MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis M5-90 chromosome chromosome II

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017247	ATTTC	2	10	1583	1592	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017247	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017247	GCCGA	2	10	15121	15130	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017247	AGCGG	2	10	22146	22155	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017247	GGCCT	2	10	37538	37547	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017247	ATGAA	2	10	40109	40118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017247	TTTGT	2	10	41270	41279	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017247	CGCTC	2	10	43479	43488	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017247	TGAAA	2	10	44335	44344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017247	TGCGG	2	10	60821	60830	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017247	TATCT	2	10	73058	73067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017247	TCGGT	2	10	81733	81742	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017247	TTCTC	2	10	81762	81771	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017247	ACTTG	2	10	87291	87300	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017247	CGGTA	2	10	97157	97166	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017247	CCAAG	2	10	97332	97341	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017247	TGCTG	2	10	100506	100515	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017247	CTTGC	2	10	107990	107999	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017247	CCTGC	2	10	112664	112673	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017247	GCCCG	2	10	115912	115921	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_017247	GCACA	2	10	117203	117212	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017247	GTTCG	2	10	117224	117233	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017247	GAAAA	2	10	119156	119165	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017247	AATCA	2	10	129088	129097	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017247	AGATA	2	10	134500	134509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017247	CCGGG	2	10	152288	152297	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017247	CGGAT	2	10	159391	159400	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017247	TGTTT	2	10	159975	159984	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017247	CCCGT	2	10	160700	160709	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017247	GGATA	2	10	187726	187735	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017247	TGACG	2	10	191473	191482	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017247	AGCAG	2	10	203273	203282	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017247	TTTTG	2	10	208855	208864	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017247	ATCAA	2	10	209023	209032	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017247	TGAAA	2	10	209033	209042	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017247	TAAGT	2	10	214150	214159	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017247	GTCAA	2	10	235622	235631	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017247	GGCGG	2	10	287931	287940	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017247	GCTTT	2	10	304468	304477	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017247	GGTGG	2	10	339831	339840	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017247	TTTGT	2	10	346501	346510	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017247	GGCCG	2	10	350517	350526	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017247	TGAAA	2	10	365996	366005	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017247	TGGAG	2	10	390011	390020	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017247	TCATA	2	10	391102	391111	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017247	AGCAA	2	10	397458	397467	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017247	CGGAA	2	10	424151	424160	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017247	GCGCC	2	10	429203	429212	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_017247	ATCCC	2	10	436633	436642	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_017247	AAAGC	2	10	456463	456472	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017247	TGAGA	2	10	481529	481538	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017247	CAGGC	2	10	481755	481764	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_017247	ACTGG	2	10	483348	483357	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017247	GTCTT	2	10	488186	488195	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017247	CGGCC	2	10	492361	492370	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_017247	ATTCG	2	10	502179	502188	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017247	TCGCA	2	10	512058	512067	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017247	TCATT	2	10	519728	519737	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017247	AGCGG	2	10	553130	553139	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017247	ACAAA	2	10	555436	555445	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017247	GTCTC	2	10	559666	559675	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017247	ACAAA	2	10	578915	578924	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017247	TTTGC	2	10	579376	579385	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017247	GCAGA	2	10	586097	586106	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017247	GCCTT	2	10	587545	587554	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017247	GTTTT	2	10	597017	597026	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017247	ACAAA	2	10	609251	609260	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017247	TCGCT	2	10	615768	615777	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017247	GCGCC	2	10	624598	624607	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_017247	ACAAA	2	10	651329	651338	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017247	CGGGG	2	10	653459	653468	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017247	TAATC	2	10	682780	682789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017247	TTACG	2	10	688089	688098	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017247	TCAGG	2	10	699350	699359	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017247	CCGTG	2	10	717851	717860	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017247	ATTAT	2	10	733178	733187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017247	TCAAA	2	10	757710	757719	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017247	ACAAA	2	10	761184	761193	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017247	GATCG	2	10	769848	769857	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017247	TCCCC	2	10	769974	769983	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
81	NC_017247	TCCCC	2	10	771594	771603	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
82	NC_017247	GCAAT	2	10	772722	772731	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017247	CATTC	2	10	784021	784030	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017247	GCAGT	2	10	800087	800096	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017247	GATCA	2	10	842128	842137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017247	CAATT	2	10	848098	848107	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017247	CGTAT	2	10	848109	848118	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017247	GAAAA	2	10	853283	853292	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017247	GGTTT	2	10	861233	861242	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017247	CCCTC	2	10	890251	890260	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
91	NC_017247	ACAAA	2	10	900981	900990	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017247	GGTGG	2	10	929429	929438	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017247	CATGG	2	10	933197	933206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017247	CCGGG	4	20	933207	933226	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017247	GCCTC	2	10	933266	933275	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_017247	GCCTG	2	10	933758	933767	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017247	TTCAG	2	10	941354	941363	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017247	ATGCC	2	10	941366	941375	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017247	GGAAC	2	10	942780	942789	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017247	AGGCC	2	10	947951	947960	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017247	CCCTA	2	10	948809	948818	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
102	NC_017247	CCCTT	2	10	952572	952581	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
103	NC_017247	CCCCG	2	10	968290	968299	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
104	NC_017247	TAAAA	2	10	972334	972343	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017247	TCCCC	2	10	988306	988315	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
106	NC_017247	CATTG	2	10	990995	991004	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017247	AGCGA	2	10	1003101	1003110	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017247	CGCTT	2	10	1012942	1012951	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017247	TGCGC	2	10	1016653	1016662	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017247	TGTCA	2	10	1020206	1020215	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017247	CGCCT	2	10	1032282	1032291	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_017247	ATTAA	2	10	1033690	1033699	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017247	CTTTC	2	10	1036383	1036392	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017247	AATAG	2	10	1042949	1042958	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017247	TCAAC	2	10	1064871	1064880	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017247	GAAAA	2	10	1071119	1071128	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017247	TGCGG	2	10	1075291	1075300	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017247	CATAT	2	10	1080973	1080982	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017247	CGGTT	2	10	1081063	1081072	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017247	TTCAA	2	10	1083957	1083966	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017247	CCTCT	2	10	1083975	1083984	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_017247	GCTGT	2	10	1085586	1085595	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017247	CGAAG	2	10	1086399	1086408	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017247	AGCCC	2	10	1086953	1086962	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_017247	CACGA	2	10	1087098	1087107	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017247	TTATT	2	10	1092896	1092905	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017247	TTCTG	2	10	1129100	1129109	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017247	CAGGC	2	10	1132320	1132329	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017247	GGAAG	2	10	1161251	1161260	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017247	TGATT	2	10	1172738	1172747	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017247	AAAGC	2	10	1172762	1172771	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017247	GCTTT	2	10	1172777	1172786	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017247	ACGGC	2	10	1173048	1173057	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.