MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 23721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017249	TTAA	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017249	GCCC	2	8	840	847	0 %	0 %	25 %	75 %	384213728
3	NC_017249	GAAT	2	8	882	889	50 %	25 %	25 %	0 %	384213728
4	NC_017249	TGCA	2	8	1067	1074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017249	GGCA	2	8	1222	1229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017249	GCCT	2	8	1384	1391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017249	CGAA	2	8	1448	1455	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017249	CTCC	2	8	1639	1646	0 %	25 %	0 %	75 %	384213729
9	NC_017249	CTCC	2	8	1931	1938	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_017249	CGTT	2	8	2056	2063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017249	CGTC	2	8	2548	2555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017249	CGAC	2	8	2776	2783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017249	GCTG	2	8	2974	2981	0 %	25 %	50 %	25 %	384213730
14	NC_017249	GGGC	2	8	3461	3468	0 %	0 %	75 %	25 %	384213731
15	NC_017249	GATC	2	8	3680	3687	25 %	25 %	25 %	25 %	384213731
16	NC_017249	TGGC	2	8	3917	3924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017249	GATC	2	8	6028	6035	25 %	25 %	25 %	25 %	384213733
18	NC_017249	CGGC	2	8	6225	6232	0 %	0 %	50 %	50 %	384213734
19	NC_017249	CGAG	2	8	6638	6645	25 %	0 %	50 %	25 %	384213734
20	NC_017249	TCCG	2	8	6820	6827	0 %	25 %	25 %	50 %	384213734
21	NC_017249	GGCG	2	8	7137	7144	0 %	0 %	75 %	25 %	384213734
22	NC_017249	CCGT	2	8	7388	7395	0 %	25 %	25 %	50 %	384213734
23	NC_017249	AAGC	2	8	7497	7504	50 %	0 %	25 %	25 %	384213734
24	NC_017249	CGAG	2	8	7539	7546	25 %	0 %	50 %	25 %	384213734
25	NC_017249	CGGT	2	8	7742	7749	0 %	25 %	50 %	25 %	384213734
26	NC_017249	CCCG	2	8	8072	8079	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_017249	CTCA	2	8	8355	8362	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017249	ATCG	2	8	8616	8623	25 %	25 %	25 %	25 %	384213735
29	NC_017249	CAAT	2	8	8931	8938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017249	CAGC	2	8	10027	10034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017249	ATTG	2	8	10385	10392	25 %	50 %	25 %	0 %	384213737
32	NC_017249	TCGC	2	8	10410	10417	0 %	25 %	25 %	50 %	384213737
33	NC_017249	ACTC	2	8	10609	10616	25 %	25 %	0 %	50 %	384213737
34	NC_017249	TAGG	2	8	10775	10782	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017249	GAGC	2	8	11173	11180	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017249	CGCT	2	8	11523	11530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017249	GGCC	2	8	11874	11881	0 %	0 %	50 %	50 %	384213739
38	NC_017249	GAAC	2	8	12430	12437	50 %	0 %	25 %	25 %	384213740
39	NC_017249	ATCG	2	8	12512	12519	25 %	25 %	25 %	25 %	384213740
40	NC_017249	TCGT	2	8	12745	12752	0 %	50 %	25 %	25 %	384213740
41	NC_017249	CAAC	2	8	12869	12876	50 %	0 %	0 %	50 %	384213741
42	NC_017249	AGTC	2	8	12925	12932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017249	TCGA	2	8	13213	13220	25 %	25 %	25 %	25 %	384213742
44	NC_017249	CTCC	2	8	13424	13431	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017249	CGCT	2	8	13666	13673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017249	TACG	2	8	13843	13850	25 %	25 %	25 %	25 %	384213743
47	NC_017249	ACCG	2	8	14052	14059	25 %	0 %	25 %	50 %	384213743
