MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 10919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017243	ATTG	2	8	1344	1351	25 %	50 %	25 %	0 %	384207498
2	NC_017243	TAAT	2	8	1480	1487	50 %	50 %	0 %	0 %	384207499
3	NC_017243	TTAT	2	8	2209	2216	25 %	75 %	0 %	0 %	384207499
4	NC_017243	GCCC	2	8	2669	2676	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_017243	CGCA	2	8	2717	2724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017243	AAAT	2	8	3507	3514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017243	GATT	2	8	4163	4170	25 %	50 %	25 %	0 %	384207501
8	NC_017243	TTTC	2	8	4278	4285	0 %	75 %	0 %	25 %	384207502
9	NC_017243	ATTC	2	8	4435	4442	25 %	50 %	0 %	25 %	384207502
10	NC_017243	TCAT	2	8	5207	5214	25 %	50 %	0 %	25 %	384207502
11	NC_017243	AATT	2	8	5215	5222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017243	TAAA	2	8	5279	5286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017243	AATA	2	8	5329	5336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017243	TGCG	2	8	5454	5461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017243	TAAA	2	8	5479	5486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017243	GGGC	2	8	5568	5575	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017243	TTTA	2	8	5751	5758	25 %	75 %	0 %	0 %	384207503
18	NC_017243	TGCT	2	8	6002	6009	0 %	50 %	25 %	25 %	384207503
19	NC_017243	AAAG	2	8	6241	6248	75 %	0 %	25 %	0 %	384207503
20	NC_017243	TTTG	2	8	6330	6337	0 %	75 %	25 %	0 %	384207503
21	NC_017243	AAAG	2	8	6487	6494	75 %	0 %	25 %	0 %	384207503
22	NC_017243	AATT	2	8	6583	6590	50 %	50 %	0 %	0 %	384207503
23	NC_017243	TTTA	2	8	6735	6742	25 %	75 %	0 %	0 %	384207504
24	NC_017243	AAAC	2	8	7027	7034	75 %	0 %	0 %	25 %	384207504
25	NC_017243	AATA	2	8	7779	7786	75 %	25 %	0 %	0 %	384207505
26	NC_017243	CATT	2	8	8355	8362	25 %	50 %	0 %	25 %	384207506
27	NC_017243	TATT	2	8	8590	8597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017243	TAAA	2	8	8713	8720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017243	TGGG	2	8	8724	8731	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017243	GCCC	2	8	8846	8853	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_017243	CCCA	2	8	8926	8933	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_017243	TAAT	2	8	9232	9239	50 %	50 %	0 %	0 %	384207507
33	NC_017243	TAAG	2	8	9509	9516	50 %	25 %	25 %	0 %	384207507
34	NC_017243	AACT	2	8	9624	9631	50 %	25 %	0 %	25 %	384207507
35	NC_017243	TCCT	2	8	9891	9898	0 %	50 %	0 %	50 %	384207507
36	NC_017243	CATT	2	8	10351	10358	25 %	50 %	0 %	25 %	384207507
37	NC_017243	CAAA	2	8	11207	11214	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017243	TTTA	2	8	11385	11392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017243	ATTT	2	8	11968	11975	25 %	75 %	0 %	0 %	384207508
40	NC_017243	TATT	2	8	12485	12492	25 %	75 %	0 %	0 %	384207509
41	NC_017243	TTTA	2	8	12583	12590	25 %	75 %	0 %	0 %	384207509
42	NC_017243	TTAT	2	8	13102	13109	25 %	75 %	0 %	0 %	384207509
43	NC_017243	TAGT	2	8	13903	13910	25 %	50 %	25 %	0 %	384207511
44	NC_017243	AGAA	2	8	14141	14148	75 %	0 %	25 %	0 %	384207511
45	NC_017243	ATTT	2	8	14670	14677	25 %	75 %	0 %	0 %	384207512
