MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	ATTA	2	8	487	494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017240	TTTA	2	8	593	600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017240	AAAT	2	8	1540	1547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017240	TTAT	2	8	1848	1855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017240	TAAA	2	8	2454	2461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017240	AGAA	2	8	2625	2632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017240	TTTA	2	8	3736	3743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017240	TAAA	2	8	4535	4542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017240	TTAA	2	8	4638	4645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017240	ATTT	2	8	5047	5054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017240	GGGT	2	8	6069	6076	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017240	TAAA	2	8	6327	6334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017240	ATTT	2	8	6397	6404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017240	TCTT	2	8	6511	6518	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017240	ATAA	2	8	7213	7220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017240	TAAA	2	8	10605	10612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017240	TTAT	2	8	10625	10632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017240	TATT	2	8	10692	10699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017240	AATT	2	8	10742	10749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017240	ATTT	2	8	11006	11013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017240	CTAG	2	8	11144	11151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017240	ACTA	2	8	13851	13858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017240	CAAA	2	8	15084	15091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017240	AACC	2	8	15767	15774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017240	TAAA	3	12	16219	16230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017240	ATTT	2	8	16431	16438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017240	TAAT	2	8	16463	16470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017240	ATTA	2	8	16543	16550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017240	TAAA	2	8	18996	19003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017240	AGAT	2	8	19931	19938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017240	AGAT	2	8	19952	19959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017240	AAGC	2	8	20527	20534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017240	ATTT	2	8	20709	20716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017240	AAAT	2	8	20845	20852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017240	ATAA	3	12	20899	20910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017240	ATTT	2	8	22016	22023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017240	TAAA	2	8	22032	22039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017240	ACTT	2	8	23930	23937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017240	AAAC	2	8	24613	24620	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017240	ATTT	2	8	26460	26467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017240	ATTA	2	8	29260	29267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017240	ATTA	3	12	29273	29284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017240	TTGA	2	8	29484	29491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.