MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 2517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017243	GCCC	2	8	2669	2676	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_017243	CGCA	2	8	2717	2724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017243	AAAT	2	8	3507	3514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017243	AATT	2	8	5215	5222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017243	TAAA	2	8	5279	5286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017243	AATA	2	8	5329	5336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017243	TGCG	2	8	5454	5461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017243	TAAA	2	8	5479	5486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017243	GGGC	2	8	5568	5575	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017243	TATT	2	8	8590	8597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017243	TAAA	2	8	8713	8720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017243	TGGG	2	8	8724	8731	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017243	GCCC	2	8	8846	8853	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_017243	CCCA	2	8	8926	8933	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_017243	CAAA	2	8	11207	11214	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017243	TTTA	2	8	11385	11392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017243	TAAA	2	8	15194	15201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017243	GGGC	2	8	15226	15233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017243	ATTT	2	8	15242	15249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017243	AATA	2	8	15305	15312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017243	TAAA	2	8	15343	15350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017243	TTAG	2	8	16920	16927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017243	ATTC	2	8	16982	16989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017243	TAAT	2	8	18636	18643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017243	AATA	2	8	21668	21675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017243	TAAA	2	8	24370	24377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017243	GGGC	2	8	24382	24389	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017243	CCCA	2	8	24581	24588	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_017243	GGGC	2	8	24727	24734	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017243	ATTT	2	8	26677	26684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017243	TTAT	2	8	26698	26705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017243	TTTA	2	8	26765	26772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017243	TCTT	2	8	26823	26830	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017243	ACCC	2	8	26855	26862	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_017243	ACGC	2	8	26892	26899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017243	CGTG	2	8	26967	26974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017243	TAAT	2	8	26991	26998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017243	AAAT	2	8	28330	28337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017243	ATTT	2	8	29089	29096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017243	AATT	2	8	31717	31724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017243	ATTT	2	8	32639	32646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017243	TTAT	2	8	44527	44534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017243	AATA	2	8	44658	44665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017243	TGGG	2	8	44760	44767	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017243	TAAA	2	8	46497	46504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017243	TATT	2	8	46523	46530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017243	TGGG	2	8	50204	50211	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017243	TAAA	2	8	50318	50325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017243	TAAA	2	8	51801	51808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017243	ATTA	2	8	51925	51932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017243	TAAA	2	8	52001	52008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017243	AATT	2	8	53646	53653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017243	TTTA	2	8	53704	53711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017243	AAAT	2	8	54195	54202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017243	TTTA	2	8	54215	54222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017243	AAAT	2	8	54492	54499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017243	GAAA	2	8	56170	56177	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017243	CCCA	2	8	56426	56433	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_017243	AAAG	2	8	56515	56522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017243	TTAT	2	8	59088	59095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017243	ATTA	2	8	59150	59157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017243	AATT	2	8	59701	59708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017243	AATT	2	8	59805	59812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017243	CCTA	2	8	68857	68864	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017243	AAAT	3	12	69098	69109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017243	TTAT	2	8	69215	69222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017243	ATTA	2	8	71041	71048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017243	TTAT	2	8	71056	71063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017243	GCAC	2	8	76501	76508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017243	CTAA	2	8	78096	78103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017243	GAAA	2	8	78277	78284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017243	AAAG	2	8	78368	78375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017243	AGCC	2	8	85704	85711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017243	AATT	2	8	95791	95798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017243	TTAA	2	8	99163	99170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017243	TAAC	2	8	99178	99185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017243	TATT	2	8	101700	101707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017243	GTAT	2	8	101760	101767	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017243	TGGG	2	8	101790	101797	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017243	AAAT	2	8	101847	101854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017243	ACCC	2	8	101988	101995	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_017243	AAAT	2	8	102071	102078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017243	ATTT	2	8	104381	104388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017243	AAAT	2	8	104395	104402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017243	AAAT	2	8	104443	104450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017243	ATTA	2	8	104526	104533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017243	GAAG	2	8	105957	105964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017243	TAAT	2	8	109579	109586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017243	TATT	2	8	109612	109619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017243	GGGT	2	8	110093	110100	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017243	TTTA	2	8	110236	110243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017243	AATA	2	8	113111	113118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017243	ATAA	2	8	113644	113651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017243	TACG	2	8	113692	113699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017243	ATTT	2	8	113734	113741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017243	ATTT	2	8	113763	113770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017243	TGGG	2	8	113807	113814	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017243	TTAA	2	8	114035	114042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017243	TTAT	2	8	114061	114068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017243	TGCG	2	8	114114	114121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017243	AATA	2	8	115639	115646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017243	TGAT	2	8	115725	115732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017243	ATAA	2	8	115742	115749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017243	TTAA	2	8	116834	116841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017243	TTTA	2	8	116859	116866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017243	TGGG	2	8	116950	116957	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017243	CGCA	2	8	117188	117195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017243	ATAA	2	8	117242	117249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017243	ATTC	2	8	117252	117259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017243	GCGT	2	8	117261	117268	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017243	TAAT	2	8	117280	117287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017243	ATTT	2	8	117429	117436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017243	TTAT	2	8	117512	117519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017243	TTTA	2	8	119082	119089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017243	TGCG	2	8	119127	119134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017243	TGGG	2	8	119164	119171	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017243	TAAA	2	8	119611	119618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017243	AACA	2	8	120940	120947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017243	TAAA	2	8	122084	122091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017243	TAAT	2	8	122219	122226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017243	TGAT	2	8	125133	125140	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017243	AGTT	2	8	125158	125165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017243	TTGT	2	8	126240	126247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017243	TTAT	2	8	127371	127378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017243	TTTA	2	8	127415	127422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017243	TCAG	2	8	129324	129331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017243	GCTA	2	8	134014	134021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017243	ATTT	2	8	135787	135794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017243	CAAA	2	8	136328	136335	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017243	AATT	2	8	136340	136347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017243	TATT	2	8	138321	138328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017243	AATA	3	12	138411	138422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017243	ATTT	2	8	140492	140499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017243	TGGG	2	8	145344	145351	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017243	TAAT	2	8	145434	145441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017243	ATTA	2	8	145456	145463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017243	CCCA	2	8	145547	145554	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_017243	TAAA	2	8	145682	145689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017243	AATA	2	8	145759	145766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017243	GTAA	2	8	145783	145790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017243	TAAT	2	8	148333	148340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017243	TATT	2	8	148352	148359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017243	TAAA	2	8	148395	148402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017243	TTTA	2	8	148461	148468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017243	GGGC	2	8	148486	148493	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017243	TAAT	2	8	148974	148981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017243	AATT	2	8	149936	149943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017243	ATTT	2	8	149983	149990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017243	TAGA	2	8	150275	150282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017243	TATT	2	8	151021	151028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017243	TACA	2	8	151175	151182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017243	GAAA	2	8	151704	151711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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