MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 19641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017249	GCCC	2	8	840	847	0 %	0 %	25 %	75 %	384213728
2	NC_017249	GAAT	2	8	882	889	50 %	25 %	25 %	0 %	384213728
3	NC_017249	CTCC	2	8	1639	1646	0 %	25 %	0 %	75 %	384213729
4	NC_017249	GCTG	2	8	2974	2981	0 %	25 %	50 %	25 %	384213730
5	NC_017249	GGGC	2	8	3461	3468	0 %	0 %	75 %	25 %	384213731
6	NC_017249	GATC	2	8	3680	3687	25 %	25 %	25 %	25 %	384213731
7	NC_017249	GATC	2	8	6028	6035	25 %	25 %	25 %	25 %	384213733
8	NC_017249	CGGC	2	8	6225	6232	0 %	0 %	50 %	50 %	384213734
9	NC_017249	CGAG	2	8	6638	6645	25 %	0 %	50 %	25 %	384213734
10	NC_017249	TCCG	2	8	6820	6827	0 %	25 %	25 %	50 %	384213734
11	NC_017249	GGCG	2	8	7137	7144	0 %	0 %	75 %	25 %	384213734
12	NC_017249	CCGT	2	8	7388	7395	0 %	25 %	25 %	50 %	384213734
13	NC_017249	AAGC	2	8	7497	7504	50 %	0 %	25 %	25 %	384213734
14	NC_017249	CGAG	2	8	7539	7546	25 %	0 %	50 %	25 %	384213734
15	NC_017249	CGGT	2	8	7742	7749	0 %	25 %	50 %	25 %	384213734
16	NC_017249	ATCG	2	8	8616	8623	25 %	25 %	25 %	25 %	384213735
17	NC_017249	ATTG	2	8	10385	10392	25 %	50 %	25 %	0 %	384213737
18	NC_017249	TCGC	2	8	10410	10417	0 %	25 %	25 %	50 %	384213737
19	NC_017249	ACTC	2	8	10609	10616	25 %	25 %	0 %	50 %	384213737
20	NC_017249	GGCC	2	8	11874	11881	0 %	0 %	50 %	50 %	384213739
21	NC_017249	GAAC	2	8	12430	12437	50 %	0 %	25 %	25 %	384213740
22	NC_017249	ATCG	2	8	12512	12519	25 %	25 %	25 %	25 %	384213740
23	NC_017249	TCGT	2	8	12745	12752	0 %	50 %	25 %	25 %	384213740
24	NC_017249	CAAC	2	8	12869	12876	50 %	0 %	0 %	50 %	384213741
25	NC_017249	TCGA	2	8	13213	13220	25 %	25 %	25 %	25 %	384213742
26	NC_017249	TACG	2	8	13843	13850	25 %	25 %	25 %	25 %	384213743
27	NC_017249	ACCG	2	8	14052	14059	25 %	0 %	25 %	50 %	384213743
28	NC_017249	GACG	2	8	17209	17216	25 %	0 %	50 %	25 %	384213748
29	NC_017249	CCGG	2	8	17323	17330	0 %	0 %	50 %	50 %	384213748
30	NC_017249	CCGA	2	8	18147	18154	25 %	0 %	25 %	50 %	384213748
31	NC_017249	CCGT	2	8	18669	18676	0 %	25 %	25 %	50 %	384213749
32	NC_017249	GCCC	2	8	19057	19064	0 %	0 %	25 %	75 %	384213749
33	NC_017249	GATC	2	8	19752	19759	25 %	25 %	25 %	25 %	384213749
34	NC_017249	GCCC	2	8	22223	22230	0 %	0 %	25 %	75 %	384213751
35	NC_017249	CGCA	2	8	22586	22593	25 %	0 %	25 %	50 %	384213751
36	NC_017249	GCTC	2	8	22801	22808	0 %	25 %	25 %	50 %	384213751
37	NC_017249	GCCG	2	8	22809	22816	0 %	0 %	50 %	50 %	384213751
38	NC_017249	ATCA	2	8	22856	22863	50 %	25 %	0 %	25 %	384213751
39	NC_017249	GCAA	2	8	23855	23862	50 %	0 %	25 %	25 %	384213752
40	NC_017249	CGCC	2	8	25051	25058	0 %	0 %	25 %	75 %	384213753
41	NC_017249	TTGC	2	8	25455	25462	0 %	50 %	25 %	25 %	384213753
42	NC_017249	GGCG	2	8	25538	25545	0 %	0 %	75 %	25 %	384213753
43	NC_017249	CCAG	2	8	25672	25679	25 %	0 %	25 %	50 %	384213753
44	NC_017249	GCTT	2	8	25692	25699	0 %	50 %	25 %	25 %	384213753
45	NC_017249	ATTG	2	8	25807	25814	25 %	50 %	25 %	0 %	384213753
46	NC_017249	CGCC	2	8	26105	26112	0 %	0 %	25 %	75 %	384213753
