MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	TTAATT	2	12	2181	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017240	TAAAAA	2	12	3334	3345	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384207336
3	NC_017240	AAATAA	2	12	4317	4328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017240	TGATAA	2	12	4425	4436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017240	ATTACT	2	12	6121	6132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017240	AAAACC	2	12	7720	7731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207343
7	NC_017240	ACTGGT	2	12	8456	8467	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384207343
8	NC_017240	AAAGAA	2	12	9197	9208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384207343
9	NC_017240	AAAATA	2	12	10209	10220	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384207343
10	NC_017240	TATGAA	2	12	10310	10321	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384207343
11	NC_017240	TTAATT	2	12	10552	10563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017240	TAAAAT	2	12	10992	11003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017240	AAAAGT	2	12	13612	13623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384207351
14	NC_017240	TAATGA	2	12	14728	14739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384207353
15	NC_017240	TAAAAT	2	12	16417	16428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017240	TAAAAA	2	12	18733	18744	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384207359
17	NC_017240	TTTTCT	2	12	21346	21357	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384207364
18	NC_017240	TTTATA	2	12	22560	22571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017240	TCTGAT	2	12	23411	23422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384207367
20	NC_017240	AGTAAA	2	12	23491	23502	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017240	CAATAT	2	12	24175	24186	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384207369
22	NC_017240	TTCAAT	2	12	25030	25041	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384207370
23	NC_017240	GAGTTA	2	12	29578	29589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.