MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 140332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017249	GCC	2	6	241	246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213727
2	NC_017249	TCT	2	6	250	255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213727
3	NC_017249	GTC	2	6	303	308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213727
4	NC_017249	GCT	2	6	322	327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213727
5	NC_017249	GCG	2	6	373	378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213727
6	NC_017249	GAT	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213728
7	NC_017249	AGC	2	6	611	616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213728
8	NC_017249	CGC	2	6	666	671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213728
9	NC_017249	AGT	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213728
10	NC_017249	GCC	2	6	934	939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213728
11	NC_017249	GCT	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213728
12	NC_017249	ATG	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213729
13	NC_017249	GTG	2	6	1672	1677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213729
14	NC_017249	CGG	2	6	3033	3038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213730
15	NC_017249	CGG	2	6	3099	3104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213730
16	NC_017249	GTC	2	6	3109	3114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213730
17	NC_017249	CAT	2	6	3139	3144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213730
18	NC_017249	TGC	2	6	3344	3349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213731
19	NC_017249	GTC	2	6	3373	3378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213731
20	NC_017249	GGC	2	6	3448	3453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213731
21	NC_017249	ACC	2	6	3515	3520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213731
22	NC_017249	GTC	2	6	3530	3535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213731
23	NC_017249	GTA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213732
24	NC_017249	CGA	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213732
25	NC_017249	GAA	2	6	4534	4539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213732
26	NC_017249	ATC	2	6	4669	4674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213732
27	NC_017249	CGC	2	6	5027	5032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213733
28	NC_017249	GAA	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213733
29	NC_017249	CGA	2	6	5095	5100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213733
30	NC_017249	CCT	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213733
31	NC_017249	GAA	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213733
32	NC_017249	GCA	2	6	5236	5241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213733
33	NC_017249	CGA	2	6	5275	5280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213733
34	NC_017249	TCC	2	6	5286	5291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213733
35	NC_017249	GTC	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213733
36	NC_017249	TGA	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213733
37	NC_017249	TCG	2	6	5409	5414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213733
38	NC_017249	TGT	2	6	5455	5460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213733
39	NC_017249	AGC	2	6	5475	5480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213733
40	NC_017249	CAT	3	9	5711	5719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213733
41	NC_017249	GAA	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213733
42	NC_017249	AGC	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213733
43	NC_017249	CCT	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213733
44	NC_017249	CTG	3	9	5906	5914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213733
45	NC_017249	CGT	2	6	5953	5958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213733
46	NC_017249	AGG	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213733
47	NC_017249	CTC	2	6	6052	6057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213734
48	NC_017249	GCT	2	6	6081	6086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213734
49	NC_017249	CGC	2	6	6124	6129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213734
50	NC_017249	AGT	2	6	6153	6158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213734
51	NC_017249	GCA	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213734
52	NC_017249	CGG	2	6	6279	6284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213734
53	NC_017249	CGA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213734
54	NC_017249	CGT	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213734
55	NC_017249	GAT	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213734
56	NC_017249	GAT	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213734
57	NC_017249	CGC	2	6	6600	6605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213734
58	NC_017249	GCG	2	6	6656	6661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213734
59	NC_017249	GCG	2	6	6797	6802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213734
60	NC_017249	TGA	2	6	6837	6842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213734
61	NC_017249	CTC	2	6	6895	6900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213734
62	NC_017249	CGA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213734
63	NC_017249	GCA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213734
64	NC_017249	CTC	2	6	6958	6963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213734
65	NC_017249	GAT	2	6	6969	6974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213734
66	NC_017249	GAC	2	6	7156	7161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213734
67	NC_017249	TCG	2	6	7223	7228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213734
68	NC_017249	CTC	2	6	7303	7308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213734
69	NC_017249	TGG	2	6	7319	7324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213734
70	NC_017249	CCG	3	9	7338	7346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213734
71	NC_017249	GAT	2	6	7411	7416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213734
72	NC_017249	CGC	2	6	7428	7433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213734
73	NC_017249	GCC	3	9	7483	7491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213734
74	NC_017249	CGA	2	6	7527	7532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213734
75	NC_017249	GCC	2	6	7594	7599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213734
76	NC_017249	CAT	2	6	7647	7652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213734
77	NC_017249	CAG	2	6	7774	7779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213734
78	NC_017249	GTC	2	6	7780	7785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213734
79	NC_017249	CGA	2	6	8419	8424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213735
80	NC_017249	GCG	2	6	8445	8450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213735
81	NC_017249	CGA	2	6	8509	8514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213735
82	NC_017249	CGG	2	6	8989	8994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213736
83	NC_017249	GCG	3	9	9042	9050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213736
84	NC_017249	CAA	2	6	9138	9143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213736
85	NC_017249	TCA	2	6	9177	9182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213736
86	NC_017249	CCG	2	6	9277	9282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213736
87	NC_017249	CCT	2	6	9345	9350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213736
88	NC_017249	TGC	2	6	9356	9361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213736
