MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis M28 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 269

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017244	CCAGT	2	10	15670	15679	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017244	CATGC	2	10	28343	28352	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017244	CGAAA	2	10	28541	28550	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017244	AAAGC	2	10	36223	36232	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017244	CCGTG	2	10	40674	40683	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017244	TAAAG	2	10	50820	50829	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017244	TGAAA	2	10	51937	51946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017244	CAAGA	2	10	66502	66511	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017244	CGGAG	2	10	72777	72786	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017244	TCGAT	2	10	89227	89236	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017244	CGGTT	2	10	95873	95882	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017244	GAACC	2	10	95925	95934	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017244	GCACC	2	10	106800	106809	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_017244	TTTGT	2	10	107293	107302	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017244	ATGGA	2	10	122840	122849	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017244	TGCGA	2	10	150817	150826	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017244	CGGAG	2	10	165772	165781	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017244	ACAAA	2	10	165839	165848	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017244	CTGCC	2	10	170402	170411	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017244	TGAAA	2	10	171774	171783	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017244	CGTGT	2	10	172671	172680	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017244	TTTTA	2	10	174479	174488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017244	AAAGC	2	10	196357	196366	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017244	ATGTC	2	10	201312	201321	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017244	TTTCG	2	10	216987	216996	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017244	TCAGG	2	10	220164	220173	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017244	CTTGG	2	10	228208	228217	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017244	GGCAG	2	10	233586	233595	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017244	ATAGA	2	10	260785	260794	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017244	GCCCA	2	10	261711	261720	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_017244	ATTCT	2	10	270913	270922	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017244	TGCGC	2	10	271475	271484	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017244	CAACC	2	10	272268	272277	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_017244	CGGCG	2	10	272631	272640	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017244	TCTGT	2	10	278132	278141	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017244	AAATC	2	10	279674	279683	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017244	AAGGG	2	10	279704	279713	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017244	ATTCT	2	10	309990	309999	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017244	TGGCT	2	10	326534	326543	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017244	AAAAG	2	10	332507	332516	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017244	GTTTC	2	10	342429	342438	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017244	CAGCT	2	10	348039	348048	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_017244	TCTTT	2	10	351860	351869	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017244	GATTT	2	10	355609	355618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017244	CGTGG	2	10	368291	368300	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017244	CCAAG	2	10	370371	370380	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017244	ATAAA	2	10	370419	370428	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017244	AGGCG	2	10	384686	384695	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017244	CAGGA	2	10	406912	406921	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017244	GCCTG	2	10	407044	407053	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017244	GCCTG	2	10	407293	407302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017244	ACGCG	2	10	407307	407316	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_017244	CCGGC	2	10	407327	407336	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_017244	ACAAA	2	10	411130	411139	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017244	CGAAA	2	10	424577	424586	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017244	CCGGG	2	10	425671	425680	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017244	ACAAA	2	10	425882	425891	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017244	GAAAA	2	10	433793	433802	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017244	AGGCT	2	10	442533	442542	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017244	GGGTT	2	10	448346	448355	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017244	AATGT	2	10	448423	448432	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017244	AAAAG	2	10	452995	453004	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017244	ACCGC	2	10	454125	454134	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_017244	GTTTT	2	10	454146	454155	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017244	AACGC	2	10	471995	472004	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017244	CAGGG	2	10	476642	476651	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017244	CGGCA	2	10	489084	489093	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017244	AGGGC	2	10	496414	496423	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017244	TGCCG	2	10	496475	496484	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017244	CGGAA	2	10	504926	504935	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017244	TTTTA	2	10	505639	505648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017244	AAATT	2	10	507606	507615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017244	ATGAA	2	10	507627	507636	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017244	ACAGG	2	10	514504	514513	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017244	CCGCA	2	10	536478	536487	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_017244	TGAAT	2	10	537279	537288	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017244	CTGCG	2	10	538978	538987	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017244	TGCCA	2	10	542108	542117	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017244	TCGAC	2	10	542883	542892	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017244	TGCGA	2	10	544904	544913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017244	TCGAC	2	10	548414	548423	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017244	AGTTT	2	10	566754	566763	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017244	ATAGT	2	10	566881	566890	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017244	ACTGA	2	10	585414	585423	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017244	TGGGC	2	10	589923	589932	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017244	ATCAG	2	10	594429	594438	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017244	TAAAA	2	10	638396	638405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017244	GAACG	2	10	645154	645163	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017244	ACCGG	2	10	646877	646886	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_017244	CGCAC	2	10	647994	648003	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_017244	TTTGC	2	10	649436	649445	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017244	GGGGC	2	10	657565	657574	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017244	GCAAG	2	10	681921	681930	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017244	CCGAT	2	10	709610	709619	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017244	ACAAA	2	10	715069	715078	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017244	AAGAT	2	10	722362	722371	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017244	CAAAG	2	10	722932	722941	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017244	TCTTT	2	10	725695	725704	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017244	TGCGA	2	10	728499	728508	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017244	GGCGT	2	10	730856	730865	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017244	CTGAA	2	10	735895	735904	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017244	CATGC	2	10	752988	752997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017244	ACAAA	2	10	764221	764230	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017244	