MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis M28 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017245	ATTTC	2	10	1583	1592	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017245	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017245	GCCGA	2	10	15121	15130	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017245	AGCGG	2	10	22146	22155	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017245	GGCCT	2	10	37538	37547	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017245	ATGAA	2	10	40109	40118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017245	TTTGT	2	10	41270	41279	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017245	CGCTC	2	10	43479	43488	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017245	TGAAA	2	10	44335	44344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017245	TGCGG	2	10	60821	60830	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017245	TATCT	2	10	73058	73067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017245	TCGGT	2	10	81727	81736	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017245	TTCTC	2	10	81756	81765	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017245	ACTTG	2	10	87285	87294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017245	CGGTA	2	10	97151	97160	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017245	CCAAG	2	10	97326	97335	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017245	TGCTG	2	10	100500	100509	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017245	CTTGC	2	10	107985	107994	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017245	CCTGC	2	10	112659	112668	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017245	GCCCG	2	10	115907	115916	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_017245	GCACA	2	10	117198	117207	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017245	GTTCG	2	10	117219	117228	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017245	GAAAA	2	10	119151	119160	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017245	AATCA	2	10	129083	129092	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017245	AGATA	2	10	134495	134504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017245	CCGGG	2	10	152283	152292	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017245	CGGAT	2	10	159386	159395	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017245	TGTTT	2	10	159970	159979	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017245	CCCGT	2	10	160695	160704	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017245	GGATA	2	10	187722	187731	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017245	TGACG	2	10	191469	191478	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017245	AGCAG	2	10	203269	203278	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017245	TTTTG	2	10	208851	208860	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017245	ATCAA	2	10	209019	209028	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017245	TGAAA	2	10	209029	209038	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017245	TAAGT	2	10	214146	214155	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017245	GTCAA	2	10	235618	235627	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017245	GGCGG	2	10	287926	287935	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017245	GCTTT	2	10	304463	304472	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017245	GGTGG	2	10	339826	339835	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017245	TTTGT	2	10	346495	346504	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017245	GGCCG	2	10	350511	350520	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017245	TGAAA	2	10	365990	365999	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017245	TGGAG	2	10	390005	390014	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017245	TCATA	2	10	391096	391105	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017245	AGCAA	2	10	397452	397461	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017245	CGGAA	2	10	424145	424154	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017245	GCGCC	2	10	429197	429206	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_017245	ATCCC	2	10	436627	436636	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_017245	AAAGC	2	10	456457	456466	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017245	TGAGA	2	10	481523	481532	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017245	CAGGC	2	10	481749	481758	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_017245	ACTGG	2	10	483342	483351	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017245	GTCTT	2	10	488180	488189	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017245	CGGCC	2	10	492355	492364	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_017245	ATTCG	2	10	502173	502182	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017245	TCGCA	2	10	512053	512062	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017245	TCATT	2	10	519545	519554	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017245	AGCGG	2	10	552948	552957	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017245	ACAAA	2	10	555254	555263	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017245	ACAAA	2	10	578732	578741	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017245	TTTGC	2	10	579193	579202	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017245	GCAGA	2	10	585914	585923	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017245	GCCTT	2	10	587362	587371	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017245	GTTTT	2	10	596834	596843	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017245	ACAAA	2	10	609068	609077	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017245	TCGCT	2	10	615585	615594	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017245	GCGCC	2	10	624415	624424	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_017245	ACAAA	2	10	651146	651155	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017245	CGGGG	2	10	653276	653285	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017245	TAATC	2	10	682597	682606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017245	TTACG	2	10	687906	687915	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017245	TCAGG	2	10	699165	699174	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017245	CCGTG	2	10	717665	717674	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017245	ATTAT	2	10	732992	733001	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017245	TCAAA	2	10	757524	757533	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017245	ACAAA	2	10	760999	761008	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017245	GATCG	2	10	769663	769672	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017245	TCCCC	2	10	769789	769798	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
80	NC_017245	TCCCC	2	10	771409	771418	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
81	NC_017245	GCAAT	2	10	772537	772546	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017245	CATTC	2	10	783836	783845	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017245	GCAGT	2	10	799902	799911	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017245	GATCA	2	10	841943	841952	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017245	CAATT	2	10	847913	847922	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017245	CGTAT	2	10	847924	847933	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017245	GAAAA	2	10	853098	853107	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017245	CCGGC	2	10	857592	857601	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_017245	GGTTT	2	10	861048	861057	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017245	ACCAG	2	10	878497	878506	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017245	CCCTC	2	10	890065	890074	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
92	NC_017245	ACAAA	2	10	900795	900804	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017245	GGTGG	2	10	929243	929252	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017245	CATGG	2	10	933011	933020	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017245	CCGGG	4	20	933021	933040	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017245	GCCTC	2	10	933080	933089	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_017245	GCCTG	2	10	933572	933581	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017245	TTCAG	2	10	941169	941178	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017245	ATGCC	2	10	941181	941190	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017245	GGAAC	2	10	942595	942604	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017245	AGGCC	2	10	947766	947775	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017245	CCCTA	2	10	948632	948641	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
103	NC_017245	CCCTT	2	10	952395	952404	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_017245	CCCCG	2	10	968129	968138	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
105	NC_017245	TAAAA	2	10	972174	972183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017245	TCCCC	2	10	988146	988155	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
107	NC_017245	CATTG	2	10	990835	990844	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017245	AGCGA	2	10	1002940	1002949	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017245	CGCTT	2	10	1012781	1012790	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017245	TGCGC	2	10	1016492	1016501	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017245	TGTCA	2	10	1020045	1020054	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017245	CGCCT	2	10	1032120	1032129	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_017245	ATTAA	2	10	1033528	1033537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017245	CTTTC	2	10	1036221	1036230	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017245	AATAG	2	10	1042787	1042796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017245	GATGA	2	10	1054479	1054488	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017245	TCAAC	2	10	1064709	1064718	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017245	GAAAA	2	10	1070957	1070966	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017245	TGCGG	2	10	1075128	1075137	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017245	CATAT	2	10	1080810	1080819	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017245	CGGTT	2	10	1080900	1080909	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017245	TTCAA	2	10	1083794	1083803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017245	CCTCT	2	10	1083812	1083821	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_017245	GCTGT	2	10	1085423	1085432	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017245	CGAAG	2	10	1086236	1086245	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017245	AGCCC	2	10	1086790	1086799	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_017245	CACGA	2	10	1086935	1086944	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017245	TTATT	2	10	1092733	1092742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017245	TTCTG	2	10	1128937	1128946	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017245	CAGGC	2	10	1132157	1132166	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_017245	GGAAG	2	10	1161088	1161097	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017245	TGATT	2	10	1172575	1172584	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017245	AAAGC	2	10	1172599	1172608	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017245	GCTTT	2	10	1172614	1172623	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017245	ACGGC	2	10	1172885	1172894	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.