MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	AAAAT	2	10	1728	1737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017240	TTTCA	2	10	2306	2315	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017240	AATTA	2	10	2438	2447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017240	TAAAA	2	10	2543	2552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017240	AAATA	2	10	6108	6117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017240	CAAAT	2	10	6134	6143	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017240	TATAC	2	10	10752	10761	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017240	TTACA	2	10	10903	10912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017240	TGTAG	2	10	10975	10984	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017240	TAAAA	2	10	14945	14954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017240	TTACA	2	10	16328	16337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017240	TGTAG	2	10	16400	16409	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017240	TTATT	2	10	20217	20226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017240	AGGGA	2	10	22248	22257	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017240	TCAAA	2	10	24705	24714	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017240	GAATA	2	10	24894	24903	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017240	AAATT	2	10	25376	25385	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017240	AAATT	2	10	26439	26448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017240	TTAAA	2	10	26480	26489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017240	GATTG	2	10	27561	27570	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017240	TATAA	2	10	28582	28591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.