MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 8402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017243	ATTG	2	8	1344	1351	25 %	50 %	25 %	0 %	384207498
2	NC_017243	TAAT	2	8	1480	1487	50 %	50 %	0 %	0 %	384207499
3	NC_017243	TTAT	2	8	2209	2216	25 %	75 %	0 %	0 %	384207499
4	NC_017243	GATT	2	8	4163	4170	25 %	50 %	25 %	0 %	384207501
5	NC_017243	TTTC	2	8	4278	4285	0 %	75 %	0 %	25 %	384207502
6	NC_017243	ATTC	2	8	4435	4442	25 %	50 %	0 %	25 %	384207502
7	NC_017243	TCAT	2	8	5207	5214	25 %	50 %	0 %	25 %	384207502
8	NC_017243	TTTA	2	8	5751	5758	25 %	75 %	0 %	0 %	384207503
9	NC_017243	TGCT	2	8	6002	6009	0 %	50 %	25 %	25 %	384207503
10	NC_017243	AAAG	2	8	6241	6248	75 %	0 %	25 %	0 %	384207503
11	NC_017243	TTTG	2	8	6330	6337	0 %	75 %	25 %	0 %	384207503
12	NC_017243	AAAG	2	8	6487	6494	75 %	0 %	25 %	0 %	384207503
13	NC_017243	AATT	2	8	6583	6590	50 %	50 %	0 %	0 %	384207503
14	NC_017243	TTTA	2	8	6735	6742	25 %	75 %	0 %	0 %	384207504
15	NC_017243	AAAC	2	8	7027	7034	75 %	0 %	0 %	25 %	384207504
16	NC_017243	AATA	2	8	7779	7786	75 %	25 %	0 %	0 %	384207505
17	NC_017243	CATT	2	8	8355	8362	25 %	50 %	0 %	25 %	384207506
18	NC_017243	TAAT	2	8	9232	9239	50 %	50 %	0 %	0 %	384207507
19	NC_017243	TAAG	2	8	9509	9516	50 %	25 %	25 %	0 %	384207507
20	NC_017243	AACT	2	8	9624	9631	50 %	25 %	0 %	25 %	384207507
21	NC_017243	TCCT	2	8	9891	9898	0 %	50 %	0 %	50 %	384207507
22	NC_017243	CATT	2	8	10351	10358	25 %	50 %	0 %	25 %	384207507
23	NC_017243	ATTT	2	8	11968	11975	25 %	75 %	0 %	0 %	384207508
24	NC_017243	TATT	2	8	12485	12492	25 %	75 %	0 %	0 %	384207509
25	NC_017243	TTTA	2	8	12583	12590	25 %	75 %	0 %	0 %	384207509
26	NC_017243	TTAT	2	8	13102	13109	25 %	75 %	0 %	0 %	384207509
27	NC_017243	TAGT	2	8	13903	13910	25 %	50 %	25 %	0 %	384207511
28	NC_017243	AGAA	2	8	14141	14148	75 %	0 %	25 %	0 %	384207511
29	NC_017243	ATTT	2	8	14670	14677	25 %	75 %	0 %	0 %	384207512
30	NC_017243	AGGA	2	8	16194	16201	50 %	0 %	50 %	0 %	384207513
31	NC_017243	AGAA	2	8	17772	17779	75 %	0 %	25 %	0 %	384207514
32	NC_017243	ACTC	2	8	17979	17986	25 %	25 %	0 %	50 %	384207514
33	NC_017243	TAAA	2	8	18349	18356	75 %	25 %	0 %	0 %	384207514
34	NC_017243	AAAC	2	8	18387	18394	75 %	0 %	0 %	25 %	384207514
35	NC_017243	TAAT	2	8	18561	18568	50 %	50 %	0 %	0 %	384207514
36	NC_017243	TAAA	2	8	19251	19258	75 %	25 %	0 %	0 %	384207516
37	NC_017243	TAAA	2	8	19359	19366	75 %	25 %	0 %	0 %	384207516
38	NC_017243	AAAG	2	8	19468	19475	75 %	0 %	25 %	0 %	384207516
39	NC_017243	ATTA	2	8	19517	19524	50 %	50 %	0 %	0 %	384207516
40	NC_017243	AAAT	2	8	19656	19663	75 %	25 %	0 %	0 %	384207516
41	NC_017243	ACTC	2	8	19712	19719	25 %	25 %	0 %	50 %	384207517
42	NC_017243	TTCA	2	8	20668	20675	25 %	50 %	0 %	25 %	384207518
43	NC_017243	CATG	2	8	21020	21027	25 %	25 %	25 %	25 %	384207518
44	NC_017243	CATA	2	8	21178	21185	50 %	25 %	0 %	25 %	384207518
45	NC_017243	GAAG	2	8	21235	21242	50 %	0 %	50 %	0 %	384207518
46	NC_017243	TAAT	2	8	21803	21810	50 %	50 %	0 %	0 %	384207519
