72	NC_017249	GCGTT	2	10	134164	134173	0 %	40 %	40 %	20 %	384213871
73	NC_017249	CAGCG	2	10	134529	134538	20 %	0 %	40 %	40 %	384213871
74	NC_017249	CGCGA	2	10	137035	137044	20 %	0 %	40 %	40 %	384213874
75	NC_017249	GACCA	2	10	139954	139963	40 %	0 %	20 %	40 %	384213878
76	NC_017249	CTGGC	2	10	140335	140344	0 %	20 %	40 %	40 %	384213878
77	NC_017249	TTCGG	2	10	140353	140362	0 %	40 %	40 %	20 %	384213878
78	NC_017249	CGATC	2	10	140484	140493	20 %	20 %	20 %	40 %	384213879
79	NC_017249	CAAGG	2	10	141810	141819	40 %	0 %	40 %	20 %	384213880
80	NC_017249	TCGCC	2	10	143552	143561	0 %	20 %	20 %	60 %	384213882
81	NC_017249	ATCGA	2	10	144797	144806	40 %	20 %	20 %	20 %	384213883
82	NC_017249	TGGCC	2	10	145131	145140	0 %	20 %	40 %	40 %	384213883
83	NC_017249	ACGCT	2	10	145882	145891	20 %	20 %	20 %	40 %	384213884
84	NC_017249	CTCGA	2	10	147086	147095	20 %	20 %	20 %	40 %	384213885
85	NC_017249	GAGCG	2	10	150541	150550	20 %	0 %	60 %	20 %	384213889
86	NC_017249	GCCCC	2	10	154602	154611	0 %	0 %	20 %	80 %	384213892
87	NC_017249	AGCGC	2	10	154824	154833	20 %	0 %	40 %	40 %	384213892
88	NC_017249	CGGCG	2	10	156969	156978	0 %	0 %	60 %	40 %	384213895
89	NC_017249	GCGCG	2	10	158675	158684	0 %	0 %	60 %	40 %	384213897
90	NC_017249	GGCGC	2	10	160526	160535	0 %	0 %	60 %	40 %	384213900
91	NC_017249	GCCAG	2	10	161318	161327	20 %	0 %	40 %	40 %	384213900
92	NC_017249	GCCGC	2	10	163024	163033	0 %	0 %	40 %	60 %	384213900
93	NC_017249	GTGAT	2	10	164306	164315	20 %	40 %	40 %	0 %	384213901
94	NC_017249	GGCCG	2	10	164337	164346	0 %	0 %	60 %	40 %	384213901
95	NC_017249	CGGCG	2	10	164595	164604	0 %	0 %	60 %	40 %	384213901
96	NC_017249	GGACG	2	10	166333	166342	20 %	0 %	60 %	20 %	384213903
97	NC_017249	CTTGG	2	10	167961	167970	0 %	40 %	40 %	20 %	384213904
98	NC_017249	CTTGA	2	10	169005	169014	20 %	40 %	20 %	20 %	384213904
99	NC_017249	TGCGT	2	10	170575	170584	0 %	40 %	40 %	20 %	384213906
100	NC_017249	CGCCC	2	10	170729	170738	0 %	0 %	20 %	80 %	384213906
101	NC_017249	GCGCC	2	10	171396	171405	0 %	0 %	40 %	60 %	384213907
102	NC_017249	GAAGC	2	10	172829	172838	40 %	0 %	40 %	20 %	384213908
103	NC_017249	CGACA	2	10	173003	173012	40 %	0 %	20 %	40 %	384213908
104	NC_017249	CGCGA	2	10	174219	174228	20 %	0 %	40 %	40 %	384213909
105	NC_017249	GGTGA	2	10	177794	177803	20 %	20 %	60 %	0 %	384213913
106	NC_017249	GCGCG	2	10	181288	181297	0 %	0 %	60 %	40 %	384213915
107	NC_017249	CGTCA	2	10	181549	181558	20 %	20 %	20 %	40 %	384213916
108	NC_017249	TCGCC	2	10	182418	182427	0 %	20 %	20 %	60 %	384213916
109	NC_017249	GCGCT	2	10	182645	182654	0 %	20 %	40 %	40 %	384213916
110	NC_017249	CTGGT	2	10	182705	182714	0 %	40 %	40 %	20 %	384213916
111	NC_017249	GGCGA	2	10	183954	183963	20 %	0 %	60 %	20 %	384213918
112	NC_017249	CGGCG	3	15	186478	186492	0 %	0 %	60 %	40 %	384213920
113	NC_017249	ACGGC	2	10	188540	188549	20 %	0 %	40 %	40 %	384213922
114	NC_017249	CCGCG	2	10	191308	191317	0 %	0 %	40 %	60 %	384213925
115	NC_017249	CGGCG	2	10	193214	193223	0 %	0 %	60 %	40 %	384213927
116	NC_017249	CATCG	2	10	200708	200717	20 %	20 %	20 %	40 %	384213934
117	NC_017249	CAGGC	2	10	201198	201207	20 %	0 %	40 %	40 %	384213935
118	NC_017249	CGGCG	2	10	202585	202594	0 %	0 %	60 %	40 %	384213936
119	NC_017249	CAGGA	2	10	206842	206851	40 %	0 %	40 %	20 %	384213940
120	NC_017249	TCGCC	2	10	207510	207519	0 %	20 %	20 %	60 %	384213940
121	NC_017249	CCGAA	2	10	207561	207570	40 %	0 %	20 %	40 %	384213940
122	NC_017249	CCTGG	2	10	212423	212432	0 %	20 %	40 %	40 %	384213943
123	NC_017249	CGAGC	2	10	214813	214822	20 %	0 %	40 %	40 %	384213947
124	NC_017249	GCGCT	2	10	215024	215033	0 %	20 %	40 %	40 %	384213947
125	NC_017249	GGCCG	2	10	215590	215599	0 %	0 %	60 %	40 %	384213947
126	NC_017249	ACGCC	2	10	216197	216206	20 %	0 %	20 %	60 %	384213949
127	NC_017249	AGCCG	2	10	217730	217739	20 %	0 %	40 %	40 %	384213950
128	NC_017249	CCTGC	2	10	221397	221406	0 %	20 %	20 %	60 %	384213953
129	NC_017249	TCGCG	2	10	222705	222714	0 %	20 %	40 %	40 %	384213954
