MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis M5-90 chromosome chromosome I

Total Repeats: 280

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017246	CCAGT	2	10	15669	15678	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017246	CATGC	2	10	28342	28351	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017246	CGAAA	2	10	28540	28549	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017246	CGGAG	2	10	31518	31527	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017246	AAAGC	2	10	36222	36231	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017246	CCGTG	2	10	40673	40682	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017246	TAAAG	2	10	50819	50828	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017246	TGAAA	2	10	51936	51945	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017246	CAAGA	2	10	66493	66502	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017246	CGGAG	2	10	72768	72777	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017246	TCGAT	2	10	89218	89227	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017246	TTCCA	2	10	95492	95501	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017246	CGGTT	2	10	95864	95873	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017246	GAACC	2	10	95916	95925	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017246	GCACC	2	10	106791	106800	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_017246	TTTGT	2	10	107284	107293	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017246	ATGGA	2	10	122831	122840	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017246	TGCGA	2	10	150812	150821	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017246	CGGAG	2	10	165768	165777	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017246	ACAAA	2	10	165835	165844	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017246	CTGCC	2	10	170398	170407	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_017246	TGAAA	2	10	171770	171779	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017246	CGTGT	2	10	172667	172676	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017246	TTTTA	2	10	174475	174484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017246	AAATC	2	10	179820	179829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017246	AAAGC	2	10	196353	196362	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017246	ATGTC	2	10	201308	201317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017246	TTTCG	2	10	216983	216992	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017246	TCAGG	2	10	220160	220169	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017246	CTTGG	2	10	228204	228213	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017246	GGCAG	2	10	233582	233591	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017246	ATAGA	2	10	260781	260790	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017246	GCCCA	2	10	261707	261716	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_017246	ATTCT	2	10	270909	270918	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017246	TGCGC	2	10	271471	271480	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017246	CAACC	2	10	272264	272273	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
37	NC_017246	CGGCG	2	10	272627	272636	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017246	TCTGT	2	10	278127	278136	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017246	AAATC	2	10	279669	279678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017246	AAGGG	2	10	279699	279708	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017246	ATTCT	2	10	310242	310251	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017246	TGGCT	2	10	326786	326795	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017246	AAAAG	2	10	332759	332768	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017246	GTTTC	2	10	342681	342690	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017246	CAGCT	2	10	348292	348301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017246	TCTTT	2	10	352113	352122	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017246	GATTT	2	10	355862	355871	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017246	CGTGG	2	10	368544	368553	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017246	CCAAG	2	10	370624	370633	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017246	ATAAA	2	10	370672	370681	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017246	CAGGA	2	10	407165	407174	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017246	GCCTG	2	10	407297	407306	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_017246	GCCTG	2	10	407546	407555	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017246	ACGCG	2	10	407560	407569	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017246	CCGGC	2	10	407580	407589	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_017246	ACAAA	2	10	411383	411392	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017246	CGAAA	2	10	424829	424838	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017246	CCGGG	2	10	425923	425932	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017246	ACAAA	2	10	426134	426143	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017246	GAAAA	2	10	434045	434054	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017246	AGGCT	2	10	442786	442795	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017246	GGGTT	2	10	448599	448608	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017246	AATGT	2	10	448676	448685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017246	AAAAG	2	10	453249	453258	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017246	ACCGC	2	10	454379	454388	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_017246	GTTTT	2	10	454400	454409	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017246	AACGC	2	10	472241	472250	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017246	CAGGG	2	10	476888	476897	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017246	CGGCA	2	10	489330	489339	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017246	AGGGC	2	10	496661	496670	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017246	TGCCG	2	10	496722	496731	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017246	CGGAA	2	10	505173	505182	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017246	TTTTA	2	10	505886	505895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017246	ACAGG	2	10	514751	514760	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017246	CCGCA	2	10	536725	536734	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_017246	TGAAT	2	10	537526	537535	