47	NC_017243	TTTA	2	8	21907	21914	25 %	75 %	0 %	0 %	384207519
48	NC_017243	TAAA	2	8	21979	21986	75 %	25 %	0 %	0 %	384207519
49	NC_017243	ATAA	2	8	22221	22228	75 %	25 %	0 %	0 %	384207519
50	NC_017243	AAAT	2	8	22340	22347	75 %	25 %	0 %	0 %	384207519
51	NC_017243	CATT	2	8	22568	22575	25 %	50 %	0 %	25 %	384207519
52	NC_017243	AAGG	2	8	23068	23075	50 %	0 %	50 %	0 %	384207520
53	NC_017243	TAAA	2	8	23256	23263	75 %	25 %	0 %	0 %	384207520
54	NC_017243	AATA	2	8	23461	23468	75 %	25 %	0 %	0 %	384207520
55	NC_017243	AGGA	2	8	23494	23501	50 %	0 %	50 %	0 %	384207520
56	NC_017243	AGGA	2	8	23664	23671	50 %	0 %	50 %	0 %	384207520
57	NC_017243	AATT	2	8	23994	24001	50 %	50 %	0 %	0 %	384207521
58	NC_017243	AAAG	2	8	25047	25054	75 %	0 %	25 %	0 %	384207522
59	NC_017243	TTAC	2	8	25462	25469	25 %	50 %	0 %	25 %	384207522
60	NC_017243	TTTC	2	8	25889	25896	0 %	75 %	0 %	25 %	384207522
61	NC_017243	ATTT	2	8	25932	25939	25 %	75 %	0 %	0 %	384207522
62	NC_017243	ATTG	2	8	25968	25975	25 %	50 %	25 %	0 %	384207522
63	NC_017243	ATAA	2	8	26167	26174	75 %	25 %	0 %	0 %	384207522
64	NC_017243	TAAA	2	8	26236	26243	75 %	25 %	0 %	0 %	384207522
65	NC_017243	TTAT	2	8	26589	26596	25 %	75 %	0 %	0 %	384207523
66	NC_017243	GAAT	2	8	27695	27702	50 %	25 %	25 %	0 %	384207524
67	NC_017243	ACAT	2	8	28873	28880	50 %	25 %	0 %	25 %	384207525
68	NC_017243	AATT	2	8	29027	29034	50 %	50 %	0 %	0 %	384207525
69	NC_017243	TATT	2	8	29746	29753	25 %	75 %	0 %	0 %	384207526
70	NC_017243	TAAA	2	8	30126	30133	75 %	25 %	0 %	0 %	384207526
71	NC_017243	TGGT	2	8	30417	30424	0 %	50 %	50 %	0 %	384207526
72	NC_017243	TATT	2	8	30717	30724	25 %	75 %	0 %	0 %	384207526
73	NC_017243	TATG	2	8	30835	30842	25 %	50 %	25 %	0 %	384207526
74	NC_017243	TATG	2	8	32037	32044	25 %	50 %	25 %	0 %	384207527
75	NC_017243	CTTT	2	8	34161	34168	0 %	75 %	0 %	25 %	384207529
76	NC_017243	AAAG	2	8	34274	34281	75 %	0 %	25 %	0 %	384207529
77	NC_017243	AAAT	2	8	34405	34412	75 %	25 %	0 %	0 %	384207529
78	NC_017243	TTTA	2	8	34708	34715	25 %	75 %	0 %	0 %	384207530
79	NC_017243	TAAT	2	8	34897	34904	50 %	50 %	0 %	0 %	384207530
80	NC_017243	GAAA	2	8	35144	35151	75 %	0 %	25 %	0 %	384207530
81	NC_017243	ATGA	2	8	35415	35422	50 %	25 %	25 %	0 %	384207530
82	NC_017243	ATTA	2	8	35786	35793	50 %	50 %	0 %	0 %	384207531
83	NC_017243	TGAA	2	8	36684	36691	50 %	25 %	25 %	0 %	384207532
84	NC_017243	ATTT	2	8	37012	37019	25 %	75 %	0 %	0 %	384207532
85	NC_017243	TATT	2	8	37284	37291	25 %	75 %	0 %	0 %	384207533
86	NC_017243	AGGA	2	8	38274	38281	50 %	0 %	50 %	0 %	384207534
87	NC_017243	AATC	2	8	39014	39021	50 %	25 %	0 %	25 %	384207535
88	NC_017243	ATTC	2	8	39154	39161	25 %	50 %	0 %	25 %	384207535
89	NC_017243	ATTT	2	8	39183	39190	25 %	75 %	0 %	0 %	384207535
90	NC_017243	CATA	2	8	39337	39344	50 %	25 %	0 %	25 %	384207535
91	NC_017243	TTCT	2	8	39636	39643	0 %	75 %	0 %	25 %	384207536
92	NC_017243	TTTA	2	8	40012	40019	25 %	75 %	0 %	0 %	384207536
93	NC_017243	TCTA	2	8	40045	40052	25 %	50 %	0 %	25 %	384207536
