MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A plasmid pInt

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017242	TAT	2	6	18	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017242	CAA	2	6	125	130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017242	TTA	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017242	CAT	3	9	181	189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017242	ATA	2	6	263	268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017242	ATA	2	6	426	431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207493
7	NC_017242	GAT	2	6	440	445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207493
8	NC_017242	ACT	2	6	471	476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207493
9	NC_017242	AAT	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207493
10	NC_017242	ACT	2	6	595	600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207493
11	NC_017242	TGT	2	6	628	633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207493
12	NC_017242	ATC	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207493
13	NC_017242	ATT	2	6	693	698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207493
14	NC_017242	ATA	2	6	702	707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207493
15	NC_017242	ATT	2	6	738	743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207493
16	NC_017242	AAG	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207493
17	NC_017242	ATG	3	9	777	785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207493
18	NC_017242	ATT	2	6	843	848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207493
19	NC_017242	ATA	2	6	866	871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207493
20	NC_017242	TAA	2	6	1072	1077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207493
21	NC_017242	TAA	2	6	1102	1107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207493
22	NC_017242	GAT	2	6	1145	1150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207493
23	NC_017242	TTG	2	6	1175	1180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207493
24	NC_017242	TAA	2	6	1213	1218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207493
25	NC_017242	TAA	2	6	1225	1230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207493
26	NC_017242	GAT	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207493
27	NC_017242	ATA	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207493
28	NC_017242	AAC	2	6	1274	1279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207493
29	NC_017242	CTT	2	6	1358	1363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207493
30	NC_017242	ATT	2	6	1413	1418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207493
31	NC_017242	ATT	2	6	1543	1548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207493
32	NC_017242	ATG	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017242	AAT	2	6	1615	1620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017242	TAG	2	6	1638	1643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017242	TTA	2	6	1672	1677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017242	TGT	2	6	1742	1747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017242	ATA	2	6	1865	1870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207494
38	NC_017242	ATC	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207494
39	NC_017242	GTA	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207494
40	NC_017242	ATT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207494
41	NC_017242	AGT	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207494
42	NC_017242	TAC	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207494
43	NC_017242	GAC	2	6	2167	2172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207494
44	NC_017242	TAA	2	6	2187	2192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207494
45	NC_017242	TAA	2	6	2226	2231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207494
46	NC_017242	TAT	2	6	2298	2303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017242	TAT	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017242	ATT	2	6	2423	2428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017242	ATT	2	6	2434	2439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017242	TTA	2	6	2458	2463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017242	ATA	2	6	2464	2469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017242	TAA	2	6	2502	2507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017242	AAT	2	6	2619	2624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207495
54	NC_017242	ATT	2	6	2861	2866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017242	TAT	2	6	3106	3111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017242	CAG	2	6	3122	3127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.