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017246	CTGCG	2	10	539225	539234	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017246	TGCCA	2	10	542355	542364	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017246	TCGAC	2	10	543130	543139	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017246	TGCGA	2	10	545151	545160	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017246	TCGAC	2	10	548661	548670	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017246	AGTTT	2	10	567001	567010	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017246	ATAGT	2	10	567128	567137	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017246	ACTGA	2	10	585664	585673	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017246	TGGGC	2	10	590173	590182	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017246	ATCAG	2	10	594679	594688	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017246	TAAAA	2	10	638646	638655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017246	GAACG	2	10	645404	645413	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017246	ACCGG	2	10	647127	647136	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_017246	TTTGC	2	10	649686	649695	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017246	GGGGC	2	10	657816	657825	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017246	GCAAG	2	10	682171	682180	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017246	CCGAT	2	10	709860	709869	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017246	ACAAA	2	10	715319	715328	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017246	AAGAT	2	10	722612	722621	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017246	CAAAG	2	10	723182	723191	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017246	TCTTT	2	10	725945	725954	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017246	TGCGA	2	10	728749	728758	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017246	GGCGT	2	10	731106	731115	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017246	CTGAA	2	10	736145	736154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017246	CATGC	2	10	753238	753247	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017246	ACAAA	2	10	764534	764543	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017246	CAAGA	2	10	764562	764571	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017246	ATGCC	2	10	771329	771338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017246	TTTGT	2	10	782177	782186	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017246	ACAAA	2	10	784064	784073	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017246	CTTGT	2	10	789344	789353	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017246	CTTGA	2	10	793657	793666	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017246	GCCGG	2	10	796016	796025	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017246	TTCCA	2	10	800567	800576	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017246	ATGCC	2	10	800859	800868	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017246	ATTGG	2	10	809845	809854	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017246	GTAAA	2	10	830767	830776	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017246	TGAAG	2	10	841669	841678	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017246	AGCGA	2	10	844309	844318	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017246	GGCAG	2	10	852608	852617	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017246	GCGCG	2	10	852658	852667	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017246	GAGCT	2	10	865067	865076	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017246	GGGCA	2	10	866843	866852	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017246	GACAG	2	10	869684	869693	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017246	GACAG	2	10	933470	933479	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017246	GGTGC	2	10	940173	940182	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017246	CATCT	2	10	946777	946786	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017246	TTGCC	2	10	948215	948224	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017246	GCAGG	2	10	956072	956081	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017246	GGGCC	2	10	957809	957818	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017246	TGCTT	2	10	957893	957902	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017246	CAAGC	2	10	959804	959813	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017246	TTCCT	2	10	962836	962845	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017246	CGCTG	2	10	962871	962880	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017246	TTGCG	2	10	999487	999496	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017246	TGCAG	2	10	999507	999516	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017246	AAATA	2	10	1004879	1004888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017246	ATGAA	2	10	1014707	1014716	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017246	ACAAA	2	10	1016571	1016580	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017246	ACAAA	2	10	1021473	1021482	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017246	TTTTA	2	10	1034806	1034815	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017246	CGTGG	2	10	1035474	1035483	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017246	AGGGC	2	10	1041635	1041644	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017246	AAAAG	2	10	1045989	1045998	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017246	AAAAT	2	10	1046172	1046181	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017246	ACGAA	2	10	1065907	1065916	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017246	CTCAT	2	10	1069236	1069245	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017246	AAGAA	2	10	1069427	1069436	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017246	GCACA	2	10	1074460	1074469	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017246	GTTTT	2	10	1075563	1075572	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_017246	GTTTG	2	10	2090238	2090247	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_017246	CCCGG	2	10	2109633	2109642	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
277	NC_017246	ACCCG	2	10	2110021	2110030	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
278	NC_017246	CGGAT	2	10	2110046	2110055	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
279	NC_017246	GGCTT	2	10	2120607	2120616	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
280	NC_017246	GGATG	2	10	2125690	2125699	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.