MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	CCATC	2	10	1002	1011	20 %	20 %	0 %	60 %	384207331
2	NC_017240	AAAGG	2	10	1373	1382	60 %	0 %	40 %	0 %	384207332
3	NC_017240	AGAAA	2	10	1583	1592	80 %	0 %	20 %	0 %	384207333
4	NC_017240	AAAAT	2	10	1728	1737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017240	TATTT	2	10	2080	2089	20 %	80 %	0 %	0 %	384207334
6	NC_017240	TTTCA	2	10	2306	2315	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017240	AATTA	2	10	2438	2447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017240	TAAAA	2	10	2543	2552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017240	AGCAA	2	10	2781	2790	60 %	0 %	20 %	20 %	384207335
10	NC_017240	TAATT	2	10	3236	3245	40 %	60 %	0 %	0 %	384207336
11	NC_017240	ATTTA	2	10	3403	3412	40 %	60 %	0 %	0 %	384207336
12	NC_017240	AAAAT	2	10	3937	3946	80 %	20 %	0 %	0 %	384207337
13	NC_017240	TAGAT	2	10	4866	4875	40 %	40 %	20 %	0 %	384207338
14	NC_017240	AAATA	2	10	6108	6117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017240	CAAAT	2	10	6134	6143	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017240	TATTT	2	10	7423	7432	20 %	80 %	0 %	0 %	384207343
17	NC_017240	TTAAT	2	10	8859	8868	40 %	60 %	0 %	0 %	384207343
18	NC_017240	TACAG	2	10	9627	9636	40 %	20 %	20 %	20 %	384207343
19	NC_017240	TATAC	2	10	10752	10761	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017240	TTACA	2	10	10903	10912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017240	TGTAG	2	10	10975	10984	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017240	TTTTA	2	10	11700	11709	20 %	80 %	0 %	0 %	384207345
23	NC_017240	AATTG	2	10	12012	12021	40 %	40 %	20 %	0 %	384207345
24	NC_017240	AAAAC	2	10	12357	12366	80 %	0 %	0 %	20 %	384207347
25	NC_017240	CAAAC	2	10	13510	13519	60 %	0 %	0 %	40 %	384207351
26	NC_017240	TATGT	2	10	13577	13586	20 %	60 %	20 %	0 %	384207351
27	NC_017240	ACAAA	2	10	13734	13743	80 %	0 %	0 %	20 %	384207351
28	NC_017240	TAAAA	2	10	14945	14954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017240	CACTT	2	10	15705	15714	20 %	40 %	0 %	40 %	384207355
30	NC_017240	AATTT	2	10	16096	16105	40 %	60 %	0 %	0 %	384207356
31	NC_017240	TTACA	2	10	16328	16337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017240	TGTAG	2	10	16400	16409	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017240	TTAAA	2	10	16754	16763	60 %	40 %	0 %	0 %	384207357
34	NC_017240	TTTTA	2	10	17118	17127	20 %	80 %	0 %	0 %	384207357
35	NC_017240	AAAAG	2	10	17511	17520	80 %	0 %	20 %	0 %	384207357
36	NC_017240	CAAAA	2	10	19406	19415	80 %	0 %	0 %	20 %	384207360
37	NC_017240	TTATT	2	10	20217	20226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017240	TTTTG	2	10	21900	21909	0 %	80 %	20 %	0 %	384207365
39	NC_017240	AGGGA	2	10	22248	22257	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017240	TTAAT	2	10	23191	23200	40 %	60 %	0 %	0 %	384207367
41	NC_017240	ATAAA	2	10	23547	23556	80 %	20 %	0 %	0 %	384207368
42	NC_017240	TTTTG	2	10	24165	24174	0 %	80 %	20 %	0 %	384207369
43	NC_017240	TCAAA	2	10	24705	24714	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017240	GAATA	2	10	24894	24903	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017240	AAATT	2	10	25376	25385	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017240	TAAAT	2	10	25505	25514	60 %	40 %	0 %	0 %	384207371
47	NC_017240	TCAAA	2	10	25749	25758	60 %	20 %	0 %	20 %	384207371
48	NC_017240	AAAAC	2	10	26183	26192	80 %	0 %	0 %	20 %	384207371
49	NC_017240	AAATT	2	10	26439	26448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017240	TTAAA	2	10	26480	26489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017240	CTTTT	2	10	26953	26962	0 %	80 %	0 %	20 %	384207374
52	NC_017240	TTATC	2	10	27163	27172	20 %	60 %	0 %	20 %	384207374
53	NC_017240	GATTG	2	10	27561	27570	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017240	TATAA	2	10	28582	28591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.