MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	ATTT	2	8	112	119	25 %	75 %	0 %	0 %	384207329
2	NC_017240	GTTA	2	8	1059	1066	25 %	50 %	25 %	0 %	384207331
3	NC_017240	TGAT	2	8	1116	1123	25 %	50 %	25 %	0 %	384207332
4	NC_017240	ATAA	2	8	1412	1419	75 %	25 %	0 %	0 %	384207332
5	NC_017240	ATAA	2	8	3165	3172	75 %	25 %	0 %	0 %	384207336
6	NC_017240	AATA	2	8	3443	3450	75 %	25 %	0 %	0 %	384207336
7	NC_017240	ATTT	2	8	3621	3628	25 %	75 %	0 %	0 %	384207336
8	NC_017240	ATAA	2	8	4122	4129	75 %	25 %	0 %	0 %	384207337
9	NC_017240	TAAA	2	8	4153	4160	75 %	25 %	0 %	0 %	384207337
10	NC_017240	TAAA	2	8	4913	4920	75 %	25 %	0 %	0 %	384207338
11	NC_017240	TAAA	2	8	6647	6654	75 %	25 %	0 %	0 %	384207341
12	NC_017240	TAAA	2	8	7524	7531	75 %	25 %	0 %	0 %	384207343
13	NC_017240	AAAT	2	8	7749	7756	75 %	25 %	0 %	0 %	384207343
14	NC_017240	CTTT	2	8	7831	7838	0 %	75 %	0 %	25 %	384207343
15	NC_017240	AATT	2	8	7863	7870	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
16	NC_017240	TATT	2	8	8016	8023	25 %	75 %	0 %	0 %	384207343
17	NC_017240	ATAC	2	8	8851	8858	50 %	25 %	0 %	25 %	384207343
18	NC_017240	CTAG	2	8	9221	9228	25 %	25 %	25 %	25 %	384207343
19	NC_017240	AAAC	2	8	9481	9488	75 %	0 %	0 %	25 %	384207343
20	NC_017240	AAAT	2	8	9526	9533	75 %	25 %	0 %	0 %	384207343
21	NC_017240	TTTA	2	8	9653	9660	25 %	75 %	0 %	0 %	384207343
22	NC_017240	AGGC	2	8	9840	9847	25 %	0 %	50 %	25 %	384207343
23	NC_017240	AAAT	2	8	11829	11836	75 %	25 %	0 %	0 %	384207345
24	NC_017240	ACTA	2	8	12191	12198	50 %	25 %	0 %	25 %	384207346
25	NC_017240	ATTT	2	8	12550	12557	25 %	75 %	0 %	0 %	384207347
26	NC_017240	TTAC	2	8	12737	12744	25 %	50 %	0 %	25 %	384207347
27	NC_017240	ACTT	2	8	12842	12849	25 %	50 %	0 %	25 %	384207348
28	NC_017240	TAAT	2	8	13024	13031	50 %	50 %	0 %	0 %	384207349
29	NC_017240	ACCT	2	8	13087	13094	25 %	25 %	0 %	50 %	384207350
30	NC_017240	AAAC	2	8	13180	13187	75 %	0 %	0 %	25 %	384207350
31	NC_017240	ATTA	2	8	13462	13469	50 %	50 %	0 %	0 %	384207351
32	NC_017240	TGAA	2	8	13963	13970	50 %	25 %	25 %	0 %	384207352
33	NC_017240	TGTT	2	8	14693	14700	0 %	75 %	25 %	0 %	384207353
34	NC_017240	TAAT	2	8	15598	15605	50 %	50 %	0 %	0 %	384207355
35	NC_017240	AAAT	2	8	17247	17254	75 %	25 %	0 %	0 %	384207357
36	NC_017240	ATTT	2	8	17748	17755	25 %	75 %	0 %	0 %	384207358
37	NC_017240	AAAC	2	8	17987	17994	75 %	0 %	0 %	25 %	384207358
38	NC_017240	GAAT	2	8	18107	18114	50 %	25 %	25 %	0 %	384207358
39	NC_017240	GATA	2	8	18332	18339	50 %	25 %	25 %	0 %	384207359
40	NC_017240	TAAA	2	8	18508	18515	75 %	25 %	0 %	0 %	384207359
41	NC_017240	ATCC	2	8	18527	18534	25 %	25 %	0 %	50 %	384207359
42	NC_017240	TAAA	2	8	18859	18866	75 %	25 %	0 %	0 %	384207359
43	NC_017240	TATG	2	8	18947	18954	25 %	50 %	25 %	0 %	384207359
44	NC_017240	TAAA	2	8	18965	18972	75 %	25 %	0 %	0 %	384207359
45	NC_017240	AAAG	2	8	19450	19457	75 %	0 %	25 %	0 %	384207360
46	NC_017240	GAAT	2	8	19632	19639	50 %	25 %	25 %	0 %	384207361
47	NC_017240	TAAG	2	8	20442	20449	50 %	25 %	25 %	0 %	384207362
48	NC_017240	GCTC	2	8	21448	21455	0 %	25 %	25 %	50 %	384207364
49	NC_017240	TTTA	2	8	24044	24051	25 %	75 %	0 %	0 %	384207369
50	NC_017240	CAAA	2	8	25591	25598	75 %	0 %	0 %	25 %	384207371
51	NC_017240	TGCT	2	8	26756	26763	0 %	50 %	25 %	25 %	384207374
52	NC_017240	AAGA	2	8	27990	27997	75 %	0 %	25 %	0 %	384207377
53	NC_017240	GCTT	2	8	28343	28350	0 %	50 %	25 %	25 %	384207379
54	NC_017240	AGAT	2	8	28827	28834	50 %	25 %	25 %	0 %	384207380
55	NC_017240	AGAT	2	8	28881	28888	50 %	25 %	25 %	0 %	384207380
56	NC_017240	AGAT	2	8	28914	28921	50 %	25 %	25 %	0 %	384207380
57	NC_017240	AGAT	2	8	28947	28954	50 %	25 %	25 %	0 %	384207380
58	NC_017240	AGAT	2	8	28980	28987	50 %	25 %	25 %	0 %	384207380
59	NC_017240	GCAA	2	8	29623	29630	50 %	0 %	25 %	25 %	384207381
60	NC_017240	TAAT	2	8	29693	29700	50 %	50 %	0 %	0 %	384207381
61	NC_017240	ATAG	2	8	29714	29721	50 %	25 %	25 %	0 %	384207381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.