MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	ATTT	2	8	112	119	25 %	75 %	0 %	0 %	384207329
2	NC_017240	ATTA	2	8	487	494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017240	TTTA	2	8	593	600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017240	GTTA	2	8	1059	1066	25 %	50 %	25 %	0 %	384207331
5	NC_017240	TGAT	2	8	1116	1123	25 %	50 %	25 %	0 %	384207332
6	NC_017240	ATAA	2	8	1412	1419	75 %	25 %	0 %	0 %	384207332
7	NC_017240	AAAT	2	8	1540	1547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017240	TTAT	2	8	1848	1855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017240	TAAA	2	8	2454	2461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017240	AGAA	2	8	2625	2632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017240	ATAA	2	8	3165	3172	75 %	25 %	0 %	0 %	384207336
12	NC_017240	AATA	2	8	3443	3450	75 %	25 %	0 %	0 %	384207336
13	NC_017240	ATTT	2	8	3621	3628	25 %	75 %	0 %	0 %	384207336
14	NC_017240	TTTA	2	8	3736	3743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017240	ATAA	2	8	4122	4129	75 %	25 %	0 %	0 %	384207337
16	NC_017240	TAAA	2	8	4153	4160	75 %	25 %	0 %	0 %	384207337
17	NC_017240	TAAA	2	8	4535	4542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017240	TTAA	2	8	4638	4645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017240	TAAA	2	8	4913	4920	75 %	25 %	0 %	0 %	384207338
20	NC_017240	ATTT	2	8	5047	5054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017240	GGGT	2	8	6069	6076	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017240	TAAA	2	8	6327	6334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017240	ATTT	2	8	6397	6404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017240	TCTT	2	8	6511	6518	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017240	TAAA	2	8	6647	6654	75 %	25 %	0 %	0 %	384207341
26	NC_017240	ATAA	2	8	7213	7220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017240	TAAA	2	8	7524	7531	75 %	25 %	0 %	0 %	384207343
28	NC_017240	AAAT	2	8	7749	7756	75 %	25 %	0 %	0 %	384207343
29	NC_017240	CTTT	2	8	7831	7838	0 %	75 %	0 %	25 %	384207343
30	NC_017240	AATT	2	8	7863	7870	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
31	NC_017240	TATT	2	8	8016	8023	25 %	75 %	0 %	0 %	384207343
32	NC_017240	ATAC	2	8	8851	8858	50 %	25 %	0 %	25 %	384207343
33	NC_017240	CTAG	2	8	9221	9228	25 %	25 %	25 %	25 %	384207343
34	NC_017240	AAAC	2	8	9481	9488	75 %	0 %	0 %	25 %	384207343
35	NC_017240	AAAT	2	8	9526	9533	75 %	25 %	0 %	0 %	384207343
36	NC_017240	TTTA	2	8	9653	9660	25 %	75 %	0 %	0 %	384207343
37	NC_017240	AGGC	2	8	9840	9847	25 %	0 %	50 %	25 %	384207343
38	NC_017240	TAAA	2	8	10605	10612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017240	TTAT	2	8	10625	10632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017240	TATT	2	8	10692	10699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017240	AATT	2	8	10742	10749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017240	ATTT	2	8	11006	11013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017240	CTAG	2	8	11144	11151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017240	AAAT	2	8	11829	11836	75 %	25 %	0 %	0 %	384207345
45	NC_017240	ACTA	2	8	12191	12198	50 %	25 %	0 %	25 %	384207346
46	NC_017240	ATTT	2	8	12550	12557	25 %	75 %	0 %	0 %	384207347
47	NC_017240	TTAC	2	8	12737	12744	25 %	50 %	0 %	25 %	384207347
48	NC_017240	ACTT	2	8	12842	12849	25 %	50 %	0 %	25 %	384207348
49	NC_017240	TAAT	2	8	13024	13031	50 %	50 %	0 %	0 %	384207349
50	NC_017240	ACCT	2	8	13087	13094	25 %	25 %	0 %	50 %	384207350
51	NC_017240	AAAC	2	8	13180	13187	75 %	0 %	0 %	25 %	384207350
52	NC_017240	ATTA	2	8	13462	13469	50 %	50 %	0 %	0 %	384207351