48	NC_017249	CAGC	2	8	14428	14435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017249	CACC	2	8	14483	14490	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_017249	GATT	2	8	16998	17005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017249	GACG	2	8	17209	17216	25 %	0 %	50 %	25 %	384213748
52	NC_017249	CCGG	2	8	17323	17330	0 %	0 %	50 %	50 %	384213748
53	NC_017249	CCGA	2	8	18147	18154	25 %	0 %	25 %	50 %	384213748
54	NC_017249	GGTC	2	8	18402	18409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017249	CAAT	2	8	18484	18491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017249	CCGT	2	8	18669	18676	0 %	25 %	25 %	50 %	384213749
57	NC_017249	GCCC	2	8	19057	19064	0 %	0 %	25 %	75 %	384213749
58	NC_017249	GATC	2	8	19752	19759	25 %	25 %	25 %	25 %	384213749
59	NC_017249	ATCG	2	8	20277	20284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017249	GCTC	2	8	20322	20329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017249	TTCT	2	8	20610	20617	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017249	GAAG	2	8	21297	21304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017249	GGCC	2	8	21989	21996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017249	CAAG	2	8	22122	22129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017249	GCCC	2	8	22223	22230	0 %	0 %	25 %	75 %	384213751
66	NC_017249	CGCA	2	8	22586	22593	25 %	0 %	25 %	50 %	384213751
67	NC_017249	GCTC	2	8	22801	22808	0 %	25 %	25 %	50 %	384213751
68	NC_017249	GCCG	2	8	22809	22816	0 %	0 %	50 %	50 %	384213751
69	NC_017249	ATCA	2	8	22856	22863	50 %	25 %	0 %	25 %	384213751
70	NC_017249	AGGC	2	8	23248	23255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017249	ACGA	2	8	23374	23381	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017249	TCAA	2	8	23385	23392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017249	GCAA	2	8	23855	23862	50 %	0 %	25 %	25 %	384213752
74	NC_017249	CGTC	2	8	24083	24090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017249	CTAG	2	8	24506	24513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017249	CGCC	2	8	25051	25058	0 %	0 %	25 %	75 %	384213753
77	NC_017249	TTGC	2	8	25455	25462	0 %	50 %	25 %	25 %	384213753
78	NC_017249	GGCG	2	8	25538	25545	0 %	0 %	75 %	25 %	384213753
79	NC_017249	CCAG	2	8	25672	25679	25 %	0 %	25 %	50 %	384213753
80	NC_017249	GCTT	2	8	25692	25699	0 %	50 %	25 %	25 %	384213753
81	NC_017249	ATTG	2	8	25807	25814	25 %	50 %	25 %	0 %	384213753
82	NC_017249	CGCC	2	8	26105	26112	0 %	0 %	25 %	75 %	384213753
83	NC_017249	CGAA	2	8	26195	26202	50 %	0 %	25 %	25 %	384213753
84	NC_017249	TCCG	2	8	26512	26519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017249	GGAT	2	8	26741	26748	25 %	25 %	50 %	0 %	384213755
86	NC_017249	CGAC	2	8	26865	26872	25 %	0 %	25 %	50 %	384213755
87	NC_017249	CCGC	2	8	26894	26901	0 %	0 %	25 %	75 %	384213755
88	NC_017249	CGCC	2	8	29641	29648	0 %	0 %	25 %	75 %	384213758
89	NC_017249	GGGC	2	8	30136	30143	0 %	0 %	75 %	25 %	384213759
90	NC_017249	GCCG	2	8	31992	31999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017249	ATTA	2	8	32188	32195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017249	TTCT	2	8	32366	32373	0 %	75 %	0 %	25 %	384213762
93	NC_017249	TGAC	2	8	32881	32888	25 %	25 %	25 %	25 %	384213763
94	NC_017249	TCGA	2	8	34112	34119	25 %	25 %	25 %	25 %	384213766
95	NC_017249	CGAT	2	8	34279	34286	25 %	25 %	25 %	25 %	384213766
