MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 8749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017243	TAT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017243	ATT	2	6	11	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017243	TAT	2	6	1352	1357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017243	CCT	2	6	1376	1381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017243	TTA	2	6	1382	1387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017243	TAT	2	6	1409	1414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017243	TTA	2	6	2610	2615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017243	TAT	2	6	2771	2776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017243	ATG	2	6	2819	2824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017243	TGA	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017243	TTA	2	6	3452	3457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017243	TAT	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017243	TTA	2	6	3496	3501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017243	TAA	2	6	5301	5306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017243	TTA	2	6	5319	5324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017243	TAT	2	6	5400	5405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017243	TAT	2	6	5415	5420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017243	TAA	2	6	5518	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017243	ACT	2	6	5658	5663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017243	TAT	2	6	6612	6617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017243	TAA	3	9	6629	6637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017243	ATA	3	9	8528	8536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017243	ATT	2	6	8578	8583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017243	TAT	2	6	8604	8609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017243	ATA	2	6	8816	8821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017243	TAT	2	6	8870	8875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017243	TAA	2	6	8898	8903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017243	TTA	2	6	8916	8921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017243	ATA	2	6	9005	9010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017243	AAT	2	6	9036	9041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017243	ATT	2	6	10735	10740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017243	ATT	2	6	10750	10755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017243	AAT	2	6	10794	10799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017243	ATA	2	6	10828	10833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017243	AAT	2	6	10853	10858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017243	TAA	2	6	10939	10944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017243	ATT	2	6	10945	10950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017243	TAT	2	6	10972	10977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017243	TAA	2	6	10982	10987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017243	GCG	2	6	11017	11022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017243	AGA	2	6	11136	11141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017243	TAA	2	6	11178	11183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017243	ATG	2	6	11184	11189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017243	TAT	2	6	11254	11259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017243	CAT	2	6	11303	11308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017243	TCT	2	6	11330	11335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017243	TAA	4	12	11369	11380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017243	ATT	2	6	11411	11416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017243	ATA	2	6	11419	11424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017243	ATT	2	6	11482	11487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017243	TAA	2	6	11498	11503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017243	TTG	2	6	11505	11510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017243	TAA	2	6	11625	11630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017243	TAA	2	6	11641	11646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017243	TAT	3	9	14560	14568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017243	AAT	2	6	14707	14712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017243	ATT	2	6	14822	14827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017243	CTA	2	6	14838	14843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017243	TTA	2	6	14933	14938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017243	TTA	2	6	14943	14948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017243	TAT	2	6	14995	15000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017243	TTA	2	6	15045	15050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017243	ATT	2	6	15062	15067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017243	TAT	3	9	15090	15098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017243	TAA	2	6	15146	15151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017243	TAA	2	6	15235	15240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017243	TAA	2	6	15253	15258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017243	TAA	2	6	15289	15294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017243	TAA	2	6	15378	15383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017243	ATA	2	6	15392	15397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017243	ATT	2	6	16402	16407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017243	TCT	2	6	16464	16469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017243	TAT	2	6	16497	16502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017243	ATT	3	9	16549	16557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017243	TTA	2	6	16569	16574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017243	TAC	2	6	16583	16588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017243	TGT	2	6	16617	16622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017243	TAT	2	6	16705	16710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017243	GTT	2	6	16757	16762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017243	ATA	2	6	16763	16768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017243	AAT	2	6	16792	16797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017243	TAT	2	6	16825	16830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017243	TGT	2	6	16834	16839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017243	TAT	2	6	16890	16895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017243	TAA	2	6	16952	16957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017243	ATA	2	6	17017	17022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017243	TAT	2	6	17034	17039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017243	ATA	2	6	17054	17059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017243	TAT	2	6	17102	17107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017243	ATG	2	6	17182	17187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017243	TAA	2	6	17190	17195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017243	AAT	2	6	17273	17278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017243	TAT	2	6	17283	17288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017243	AAT	2	6	17310	17315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017243	ATA	2	6	17321	17326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017243	TAA	2	6	17354	17359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017243	TTA	2	6	18598	18603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017243	TAT	2	6	18762	18767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017243	GCT	2	6	19997	20002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017243	TCC	2	6	20026	20031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017243	ATT	2	6	20094	20099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017243	TTA	2	6	20121	20126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017243	TAT	2	6	20139	20144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017243	TTA	2	6	20203	20208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017243	ATA	2	6	21690	21695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017243	ATA	2	6	22915	22920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017243	CAA	2	6	22987	22992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017243	TTA	2	6	23000	23005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017243	ATA	2	6	23876	23881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017243	AAT	2	6	24417	24422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017243	CCG	2	6	24617	24622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017243	ATA	3	9	24872	24880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017243	ATT	2	6	26246	26251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017243	ATA	2	6	26342	26347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017243	ATA	2	6	26353	26358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017243	TAA	2	6	26614	26619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017243	TTA	2	6	26837	26842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017243	TAA	2	6	26927	26932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017243	ATT	2	6	26940	26945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017243	TAT	2	6	28124	28129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017243	ATT	2	6	28132	28137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017243	AAT	2	6	28149	28154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017243	TAT	2	6	28235	28240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017243	CAA	2	6	28252	28257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017243	TTA	2	6	28269	28274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017243	TTA	2	6	28284	28289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017243	TAA	2	6	28314	28319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017243	TTA	2	6	29128	29133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017243	TAT	2	6	29140	29145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017243	TTG	2	6	29161	29166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017243	TTA	2	6	31586	31591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017243	TAT	2	6	31608	31613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017243	AAT	2	6	31651	31656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017243	ATA	2	6	31659	31664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017243	TAA	2	6	31729	31734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017243	TAT	2	6	31751	31756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017243	TAA	2	6	31759	31764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017243	GAT	2	6	31769	31774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017243	AAT	2	6	31825	31830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017243	ATA	2	6	31838	31843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017243	TAT	2	6	32550	32555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017243	TAT	2	6	32595	32600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017243	TAT	2	6	32626	32631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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