46	NC_017243	TAAA	2	8	15194	15201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017243	GGGC	2	8	15226	15233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017243	ATTT	2	8	15242	15249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017243	AATA	2	8	15305	15312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017243	TAAA	2	8	15343	15350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017243	AGGA	2	8	16194	16201	50 %	0 %	50 %	0 %	384207513
52	NC_017243	TTAG	2	8	16920	16927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017243	ATTC	2	8	16982	16989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017243	AGAA	2	8	17772	17779	75 %	0 %	25 %	0 %	384207514
55	NC_017243	ACTC	2	8	17979	17986	25 %	25 %	0 %	50 %	384207514
56	NC_017243	TAAA	2	8	18349	18356	75 %	25 %	0 %	0 %	384207514
57	NC_017243	AAAC	2	8	18387	18394	75 %	0 %	0 %	25 %	384207514
58	NC_017243	TAAT	2	8	18561	18568	50 %	50 %	0 %	0 %	384207514
59	NC_017243	TAAT	2	8	18636	18643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017243	TAAA	2	8	19251	19258	75 %	25 %	0 %	0 %	384207516
61	NC_017243	TAAA	2	8	19359	19366	75 %	25 %	0 %	0 %	384207516
62	NC_017243	AAAG	2	8	19468	19475	75 %	0 %	25 %	0 %	384207516
63	NC_017243	ATTA	2	8	19517	19524	50 %	50 %	0 %	0 %	384207516
64	NC_017243	AAAT	2	8	19656	19663	75 %	25 %	0 %	0 %	384207516
65	NC_017243	ACTC	2	8	19712	19719	25 %	25 %	0 %	50 %	384207517
66	NC_017243	TTCA	2	8	20668	20675	25 %	50 %	0 %	25 %	384207518
67	NC_017243	CATG	2	8	21020	21027	25 %	25 %	25 %	25 %	384207518
68	NC_017243	CATA	2	8	21178	21185	50 %	25 %	0 %	25 %	384207518
69	NC_017243	GAAG	2	8	21235	21242	50 %	0 %	50 %	0 %	384207518
70	NC_017243	AATA	2	8	21668	21675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017243	TAAT	2	8	21803	21810	50 %	50 %	0 %	0 %	384207519
72	NC_017243	TTTA	2	8	21907	21914	25 %	75 %	0 %	0 %	384207519
73	NC_017243	TAAA	2	8	21979	21986	75 %	25 %	0 %	0 %	384207519
74	NC_017243	ATAA	2	8	22221	22228	75 %	25 %	0 %	0 %	384207519
75	NC_017243	AAAT	2	8	22340	22347	75 %	25 %	0 %	0 %	384207519
76	NC_017243	CATT	2	8	22568	22575	25 %	50 %	0 %	25 %	384207519
77	NC_017243	AAGG	2	8	23068	23075	50 %	0 %	50 %	0 %	384207520
78	NC_017243	TAAA	2	8	23256	23263	75 %	25 %	0 %	0 %	384207520
79	NC_017243	AATA	2	8	23461	23468	75 %	25 %	0 %	0 %	384207520
80	NC_017243	AGGA	2	8	23494	23501	50 %	0 %	50 %	0 %	384207520
81	NC_017243	AGGA	2	8	23664	23671	50 %	0 %	50 %	0 %	384207520
82	NC_017243	AATT	2	8	23994	24001	50 %	50 %	0 %	0 %	384207521
83	NC_017243	TAAA	2	8	24370	24377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017243	GGGC	2	8	24382	24389	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017243	CCCA	2	8	24581	24588	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_017243	GGGC	2	8	24727	24734	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017243	AAAG	2	8	25047	25054	75 %	0 %	25 %	0 %	384207522
88	NC_017243	TTAC	2	8	25462	25469	25 %	50 %	0 %	25 %	384207522
89	NC_017243	TTTC	2	8	25889	25896	0 %	75 %	0 %	25 %	384207522
90	NC_017243	ATTT	2	8	25932	25939	25 %	75 %	0 %	0 %	384207522
91	NC_017243	ATTG	2	8	25968	25975	25 %	50 %	25 %	0 %	384207522
92	NC_017243	ATAA	2	8	26167	26174	75 %	25 %	0 %	0 %	384207522
93	NC_017243	TAAA	2	8	26236	26243	75 %	25 %	0 %	0 %	384207522
94	NC_017243	TTAT	2	8	26589	26596	25 %	75 %	0 %	0 %	384207523