130	NC_017249	ATCCC	2	10	226096	226105	20 %	20 %	0 %	60 %	384213957
131	NC_017249	CGGCG	2	10	228086	228095	0 %	0 %	60 %	40 %	384213959
132	NC_017249	TCGCC	2	10	228233	228242	0 %	20 %	20 %	60 %	384213959
133	NC_017249	GCGCG	2	10	228255	228264	0 %	0 %	60 %	40 %	384213959
134	NC_017249	CACCG	2	10	229435	229444	20 %	0 %	20 %	60 %	384213960
135	NC_017249	GATCC	2	10	230346	230355	20 %	20 %	20 %	40 %	384213961
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138	NC_017249	GCGCG	2	10	231634	231643	0 %	0 %	60 %	40 %	384213963
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141	NC_017249	AGCGC	2	10	236508	236517	20 %	0 %	40 %	40 %	384213968
142	NC_017249	GCGCG	2	10	238124	238133	0 %	0 %	60 %	40 %	384213970
143	NC_017249	GCCGC	2	10	240281	240290	0 %	0 %	40 %	60 %	384213972
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147	NC_017249	CGCGG	2	10	251704	251713	0 %	0 %	60 %	40 %	384213983
148	NC_017249	GCAGC	2	10	253924	253933	20 %	0 %	40 %	40 %	384213985
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151	NC_017249	GCGAT	2	10	258464	258473	20 %	20 %	40 %	20 %	384213988
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155	NC_017249	CGCCC	2	10	262951	262960	0 %	0 %	20 %	80 %	384213993
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166	NC_017249	CCCAG	2	10	276529	276538	20 %	0 %	20 %	60 %	384214004
167	NC_017249	GCGAC	2	10	278299	278308	20 %	0 %	40 %	40 %	384214005
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173	NC_017249	GGCCG	2	10	283671	283680	0 %	0 %	60 %	40 %	384214009
174	NC_017249	ATGGC	2	10	285207	285216	20 %	20 %	40 %	20 %	384214010
175	NC_017249	TTCAG	2	10	285718	285727	20 %	40 %	20 %	20 %	384214010
176	NC_017249	TGCCG	2	10	288398	288407	0 %	20 %	40 %	40 %	384214012
177	NC_017249	CGCGC	2	10	289267	289276	0 %	0 %	40 %	60 %	384214013
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246	NC_017249	CGAAC	2	10	389607	389616	40 %	0 %	20 %	40 %	384214097
247	NC_017249	CATCG	2	10	389991	390000	20 %	20 %	20 %	40 %	384214098
248	NC_017249	TGCCC	2	10	390833	390842	0 %	20 %	20 %	60 %	384214098
249	NC_017249	GTCGC	2	10	391465	391474	0 %	20 %	40 %	40 %	384214099
250	NC_017249	GCCGC	2	10	398137	398146	0 %	0 %	40 %	60 %	384214104
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254	NC_017249	ACAGC	2	10	405554	405563	40 %	0 %	20 %	40 %	384214111
255	NC_017249	GCGTG	2	10	408086	408095	0 %	20 %	60 %	20 %	384214114
256	NC_017249	GACGG	2	10	408398	408407	20 %	0 %	60 %	20 %	384214114
257	NC_017249	GCCAC	2	10	410307	410316	20 %	0 %	20 %	60 %	384214115
258	NC_017249	CTCGC	2	10	413994	414003	0 %	20 %	20 %	60 %	384214118
259	NC_017249	CGCGC	2	10	415793	415802	0 %	0 %	40 %	60 %	384214121
260	NC_017249	CGGTC	2	10	417242	417251	0 %	20 %	40 %	40 %	384214122
261	NC_017249	GCTCG	2	10	417767	417776	0 %	20 %	40 %	40 %	384214122
262	NC_017249	GGACA	2	10	418300	418309	40 %	0 %	40 %	20 %	384214123
263	NC_017249	AAATC	2	10	420065	420074	60 %	20 %	0 %	20 %	384214124
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284	NC_017249	GAGGT	2	10	444372	444381	20 %	20 %	60 %	0 %	384214144
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294	NC_017249	GTCAG	2	10	451213	451222	20 %	20 %	40 %	20 %	384214151
295	NC_017249	CCGGC	2	10	453764	453773	0 %	0 %	40 %	60 %	384214153
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297	NC_017249	GCTTC	2	10	457874	457883	0 %	40 %	20 %	40 %	384214157
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334	NC_017249	GACCG	2	10	506331	506340	20 %	0 %	40 %	40 %	384214209
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341	NC_017249	GCGTC	2	10	516076	516085	0 %	20 %	40 %	40 %	384214217
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384	NC_017249	ACGGC	2	10	576364	576373	20 %	0 %	40 %	40 %	384214273
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387	NC_017249	GGCGA	2	10	578005	578014	20 %	0 %	60 %	20 %	384214274
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