MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 12639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017243	TA	3	6	489	494	50 %	50 %	0 %	0 %	384207497
2	NC_017243	AT	3	6	1974	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	384207499
3	NC_017243	AT	3	6	2108	2113	50 %	50 %	0 %	0 %	384207499
4	NC_017243	TA	3	6	2413	2418	50 %	50 %	0 %	0 %	384207499
5	NC_017243	TA	4	8	2599	2606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017243	TA	3	6	3048	3053	50 %	50 %	0 %	0 %	384207500
7	NC_017243	AT	3	6	3108	3113	50 %	50 %	0 %	0 %	384207500
8	NC_017243	TA	4	8	3566	3573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017243	AT	3	6	3581	3586	50 %	50 %	0 %	0 %	384207501
10	NC_017243	AT	3	6	3799	3804	50 %	50 %	0 %	0 %	384207501
11	NC_017243	TC	3	6	3995	4000	0 %	50 %	0 %	50 %	384207501
12	NC_017243	TA	3	6	4013	4018	50 %	50 %	0 %	0 %	384207501
13	NC_017243	AT	3	6	4710	4715	50 %	50 %	0 %	0 %	384207502
14	NC_017243	AT	3	6	5151	5156	50 %	50 %	0 %	0 %	384207502
15	NC_017243	TA	3	6	5346	5351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017243	TA	3	6	5432	5437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017243	AT	3	6	5665	5670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017243	CT	3	6	6228	6233	0 %	50 %	0 %	50 %	384207503
19	NC_017243	AT	3	6	6433	6438	50 %	50 %	0 %	0 %	384207503
20	NC_017243	AT	3	6	6462	6467	50 %	50 %	0 %	0 %	384207503
21	NC_017243	TA	3	6	6597	6602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017243	AT	3	6	6616	6621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017243	AT	3	6	6957	6962	50 %	50 %	0 %	0 %	384207504
24	NC_017243	TA	3	6	7409	7414	50 %	50 %	0 %	0 %	384207504
25	NC_017243	CT	3	6	7979	7984	0 %	50 %	0 %	50 %	384207506
26	NC_017243	TA	3	6	8086	8091	50 %	50 %	0 %	0 %	384207506
27	NC_017243	TA	3	6	8138	8143	50 %	50 %	0 %	0 %	384207506
28	NC_017243	AT	3	6	8177	8182	50 %	50 %	0 %	0 %	384207506
29	NC_017243	TA	3	6	8696	8701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017243	TC	3	6	9072	9077	0 %	50 %	0 %	50 %	384207507
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32	NC_017243	AT	3	6	9725	9730	50 %	50 %	0 %	0 %	384207507
33	NC_017243	TA	3	6	10056	10061	50 %	50 %	0 %	0 %	384207507
34	NC_017243	TC	3	6	10088	10093	0 %	50 %	0 %	50 %	384207507
35	NC_017243	TA	3	6	10359	10364	50 %	50 %	0 %	0 %	384207507
36	NC_017243	TA	3	6	10554	10559	50 %	50 %	0 %	0 %	384207507
37	NC_017243	TA	3	6	10840	10845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017243	AT	3	6	10873	10878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017243	AT	4	8	11094	11101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017243	AT	3	6	11402	11407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017243	AT	3	6	11459	11464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017243	AT	3	6	11771	11776	50 %	50 %	0 %	0 %	384207508
43	NC_017243	AT	3	6	11926	11931	50 %	50 %	0 %	0 %	384207508
44	NC_017243	AT	3	6	12070	12075	50 %	50 %	0 %	0 %	384207508
45	NC_017243	TA	4	8	12083	12090	50 %	50 %	0 %	0 %	384207508
46	NC_017243	AT	3	6	12118	12123	50 %	50 %	0 %	0 %	384207508
47	NC_017243	AT	3	6	12235	12240	50 %	50 %	0 %	0 %	384207508
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50	NC_017243	AT	3	6	12466	12471	50 %	50 %	0 %	0 %	384207509
51	NC_017243	GA	3	6	12548	12553	50 %	0 %	50 %	0 %	384207509
52	NC_017243	TA	3	6	12572	12577	50 %	50 %	0 %	0 %	384207509
53	NC_017243	TA	3	6	12741	12746	50 %	50 %	0 %	0 %	384207509
54	NC_017243	TA	3	6	12854	12859	50 %	50 %	0 %	0 %	384207509
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63	NC_017243	AT	3	6	14531	14536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017243	TA	3	6	14682	14687	50 %	50 %	0 %	0 %	384207512
65	NC_017243	AT	4	8	14782	14789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017243	AT	3	6	14915	14920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017243	TA	3	6	15170	15175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017243	AT	3	6	15438	15443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017243	AT	3	6	15558	15563	50 %	50 %	0 %	0 %	384207513
70	NC_017243	TA	3	6	16349	16354	50 %	50 %	0 %	0 %	384207513
71	NC_017243	TA	3	6	16366	16371	50 %	50 %	0 %	0 %	384207513
72	NC_017243	AT	3	6	16393	16398	50 %	50 %	0 %	0 %	384207513
73	NC_017243	AT	3	6	16417	16422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017243	TA	3	6	16424	16429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017243	AT	3	6	16454	16459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017243	TA	3	6	16543	16548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017243	AT	3	6	16634	16639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85	NC_017243	TA	4	8	17219	17226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_017243	AT	5	10	18691	18700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017243	TA	3	6	18737	18742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_017243	AT	3	6	23610	23615	50 %	50 %	0 %	0 %	384207520
111	NC_017243	AT	3	6	23656	23661	50 %	50 %	0 %	0 %	384207520
112	NC_017243	TC	3	6	23956	23961	0 %	50 %	0 %	50 %	384207521
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114	NC_017243	AT	3	6	24639	24644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017243	TA	3	6	24828	24833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017243	GA	3	6	24889	24894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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118	NC_017243	AT	3	6	26115	26120	50 %	50 %	0 %	0 %	384207522
119	NC_017243	TA	3	6	26278	26283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017243	AT	3	6	26744	26749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017243	AT	3	6	27144	27149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017243	AT	4	8	28198	28205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_017243	TA	4	8	28348	28355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017243	TA	3	6	28370	28375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017243	AT	3	6	28781	28786	50 %	50 %	0 %	0 %	384207525
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128	NC_017243	AT	3	6	29100	29105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017243	TA	3	6	29217	29222	50 %	50 %	0 %	0 %	384207526
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131	NC_017243	AT	3	6	29520	29525	50 %	50 %	0 %	0 %	384207526
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133	NC_017243	AG	3	6	30641	30646	50 %	0 %	50 %	0 %	384207526
134	NC_017243	AT	3	6	30799	30804	50 %	50 %	0 %	0 %	384207526
135	NC_017243	GA	3	6	31252	31257	50 %	0 %	50 %	0 %	384207526
136	NC_017243	AG	3	6	31337	31342	50 %	0 %	50 %	0 %	384207526
137	NC_017243	TA	3	6	31513	31518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017243	AT	3	6	31612	31617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017243	TA	3	6	31671	31676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017243	AT	5	10	32243	32252	50 %	50 %	0 %	0 %	384207527
141	NC_017243	AT	3	6	32717	32722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017243	AT	3	6	32729	32734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_017243	AT	3	6	34002	34007	50 %	50 %	0 %	0 %	384207529
148	NC_017243	TA	3	6	34420	34425	50 %	50 %	0 %	0 %	384207529
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