95	NC_017243	ATTT	2	8	26677	26684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017243	TTAT	2	8	26698	26705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017243	TTTA	2	8	26765	26772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017243	TCTT	2	8	26823	26830	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017243	ACCC	2	8	26855	26862	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_017243	ACGC	2	8	26892	26899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017243	CGTG	2	8	26967	26974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017243	TAAT	2	8	26991	26998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017243	GAAT	2	8	27695	27702	50 %	25 %	25 %	0 %	384207524
104	NC_017243	AAAT	2	8	28330	28337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017243	ACAT	2	8	28873	28880	50 %	25 %	0 %	25 %	384207525
106	NC_017243	AATT	2	8	29027	29034	50 %	50 %	0 %	0 %	384207525
107	NC_017243	ATTT	2	8	29089	29096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017243	TATT	2	8	29746	29753	25 %	75 %	0 %	0 %	384207526
109	NC_017243	TAAA	2	8	30126	30133	75 %	25 %	0 %	0 %	384207526
110	NC_017243	TGGT	2	8	30417	30424	0 %	50 %	50 %	0 %	384207526
111	NC_017243	TATT	2	8	30717	30724	25 %	75 %	0 %	0 %	384207526
112	NC_017243	TATG	2	8	30835	30842	25 %	50 %	25 %	0 %	384207526
113	NC_017243	AATT	2	8	31717	31724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017243	TATG	2	8	32037	32044	25 %	50 %	25 %	0 %	384207527
115	NC_017243	ATTT	2	8	32639	32646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017243	CTTT	2	8	34161	34168	0 %	75 %	0 %	25 %	384207529
117	NC_017243	AAAG	2	8	34274	34281	75 %	0 %	25 %	0 %	384207529
118	NC_017243	AAAT	2	8	34405	34412	75 %	25 %	0 %	0 %	384207529
119	NC_017243	TTTA	2	8	34708	34715	25 %	75 %	0 %	0 %	384207530
120	NC_017243	TAAT	2	8	34897	34904	50 %	50 %	0 %	0 %	384207530
121	NC_017243	GAAA	2	8	35144	35151	75 %	0 %	25 %	0 %	384207530
122	NC_017243	ATGA	2	8	35415	35422	50 %	25 %	25 %	0 %	384207530
123	NC_017243	ATTA	2	8	35786	35793	50 %	50 %	0 %	0 %	384207531
124	NC_017243	TGAA	2	8	36684	36691	50 %	25 %	25 %	0 %	384207532
125	NC_017243	ATTT	2	8	37012	37019	25 %	75 %	0 %	0 %	384207532
126	NC_017243	TATT	2	8	37284	37291	25 %	75 %	0 %	0 %	384207533
127	NC_017243	AGGA	2	8	38274	38281	50 %	0 %	50 %	0 %	384207534
128	NC_017243	AATC	2	8	39014	39021	50 %	25 %	0 %	25 %	384207535
129	NC_017243	ATTC	2	8	39154	39161	25 %	50 %	0 %	25 %	384207535
130	NC_017243	ATTT	2	8	39183	39190	25 %	75 %	0 %	0 %	384207535
131	NC_017243	CATA	2	8	39337	39344	50 %	25 %	0 %	25 %	384207535
132	NC_017243	TTCT	2	8	39636	39643	0 %	75 %	0 %	25 %	384207536
133	NC_017243	TTTA	2	8	40012	40019	25 %	75 %	0 %	0 %	384207536
134	NC_017243	TCTA	2	8	40045	40052	25 %	50 %	0 %	25 %	384207536
135	NC_017243	ATTT	2	8	40168	40175	25 %	75 %	0 %	0 %	384207536
136	NC_017243	TGTA	2	8	41080	41087	25 %	50 %	25 %	0 %	384207537
137	NC_017243	CTTT	2	8	41211	41218	0 %	75 %	0 %	25 %	384207537
138	NC_017243	ATAA	2	8	41640	41647	75 %	25 %	0 %	0 %	384207538
139	NC_017243	AAAT	2	8	41778	41785	75 %	25 %	0 %	0 %	384207538
140	NC_017243	TATT	2	8	41983	41990	25 %	75 %	0 %	0 %	384207538
141	NC_017243	CATT	2	8	42218	42225	25 %	50 %	0 %	25 %	384207538
142	NC_017243	TCAT	2	8	42445	42452	25 %	50 %	0 %	25 %	384207539
143	NC_017243	AGGC	2	8	43446	43453	25 %	0 %	50 %	25 %	384207540
144	NC_017243	TATC	2	8	44028	44035	25 %	50 %	0 %	25 %	384207541
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146	NC_017243	TTAT	2	8	44527	44534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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