CAAGA	2	10	764249	764258	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017244	ATGCC	2	10	771016	771025	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017244	TTTGT	2	10	781864	781873	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017244	ACAAA	2	10	783751	783760	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017244	CTTGA	2	10	793344	793353	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017244	ATGCC	2	10	800546	800555	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017244	ATTGG	2	10	809532	809541	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017244	GTAAA	2	10	830454	830463	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017244	TGAAG	2	10	841355	841364	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017244	AGCGA	2	10	843995	844004	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017244	GAGCT	2	10	864753	864762	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017244	GGGCA	2	10	866528	866537	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017244	GACAG	2	10	869369	869378	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017244	GACAG	2	10	933155	933164	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017244	GGTGC	2	10	939859	939868	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017244	CATCT	2	10	946463	946472	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017244	TTGCC	2	10	947901	947910	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017244	GCAGG	2	10	955758	955767	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017244	CAAGC	2	10	959490	959499	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017244	TTCCT	2	10	962522	962531	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017244	CGCTG	2	10	962557	962566	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017244	TGCGA	2	10	963946	963955	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017244	CCGCA	2	10	971598	971607	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_017244	TTGCG	2	10	999174	999183	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017244	TGCAG	2	10	999194	999203	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017244	AAATA	2	10	1004566	1004575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017244	ACAAA	2	10	1016258	1016267	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017244	ACAAA	2	10	1021160	1021169	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017244	CGTGG	2	10	1035161	1035170	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017244	AGGGC	2	10	1041322	1041331	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017244	AAAAG	2	10	1045676	1045685	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017244	AAAAT	2	10	1045859	1045868	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017244	ACGAA	2	10	1065594	1065603	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017244	TCCCC	2	10	1067714	1067723	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
138	NC_017244	CATGG	2	10	1068117	1068126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017244	CTCAT	2	10	1068923	1068932	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017244	AAGAA	2	10	1069114	1069123	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017244	GCACA	2	10	1074147	1074156	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017244	GTTTT	2	10	1075250	1075259	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017244	ACGCA	2	10	1087081	1087090	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017244	TCAAT	2	10	1102841	1102850	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017244	GGTCC	2	10	1121527	1121536	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017244	ATTGA	2	10	1128595	1128604	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017244	AAAAG	2	10	1133114	1133123	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017244	GTTTT	2	10	1141399	1141408	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017244	TTTGT	2	10	1147964	1147973	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017244	TCCGC	2	10	1155136	1155145	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
151	NC_017244	GTGAT	2	10	1178582	1178591	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017244	TTTTC	2	10	1212374	1212383	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017244	CCCTT	2	10	1235724	1235733	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
154	NC_017244	TTTGT	2	10	1246027	1246036	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017244	CCTCT	2	10	1249951	1249960	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
156	NC_017244	ACAAA	2	10	1256419	1256428	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_017244	TCTTT	2	10	1261534	1261543	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_017244	GGCGG	2	10	1267416	1267425	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
159	NC_017244	ACAAA	2	10	1293043	1293052	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_017244	ACAAA	2	10	1313133	1313142	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_017244	GGCCG	2	10	1316557	1316566	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
162	NC_017244	AAGAG	2	10	1318444	1318453	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_017244	ACAAA	2	10	1361219	1361228	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_017244	CTGCC	2	10	1361298	1361307	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
167	NC_017244	CACTA	2	10	1363111	1363120	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
168	NC_017244	TTTGT	2	10	1370667	1370676	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017244	AATCA	2	10	1406216	1406225	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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173	NC_017244	AAGCA	2	10	1437661	1437670	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
174	NC_017244	ATCGG	2	10	1439415	1439424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_017244	CATCC	2	10	1444599	1444608	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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179	NC_017244	GCTTC	2	10	1452453	1452462	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_017244	CGGTT	2	10	1464040	1464049	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
182	NC_017244	TCCTT	2	10	1480054	1480063	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
183	NC_017244	TTGCC	2	10	1480108	1480117	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
184	NC_017244	TGAGG	2	10	1482926	1482935	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017244	ACCGA	2	10	1490824	1490833	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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189	NC_017244	ACAAA	2	10	1515788	1515797	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_017244	ACAAA	2	10	1568981	1568990	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
193	NC_017244	ACAAA	2	10	1574240	1574249	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
194	NC_017244	GATTG	2	10	1588233	1588242	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_017244	TCAAA	2	10	1591829	1591838	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_017244	GAACG	2	10	1600225	1600234	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
198	NC_017244	TCACT	2	10	1601911	1601920	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
199	NC_017244	TTCAA	2	10	1606160	1606169	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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201	NC_017244	GCTGT	2	10	1607789	1607798	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_017244	CCATG	2	10	1927842	1927851	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
250	NC_017244	CAAAT	2	10	1927912	1927921	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
251	NC_017244	CACAA	2	10	1948666	1948675	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
252	NC_017244	GCATC	2	10	1951740	1951749	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
253	NC_017244	CCCGA	2	10	1959827	1959836	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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260	NC_017244	TGAAT	2	10	2074114	2074123	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017244	TTTGT	2	10	2074245	2074254	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017244	GAACA	2	10	2098326	2098335	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
263	NC_017244	ACAAA	2	10	2103721	2103730	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_017244	CCTGT	2	10	2104556	2104565	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
265	NC_017244	CCCGG	2	10	2109315	2109324	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
266	NC_017244	ACCCG	2	10	2109703	2109712	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
267	NC_017244	CGGAT	2	10	2109728	2109737	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
268	NC_017244	GGCTT	2	10	2120289	2120298	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
269	NC_017244	GGATG	2	10	2125372	2125381	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.