53	NC_017240	ACTA	2	8	13851	13858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017240	TGAA	2	8	13963	13970	50 %	25 %	25 %	0 %	384207352
55	NC_017240	TGTT	2	8	14693	14700	0 %	75 %	25 %	0 %	384207353
56	NC_017240	CAAA	2	8	15084	15091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017240	TAAT	2	8	15598	15605	50 %	50 %	0 %	0 %	384207355
58	NC_017240	AACC	2	8	15767	15774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017240	TAAA	3	12	16219	16230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017240	ATTT	2	8	16431	16438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017240	TAAT	2	8	16463	16470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017240	ATTA	2	8	16543	16550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017240	AAAT	2	8	17247	17254	75 %	25 %	0 %	0 %	384207357
64	NC_017240	ATTT	2	8	17748	17755	25 %	75 %	0 %	0 %	384207358
65	NC_017240	AAAC	2	8	17987	17994	75 %	0 %	0 %	25 %	384207358
66	NC_017240	GAAT	2	8	18107	18114	50 %	25 %	25 %	0 %	384207358
67	NC_017240	GATA	2	8	18332	18339	50 %	25 %	25 %	0 %	384207359
68	NC_017240	TAAA	2	8	18508	18515	75 %	25 %	0 %	0 %	384207359
69	NC_017240	ATCC	2	8	18527	18534	25 %	25 %	0 %	50 %	384207359
70	NC_017240	TAAA	2	8	18859	18866	75 %	25 %	0 %	0 %	384207359
71	NC_017240	TATG	2	8	18947	18954	25 %	50 %	25 %	0 %	384207359
72	NC_017240	TAAA	2	8	18965	18972	75 %	25 %	0 %	0 %	384207359
73	NC_017240	TAAA	2	8	18996	19003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017240	AAAG	2	8	19450	19457	75 %	0 %	25 %	0 %	384207360
75	NC_017240	GAAT	2	8	19632	19639	50 %	25 %	25 %	0 %	384207361
76	NC_017240	AGAT	2	8	19931	19938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017240	AGAT	2	8	19952	19959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017240	TAAG	2	8	20442	20449	50 %	25 %	25 %	0 %	384207362
79	NC_017240	AAGC	2	8	20527	20534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017240	ATTT	2	8	20709	20716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017240	AAAT	2	8	20845	20852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017240	ATAA	3	12	20899	20910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017240	GCTC	2	8	21448	21455	0 %	25 %	25 %	50 %	384207364
84	NC_017240	ATTT	2	8	22016	22023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017240	TAAA	2	8	22032	22039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017240	ACTT	2	8	23930	23937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017240	TTTA	2	8	24044	24051	25 %	75 %	0 %	0 %	384207369
88	NC_017240	AAAC	2	8	24613	24620	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017240	CAAA	2	8	25591	25598	75 %	0 %	0 %	25 %	384207371
90	NC_017240	ATTT	2	8	26460	26467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017240	TGCT	2	8	26756	26763	0 %	50 %	25 %	25 %	384207374
92	NC_017240	AAGA	2	8	27990	27997	75 %	0 %	25 %	0 %	384207377
93	NC_017240	GCTT	2	8	28343	28350	0 %	50 %	25 %	25 %	384207379
94	NC_017240	AGAT	2	8	28827	28834	50 %	25 %	25 %	0 %	384207380
95	NC_017240	AGAT	2	8	28881	28888	50 %	25 %	25 %	0 %	384207380
96	NC_017240	AGAT	2	8	28914	28921	50 %	25 %	25 %	0 %	384207380
97	NC_017240	AGAT	2	8	28947	28954	50 %	25 %	25 %	0 %	384207380
98	NC_017240	AGAT	2	8	28980	28987	50 %	25 %	25 %	0 %	384207380
99	NC_017240	ATTA	2	8	29260	29267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017240	ATTA	3	12	29273	29284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017240	TTGA	2	8	29484	29491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017240	GCAA	2	8	29623	29630	50 %	0 %	25 %	25 %	384207381
103	NC_017240	TAAT	2	8	29693	29700	50 %	50 %	0 %	0 %	384207381
104	NC_017240	ATAG	2	8	29714	29721	50 %	25 %	25 %	0 %	384207381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.