96	NC_017249	GCCG	2	8	34927	34934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017249	GAGT	2	8	34976	34983	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017249	GGCG	2	8	35022	35029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017249	AAGG	2	8	35352	35359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017249	CGAG	2	8	35449	35456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017249	GGCC	2	8	35596	35603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017249	GGCT	2	8	35961	35968	0 %	25 %	50 %	25 %	384213768
103	NC_017249	ACGG	2	8	36173	36180	25 %	0 %	50 %	25 %	384213768
104	NC_017249	AGAT	2	8	36247	36254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017249	CTCG	2	8	36363	36370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017249	GCAT	2	8	36702	36709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017249	TCGT	2	8	36783	36790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017249	AGTC	2	8	36869	36876	25 %	25 %	25 %	25 %	384213769
109	NC_017249	TTGA	2	8	36918	36925	25 %	50 %	25 %	0 %	384213769
110	NC_017249	GAGG	2	8	37326	37333	25 %	0 %	75 %	0 %	384213770
111	NC_017249	TCGA	2	8	37458	37465	25 %	25 %	25 %	25 %	384213770
112	NC_017249	GGGC	2	8	37750	37757	0 %	0 %	75 %	25 %	384213770
113	NC_017249	GCCG	2	8	38039	38046	0 %	0 %	50 %	50 %	384213770
114	NC_017249	TCGC	2	8	38204	38211	0 %	25 %	25 %	50 %	384213770
115	NC_017249	CGTT	2	8	38323	38330	0 %	50 %	25 %	25 %	384213770
116	NC_017249	AGGC	2	8	39113	39120	25 %	0 %	50 %	25 %	384213770
117	NC_017249	TCAC	2	8	39319	39326	25 %	25 %	0 %	50 %	384213771
118	NC_017249	GCCG	2	8	39397	39404	0 %	0 %	50 %	50 %	384213771
119	NC_017249	TGCC	2	8	39508	39515	0 %	25 %	25 %	50 %	384213771
120	NC_017249	TCGA	2	8	39801	39808	25 %	25 %	25 %	25 %	384213771
121	NC_017249	CGAG	2	8	40360	40367	25 %	0 %	50 %	25 %	384213771
122	NC_017249	CCTT	2	8	40437	40444	0 %	50 %	0 %	50 %	384213771
123	NC_017249	CCCA	2	8	40541	40548	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_017249	ACAA	2	8	41170	41177	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017249	ACCG	2	8	41181	41188	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017249	TCGG	2	8	41223	41230	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017249	CTCC	2	8	41751	41758	0 %	25 %	0 %	75 %	384213772
128	NC_017249	TCGC	2	8	42143	42150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017249	TGCA	2	8	42433	42440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017249	CGTC	2	8	42856	42863	0 %	25 %	25 %	50 %	384213774
131	NC_017249	AGGT	2	8	43323	43330	25 %	25 %	50 %	0 %	384213774
132	NC_017249	GCAC	2	8	43616	43623	25 %	0 %	25 %	50 %	384213775
133	NC_017249	GAGC	2	8	44388	44395	25 %	0 %	50 %	25 %	384213777
134	NC_017249	TGCG	2	8	44526	44533	0 %	25 %	50 %	25 %	384213777
135	NC_017249	GATC	2	8	45302	45309	25 %	25 %	25 %	25 %	384213778
136	NC_017249	CGAT	2	8	45325	45332	25 %	25 %	25 %	25 %	384213778
137	NC_017249	GCCG	2	8	45536	45543	0 %	0 %	50 %	50 %	384213778
138	NC_017249	AACG	2	8	45816	45823	50 %	0 %	25 %	25 %	384213778
139	NC_017249	GCTT	2	8	45830	45837	0 %	50 %	25 %	25 %	384213778
140	NC_017249	CGCT	2	8	45838	45845	0 %	25 %	25 %	50 %	384213778
141	NC_017249	ACGT	2	8	46236	46243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017249	AACT	2	8	46297	46304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017249	GTCT	2	8	47129	47136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017249	CCAA	2	8	48509	48516	50 %	0 %	0 %	50 %	384213784
145	NC_017249	CCCG	2	8	48628	48635	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_017249	CGGG	2	8	48643	48650	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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