47	NC_017249	CGAA	2	8	26195	26202	50 %	0 %	25 %	25 %	384213753
48	NC_017249	GGAT	2	8	26741	26748	25 %	25 %	50 %	0 %	384213755
49	NC_017249	CGAC	2	8	26865	26872	25 %	0 %	25 %	50 %	384213755
50	NC_017249	CCGC	2	8	26894	26901	0 %	0 %	25 %	75 %	384213755
51	NC_017249	CGCC	2	8	29641	29648	0 %	0 %	25 %	75 %	384213758
52	NC_017249	GGGC	2	8	30136	30143	0 %	0 %	75 %	25 %	384213759
53	NC_017249	TTCT	2	8	32366	32373	0 %	75 %	0 %	25 %	384213762
54	NC_017249	TGAC	2	8	32881	32888	25 %	25 %	25 %	25 %	384213763
55	NC_017249	TCGA	2	8	34112	34119	25 %	25 %	25 %	25 %	384213766
56	NC_017249	CGAT	2	8	34279	34286	25 %	25 %	25 %	25 %	384213766
57	NC_017249	GGCT	2	8	35961	35968	0 %	25 %	50 %	25 %	384213768
58	NC_017249	ACGG	2	8	36173	36180	25 %	0 %	50 %	25 %	384213768
59	NC_017249	AGTC	2	8	36869	36876	25 %	25 %	25 %	25 %	384213769
60	NC_017249	TTGA	2	8	36918	36925	25 %	50 %	25 %	0 %	384213769
61	NC_017249	GAGG	2	8	37326	37333	25 %	0 %	75 %	0 %	384213770
62	NC_017249	TCGA	2	8	37458	37465	25 %	25 %	25 %	25 %	384213770
63	NC_017249	GGGC	2	8	37750	37757	0 %	0 %	75 %	25 %	384213770
64	NC_017249	GCCG	2	8	38039	38046	0 %	0 %	50 %	50 %	384213770
65	NC_017249	TCGC	2	8	38204	38211	0 %	25 %	25 %	50 %	384213770
66	NC_017249	CGTT	2	8	38323	38330	0 %	50 %	25 %	25 %	384213770
67	NC_017249	AGGC	2	8	39113	39120	25 %	0 %	50 %	25 %	384213770
68	NC_017249	TCAC	2	8	39319	39326	25 %	25 %	0 %	50 %	384213771
69	NC_017249	GCCG	2	8	39397	39404	0 %	0 %	50 %	50 %	384213771
70	NC_017249	TGCC	2	8	39508	39515	0 %	25 %	25 %	50 %	384213771
71	NC_017249	TCGA	2	8	39801	39808	25 %	25 %	25 %	25 %	384213771
72	NC_017249	CGAG	2	8	40360	40367	25 %	0 %	50 %	25 %	384213771
73	NC_017249	CCTT	2	8	40437	40444	0 %	50 %	0 %	50 %	384213771
74	NC_017249	CTCC	2	8	41751	41758	0 %	25 %	0 %	75 %	384213772
75	NC_017249	CGTC	2	8	42856	42863	0 %	25 %	25 %	50 %	384213774
76	NC_017249	AGGT	2	8	43323	43330	25 %	25 %	50 %	0 %	384213774
77	NC_017249	GCAC	2	8	43616	43623	25 %	0 %	25 %	50 %	384213775
78	NC_017249	GAGC	2	8	44388	44395	25 %	0 %	50 %	25 %	384213777
79	NC_017249	TGCG	2	8	44526	44533	0 %	25 %	50 %	25 %	384213777
80	NC_017249	GATC	2	8	45302	45309	25 %	25 %	25 %	25 %	384213778
81	NC_017249	CGAT	2	8	45325	45332	25 %	25 %	25 %	25 %	384213778
82	NC_017249	GCCG	2	8	45536	45543	0 %	0 %	50 %	50 %	384213778
83	NC_017249	AACG	2	8	45816	45823	50 %	0 %	25 %	25 %	384213778
84	NC_017249	GCTT	2	8	45830	45837	0 %	50 %	25 %	25 %	384213778
85	NC_017249	CGCT	2	8	45838	45845	0 %	25 %	25 %	50 %	384213778
86	NC_017249	CCAA	2	8	48509	48516	50 %	0 %	0 %	50 %	384213784
87	NC_017249	ATCC	2	8	49213	49220	25 %	25 %	0 %	50 %	384213786
88	NC_017249	CGGA	2	8	51245	51252	25 %	0 %	50 %	25 %	384213789
89	NC_017249	ATCG	2	8	51439	51446	25 %	25 %	25 %	25 %	384213789
90	NC_017249	CCGG	2	8	51475	51482	0 %	0 %	50 %	50 %	384213789
91	NC_017249	TTCA	2	8	52614	52621	25 %	50 %	0 %	25 %	384213791
92	NC_017249	GGTC	2	8	53870	53877	0 %	25 %	50 %	25 %	384213792