89	NC_017249	AAC	2	6	10348	10353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213737
90	NC_017249	TCG	2	6	10463	10468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213737
91	NC_017249	CCG	2	6	10494	10499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213737
92	NC_017249	CAG	2	6	10524	10529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213737
93	NC_017249	GTG	2	6	10684	10689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213737
94	NC_017249	TGT	2	6	10695	10700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213737
95	NC_017249	GTC	2	6	10725	10730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213737
96	NC_017249	GCA	2	6	10734	10739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213737
97	NC_017249	CCG	2	6	10911	10916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213738
98	NC_017249	CGG	2	6	10960	10965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213738
99	NC_017249	CGG	2	6	10967	10972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213738
100	NC_017249	TGA	2	6	10975	10980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213738
101	NC_017249	CGC	2	6	11011	11016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213738
102	NC_017249	GGT	2	6	11035	11040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213738
103	NC_017249	AAG	2	6	11066	11071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213738
104	NC_017249	ACC	2	6	11942	11947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213739
105	NC_017249	GAA	2	6	11979	11984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213739
106	NC_017249	GCG	2	6	12047	12052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213739
107	NC_017249	TTC	2	6	12069	12074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213739
108	NC_017249	CTC	2	6	12363	12368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213740
109	NC_017249	TTG	2	6	12402	12407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213740
110	NC_017249	GCG	2	6	12421	12426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213740
111	NC_017249	GTT	2	6	12478	12483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213740
112	NC_017249	ATC	2	6	12599	12604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213740
113	NC_017249	TCA	2	6	12612	12617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213740
114	NC_017249	CGA	2	6	12640	12645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213740
115	NC_017249	GGC	2	6	12674	12679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213740
116	NC_017249	GAG	2	6	12700	12705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213740
117	NC_017249	CGG	2	6	12727	12732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213740
118	NC_017249	CAT	2	6	12779	12784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213740
119	NC_017249	CGC	2	6	12785	12790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213740
120	NC_017249	GCA	2	6	13120	13125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213742
121	NC_017249	AGC	3	9	13147	13155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213742
122	NC_017249	CGG	2	6	13185	13190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213742
123	NC_017249	TCG	2	6	13308	13313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213742
124	NC_017249	CTT	2	6	13400	13405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213742
125	NC_017249	GCC	2	6	13679	13684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213743
126	NC_017249	GTT	2	6	13696	13701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213743
127	NC_017249	CGA	2	6	13731	13736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213743
128	NC_017249	CGT	2	6	13829	13834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213743
129	NC_017249	CTT	2	6	13931	13936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213743
130	NC_017249	TGA	2	6	14029	14034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213743
131	NC_017249	GTC	2	6	14039	14044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213743
132	NC_017249	CAC	2	6	14077	14082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213744
133	NC_017249	TCC	2	6	14111	14116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213744
134	NC_017249	CCG	2	6	14210	14215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213744
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139	NC_017249	GCC	2	6	14891	14896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213745
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141	NC_017249	GAT	2	6	15036	15041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213745
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145	NC_017249	TGC	2	6	15215	15220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213746
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151	NC_017249	TCG	2	6	15443	15448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213746
152	NC_017249	GGC	2	6	15498	15503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213746
153	NC_017249	AGG	2	6	15524	15529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213746
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159	NC_017249	GGA	2	6	16430	16435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213747
160	NC_017249	ACG	2	6	16452	16457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213747
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163	NC_017249	GCG	2	6	17234	17239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213748
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230	NC_017249	GAT	2	6	23891	23896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213752
231	NC_017249	CGA	2	6	23932	23937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213752
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235	NC_017249	GAG	2	6	24914	24919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213753
236	NC_017249	CGT	2	6	24959	24964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213753
237	NC_017249	GAA	2	6	25070	25075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213753
238	NC_017249	CAT	2	6	25091	25096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213753
239	NC_017249	GGC	2	6	25112	25117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213753
240	NC_017249	GCG	2	6	25122	25127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213753
241	NC_017249	CGA	2	6	25237	25242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213753
242	NC_017249	GAC	3	9	25259	25267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213753
243	NC_017249	CCT	2	6	25353	25358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213753
244	NC_017249	TCG	2	6	25438	25443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213753
245	NC_017249	CGC	2	6	25521	25526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213753
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247	NC_017249	TCG	2	6	25632	25637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213753
248	NC_017249	AAT	2	6	25643	25648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384213753
249	NC_017249	GCC	2	6	25850	25855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213753
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251	NC_017249	TTC	2	6	25910	25915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213753
252	NC_017249	GAA	2	6	25958	25963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213753
253	NC_017249	TCG	2	6	25980	25985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213753
254	NC_017249	ATC	2	6	26129	26134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213753
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499	NC_017249	TCG	2	6	48488	48493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213784
500	NC_017249	TCG	2	6	48769	48774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213785

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