MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 17848

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017249	GCG	2	6	56	61	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017249	CTT	2	6	71	76	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017249	TCC	2	6	440	445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017249	TGC	2	6	1049	1054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017249	GGC	2	6	1089	1094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017249	GGA	2	6	1150	1155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017249	CGG	2	6	1170	1175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017249	TTC	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017249	GGT	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017249	GCT	3	9	1406	1414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017249	ATG	2	6	1419	1424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017249	CGG	2	6	1428	1433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017249	CGT	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017249	GCA	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017249	GGC	2	6	1956	1961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017249	CAG	2	6	2012	2017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017249	ATC	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017249	GAC	2	6	2206	2211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017249	GCA	2	6	2425	2430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017249	GCG	2	6	2456	2461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017249	CGA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017249	AGC	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017249	CGG	2	6	2760	2765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017249	GGC	2	6	2818	2823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017249	TCG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017249	AGA	2	6	2931	2936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017249	CTT	2	6	3782	3787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017249	TGC	2	6	3887	3892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017249	ATG	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017249	CGT	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017249	GCA	2	6	4083	4088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017249	CGA	2	6	4205	4210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017249	GCG	2	6	4220	4225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017249	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017249	TCG	2	6	4274	4279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017249	GGT	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017249	GCC	2	6	4781	4786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017249	CAA	2	6	4819	4824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017249	GAG	2	6	4873	4878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017249	CGA	2	6	4917	4922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017249	GAC	2	6	8015	8020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017249	CCA	2	6	8210	8215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017249	AGC	2	6	8304	8309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017249	GCC	2	6	8747	8752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017249	TTC	2	6	9589	9594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017249	AGG	2	6	9640	9645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017249	GAA	2	6	9962	9967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017249	ATC	2	6	10071	10076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017249	CGT	2	6	10153	10158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017249	GTA	2	6	10207	10212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017249	TGT	2	6	10235	10240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017249	CAT	2	6	10270	10275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017249	CGC	2	6	10276	10281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017249	ACG	2	6	10322	10327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017249	GCC	2	6	10330	10335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017249	GAA	2	6	10872	10877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017249	CCA	2	6	10884	10889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017249	GCG	2	6	11101	11106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017249	CGT	2	6	11122	11127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017249	TCA	2	6	11157	11162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017249	CGA	3	9	11242	11250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017249	TGG	2	6	11263	11268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017249	GCT	2	6	11296	11301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017249	CGC	2	6	11302	11307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017249	TCG	2	6	11420	11425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017249	CGA	2	6	11439	11444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017249	CTG	2	6	11470	11475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017249	AGG	2	6	11641	11646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017249	GCC	2	6	11759	11764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017249	TGG	2	6	12169	12174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017249	GGC	2	6	12271	12276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017249	GAA	2	6	12956	12961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017249	GCA	2	6	12976	12981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017249	GCG	2	6	13046	13051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017249	CGG	2	6	13056	13061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017249	AAC	2	6	13463	13468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017249	GTG	2	6	13476	13481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017249	CGA	2	6	13566	13571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017249	TCC	2	6	13586	13591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017249	TGG	2	6	13624	13629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017249	TCA	2	6	14599	14604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017249	GCG	2	6	14700	14705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017249	TGC	2	6	14714	14719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017249	CGA	2	6	15872	15877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017249	GTC	2	6	15882	15887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017249	AAC	2	6	15992	15997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017249	AGG	2	6	16046	16051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017249	TGT	2	6	16115	16120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017249	GAA	2	6	16649	16654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017249	AGC	2	6	16736	16741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017249	GTC	2	6	16766	16771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017249	CGT	2	6	16774	16779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017249	GTA	2	6	16925	16930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017249	CGA	2	6	17049	17054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017249	GCC	2	6	17078	17083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017249	TGC	2	6	18368	18373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017249	GCG	2	6	20205	20210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017249	ATG	2	6	20269	20274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017249	GGC	2	6	20354	20359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017249	GAT	2	6	20425	20430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017249	AGA	2	6	20435	20440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017249	CCA	2	6	20455	20460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017249	CAG	2	6	20521	20526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017249	TAC	2	6	20546	20551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017249	CTG	2	6	20578	20583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017249	GGT	2	6	20630	20635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017249	GCC	2	6	20703	20708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017249	GAT	2	6	20894	20899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017249	AGC	2	6	20987	20992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017249	CGG	2	6	21069	21074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017249	GCT	2	6	21170	21175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017249	CGA	2	6	21184	21189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017249	TGG	2	6	21226	21231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017249	CCT	2	6	21327	21332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017249	CGG	2	6	21366	21371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017249	TAG	2	6	21866	21871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017249	CGT	2	6	21892	21897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017249	TCG	2	6	22051	22056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017249	GCT	2	6	23091	23096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017249	GTT	2	6	23097	23102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017249	CCG	2	6	23117	23122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017249	TGT	2	6	23158	23163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017249	TCG	2	6	23259	23264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017249	GCG	2	6	23294	23299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017249	GAG	2	6	23414	23419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017249	CAT	2	6	23496	23501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017249	ACG	2	6	23557	23562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017249	CAG	3	9	23570	23578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017249	TCG	2	6	23665	23670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017249	TGA	2	6	24044	24049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017249	CTT	2	6	24099	24104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017249	CTC	2	6	24117	24122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017249	CGC	2	6	24224	24229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017249	AAC	2	6	24238	24243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017249	TTC	2	6	24268	24273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017249	GAC	2	6	24277	24282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017249	AGG	2	6	24285	24290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017249	CCG	2	6	24399	24404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017249	GCC	2	6	24439	24444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017249	ACC	2	6	26243	26248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017249	CAC	2	6	27411	27416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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143	NC_017249	CCG	2	6	27542	27547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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148	NC_017249	CCG	2	6	28201	28206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017249	GCA	2	6	28234	28239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_017249	CAA	2	6	32537	32542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_017249	GAC	2	6	34984	34989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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412	NC_017249	CGA	2	6	128791	128796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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