94	NC_017243	ATTT	2	8	40168	40175	25 %	75 %	0 %	0 %	384207536
95	NC_017243	TGTA	2	8	41080	41087	25 %	50 %	25 %	0 %	384207537
96	NC_017243	CTTT	2	8	41211	41218	0 %	75 %	0 %	25 %	384207537
97	NC_017243	ATAA	2	8	41640	41647	75 %	25 %	0 %	0 %	384207538
98	NC_017243	AAAT	2	8	41778	41785	75 %	25 %	0 %	0 %	384207538
99	NC_017243	TATT	2	8	41983	41990	25 %	75 %	0 %	0 %	384207538
100	NC_017243	CATT	2	8	42218	42225	25 %	50 %	0 %	25 %	384207538
101	NC_017243	TCAT	2	8	42445	42452	25 %	50 %	0 %	25 %	384207539
102	NC_017243	AGGC	2	8	43446	43453	25 %	0 %	50 %	25 %	384207540
103	NC_017243	TATC	2	8	44028	44035	25 %	50 %	0 %	25 %	384207541
104	NC_017243	ATAA	2	8	44182	44189	75 %	25 %	0 %	0 %	384207541
105	NC_017243	AATG	2	8	45471	45478	50 %	25 %	25 %	0 %	384207542
106	NC_017243	AAAG	2	8	45849	45856	75 %	0 %	25 %	0 %	384207542
107	NC_017243	ATAC	2	8	45857	45864	50 %	25 %	0 %	25 %	384207542
108	NC_017243	ATAA	2	8	45919	45926	75 %	25 %	0 %	0 %	384207542
109	NC_017243	ACAT	2	8	46472	46479	50 %	25 %	0 %	25 %	384207542
110	NC_017243	GGCT	2	8	47019	47026	0 %	25 %	50 %	25 %	384207543
111	NC_017243	AATA	2	8	47283	47290	75 %	25 %	0 %	0 %	384207543
112	NC_017243	ATAA	2	8	47934	47941	75 %	25 %	0 %	0 %	384207543
113	NC_017243	AGTC	2	8	49133	49140	25 %	25 %	25 %	25 %	384207544
114	NC_017243	AAAT	2	8	50923	50930	75 %	25 %	0 %	0 %	384207546
115	NC_017243	TTCT	2	8	51109	51116	0 %	75 %	0 %	25 %	384207546
116	NC_017243	TTAC	2	8	51487	51494	25 %	50 %	0 %	25 %	384207546
117	NC_017243	AGGA	2	8	52105	52112	50 %	0 %	50 %	0 %	384207548
118	NC_017243	GCTA	2	8	52211	52218	25 %	25 %	25 %	25 %	384207548
119	NC_017243	AGAA	2	8	52655	52662	75 %	0 %	25 %	0 %	384207548
120	NC_017243	TAGA	2	8	52954	52961	50 %	25 %	25 %	0 %	384207548
121	NC_017243	AGGT	2	8	53065	53072	25 %	25 %	50 %	0 %	384207548
122	NC_017243	TTAT	2	8	53587	53594	25 %	75 %	0 %	0 %	384207548
123	NC_017243	TGAC	2	8	55033	55040	25 %	25 %	25 %	25 %	384207550
124	NC_017243	ATGT	2	8	55189	55196	25 %	50 %	25 %	0 %	384207550
125	NC_017243	ATTA	2	8	55375	55382	50 %	50 %	0 %	0 %	384207550
126	NC_017243	CTTT	2	8	55605	55612	0 %	75 %	0 %	25 %	384207551
127	NC_017243	TTTA	2	8	57360	57367	25 %	75 %	0 %	0 %	384207552
128	NC_017243	ATTT	2	8	57479	57486	25 %	75 %	0 %	0 %	384207552
129	NC_017243	GAAC	2	8	57889	57896	50 %	0 %	25 %	25 %	384207552
130	NC_017243	AATG	2	8	59972	59979	50 %	25 %	25 %	0 %	384207555
131	NC_017243	AAAT	2	8	60007	60014	75 %	25 %	0 %	0 %	384207555
132	NC_017243	ATTA	2	8	60049	60056	50 %	50 %	0 %	0 %	384207555
133	NC_017243	TCAA	2	8	60143	60150	50 %	25 %	0 %	25 %	384207555
134	NC_017243	CTAT	2	8	60343	60350	25 %	50 %	0 %	25 %	384207556
135	NC_017243	AATT	2	8	60381	60388	50 %	50 %	0 %	0 %	384207556
136	NC_017243	AGTA	2	8	60417	60424	50 %	25 %	25 %	0 %	384207556
137	NC_017243	TATT	2	8	60527	60534	25 %	75 %	0 %	0 %	384207556
138	NC_017243	CCAA	2	8	61134	61141	50 %	0 %	0 %	50 %	384207556
139	NC_017243	GTAA	2	8	61614	61621	50 %	25 %	25 %	0 %	384207557
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