93	NC_017249	GCCA	2	8	54731	54738	25 %	0 %	25 %	50 %	384213793
94	NC_017249	TCGG	2	8	54786	54793	0 %	25 %	50 %	25 %	384213793
95	NC_017249	GCCG	2	8	55264	55271	0 %	0 %	50 %	50 %	384213793
96	NC_017249	GTTT	2	8	55437	55444	0 %	75 %	25 %	0 %	384213794
97	NC_017249	CGGT	2	8	55686	55693	0 %	25 %	50 %	25 %	384213794
98	NC_017249	GAGC	2	8	55749	55756	25 %	0 %	50 %	25 %	384213794
99	NC_017249	CGAC	2	8	56187	56194	25 %	0 %	25 %	50 %	384213794
100	NC_017249	CCGG	2	8	56391	56398	0 %	0 %	50 %	50 %	384213794
101	NC_017249	GCGA	2	8	57128	57135	25 %	0 %	50 %	25 %	384213794
102	NC_017249	GCCG	2	8	57234	57241	0 %	0 %	50 %	50 %	384213794
103	NC_017249	GACT	2	8	57386	57393	25 %	25 %	25 %	25 %	384213794
104	NC_017249	GCCG	2	8	58138	58145	0 %	0 %	50 %	50 %	384213795
105	NC_017249	AGCG	2	8	58466	58473	25 %	0 %	50 %	25 %	384213795
106	NC_017249	GCTC	2	8	58657	58664	0 %	25 %	25 %	50 %	384213795
107	NC_017249	AGCT	2	8	59944	59951	25 %	25 %	25 %	25 %	384213797
108	NC_017249	GCCG	2	8	62378	62385	0 %	0 %	50 %	50 %	384213800
109	NC_017249	GCAT	2	8	63381	63388	25 %	25 %	25 %	25 %	384213802
110	NC_017249	ACCG	2	8	63896	63903	25 %	0 %	25 %	50 %	384213802
111	NC_017249	GTTC	2	8	64132	64139	0 %	50 %	25 %	25 %	384213802
112	NC_017249	ATGC	2	8	64516	64523	25 %	25 %	25 %	25 %	384213803
113	NC_017249	AGCG	2	8	64639	64646	25 %	0 %	50 %	25 %	384213803
114	NC_017249	GATC	2	8	64928	64935	25 %	25 %	25 %	25 %	384213804
115	NC_017249	CAGC	2	8	65131	65138	25 %	0 %	25 %	50 %	384213804
116	NC_017249	GCCT	2	8	65189	65196	0 %	25 %	25 %	50 %	384213804
117	NC_017249	ATCG	2	8	65761	65768	25 %	25 %	25 %	25 %	384213804
118	NC_017249	CAAC	2	8	66178	66185	50 %	0 %	0 %	50 %	384213805
119	NC_017249	CCGT	2	8	66209	66216	0 %	25 %	25 %	50 %	384213805
120	NC_017249	GCTT	2	8	66459	66466	0 %	50 %	25 %	25 %	384213805
121	NC_017249	CGAT	2	8	67579	67586	25 %	25 %	25 %	25 %	384213806
122	NC_017249	ATCC	2	8	67743	67750	25 %	25 %	0 %	50 %	384213806
123	NC_017249	TCCC	2	8	70629	70636	0 %	25 %	0 %	75 %	384213808
124	NC_017249	AGCG	2	8	72032	72039	25 %	0 %	50 %	25 %	384213809
125	NC_017249	CGAG	2	8	72473	72480	25 %	0 %	50 %	25 %	384213809
126	NC_017249	GCAG	2	8	72662	72669	25 %	0 %	50 %	25 %	384213809
127	NC_017249	CGAC	2	8	73299	73306	25 %	0 %	25 %	50 %	384213810
128	NC_017249	AGAC	2	8	73327	73334	50 %	0 %	25 %	25 %	384213810
129	NC_017249	GAAG	2	8	74323	74330	50 %	0 %	50 %	0 %	384213811
130	NC_017249	CGAG	2	8	74972	74979	25 %	0 %	50 %	25 %	384213812
131	NC_017249	CCGC	2	8	77026	77033	0 %	0 %	25 %	75 %	384213814
132	NC_017249	GGTT	2	8	77281	77288	0 %	50 %	50 %	0 %	384213814
133	NC_017249	CCGA	2	8	77298	77305	25 %	0 %	25 %	50 %	384213814
134	NC_017249	GATC	2	8	77513	77520	25 %	25 %	25 %	25 %	384213815
135	NC_017249	GATC	2	8	78006	78013	25 %	25 %	25 %	25 %	384213816
136	NC_017249	CGGC	2	8	78039	78046	0 %	0 %	50 %	50 %	384213816
137	NC_017249	GATC	2	8	78219	78226	25 %	25 %	25 %	25 %	384213816
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