MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis M28 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017244	ACGGTT	2	12	34831	34842	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017244	CCTGGC	2	12	81340	81351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017244	TTTTGC	2	12	94468	94479	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017244	GCTTTT	2	12	103246	103257	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017244	GGGGAA	2	12	169701	169712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017244	TCTGGC	2	12	186192	186203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017244	GCATGG	2	12	273491	273502	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017244	CTCCCG	2	12	274068	274079	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017244	TTCTGC	2	12	276789	276800	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017244	CACGCG	2	12	279615	279626	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017244	ACGCGC	2	12	279736	279747	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017244	GCTTCC	2	12	293415	293426	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017244	GGCACA	2	12	306907	306918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017244	CTGAAA	2	12	352544	352555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017244	CTTTTT	2	12	359072	359083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017244	TGATTT	2	12	359091	359102	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017244	CTGTCT	2	12	363317	363328	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017244	TTGCCT	2	12	363623	363634	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017244	TTGCAA	2	12	397732	397743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017244	CAGCGC	2	12	406611	406622	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017244	TTTAAC	2	12	453494	453505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017244	CGTTTT	2	12	526839	526850	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017244	CGTCAC	2	12	534650	534661	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017244	ATGACC	2	12	535752	535763	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017244	CTCTAT	2	12	537846	537857	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017244	TGCTGT	2	12	546534	546545	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017244	ACGGTC	2	12	546917	546928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017244	TGCAGG	2	12	555649	555660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017244	TTACGT	2	12	577114	577125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017244	TCCAAA	2	12	645000	645011	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017244	ATTTGT	2	12	681965	681976	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017244	CATCGC	2	12	731468	731479	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017244	ATTGAA	2	12	772765	772776	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017244	CTTTTC	2	12	788751	788762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017244	TCGCGC	2	12	829428	829439	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017244	GAAATT	2	12	921397	921408	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017244	CGCCAG	2	12	961467	961478	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017244	GTTCAG	2	12	973846	973857	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017244	TGCCGG	2	12	998984	998995	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017244	GCTGAT	2	12	1017102	1017113	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017244	TATTTT	2	12	1036393	1036404	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017244	GGACTT	2	12	1039626	1039637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017244	ATCTTG	2	12	1067878	1067889	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017244	CTCTTC	2	12	1095030	1095041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017244	TTTTCC	2	12	1161488	1161499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017244	CAAAAA	2	12	1199824	1199835	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017244	CGTTTC	2	12	1313161	1313172	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017244	CACCGC	2	12	1314214	1314225	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017244	TGGAAC	2	12	1335057	1335068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017244	GTAAAA	2	12	1423361	1423372	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017244	GCATTT	2	12	1429337	1429348	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017244	GCGCAT	2	12	1447434	1447445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017244	CATCGG	2	12	1454986	1454997	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017244	ATGCCA	2	12	1457401	1457412	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017244	CTGAAA	2	12	1468321	1468332	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017244	GCTCTG	2	12	1491739	1491750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017244	AAAAGC	2	12	1564286	1564297	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017244	CTGCCG	2	12	1610850	1610861	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017244	AATGCC	2	12	1669518	1669529	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017244	TCAGCG	2	12	1767694	1767705	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017244	GTCGAA	2	12	1779439	1779450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017244	CAAAAA	2	12	1797106	1797117	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017244	TTGCAT	2	12	1803509	1803520	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017244	CTGCCG	2	12	1814234	1814245	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017244	AACTCA	2	12	1876692	1876703	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017244	ACGTAA	2	12	1880184	1880195	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017244	GAAACG	2	12	1920267	1920278	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017244	CCTGGC	2	12	2035680	2035691	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017244	TTCTTT	2	12	2080591	2080602	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017244	GGAAAC	2	12	2104602	2104613	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017244	TCTTTG	2	12	2118336	2118347	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.