MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 425

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	AGA	2	6	11	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207329
2	NC_017240	ATT	2	6	54	59	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207329
3	NC_017240	TAG	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207329
4	NC_017240	TGT	2	6	257	262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017240	CAA	2	6	288	293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207330
6	NC_017240	CAA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207330
7	NC_017240	TTG	2	6	343	348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207330
8	NC_017240	AAT	2	6	424	429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207330
9	NC_017240	TAA	2	6	476	481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017240	TTA	3	9	504	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017240	ATT	2	6	518	523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017240	TAA	2	6	525	530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017240	ATA	2	6	547	552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017240	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017240	AAT	2	6	723	728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017240	ATT	2	6	753	758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207331
17	NC_017240	TAT	2	6	847	852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207331
18	NC_017240	TTA	2	6	884	889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207331
19	NC_017240	TAA	2	6	971	976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207331
20	NC_017240	CTC	2	6	1125	1130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207332
21	NC_017240	TTA	2	6	1305	1310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207332
22	NC_017240	ATT	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207332
23	NC_017240	CTT	2	6	1431	1436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207332
24	NC_017240	ATT	2	6	1534	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017240	ATA	2	6	1650	1655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207333
26	NC_017240	ATG	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207333
27	NC_017240	TAA	2	6	1681	1686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207333
28	NC_017240	ATG	2	6	1787	1792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017240	ATA	2	6	1982	1987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207334
30	NC_017240	TGT	2	6	2053	2058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207334
31	NC_017240	TTA	2	6	2372	2377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017240	TAT	2	6	2407	2412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017240	AAT	2	6	2490	2495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017240	AGC	2	6	2505	2510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017240	AGA	2	6	2613	2618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017240	AAG	2	6	2636	2641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017240	AGA	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017240	AAT	2	6	2688	2693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017240	AAT	2	6	2760	2765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207335
40	NC_017240	AAT	2	6	2823	2828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207335
41	NC_017240	GAA	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207335
42	NC_017240	TTA	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207335
43	NC_017240	TCA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017240	AGA	2	6	3018	3023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017240	AGA	2	6	3074	3079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017240	GAA	2	6	3096	3101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017240	ATT	2	6	3177	3182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
48	NC_017240	AAC	2	6	3214	3219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207336
49	NC_017240	ATT	2	6	3307	3312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
50	NC_017240	AGA	2	6	3347	3352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207336
51	NC_017240	TAG	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207336
52	NC_017240	AGA	2	6	3422	3427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207336
53	NC_017240	ATT	2	6	3529	3534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
54	NC_017240	ATT	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
55	NC_017240	AAT	2	6	3569	3574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207336
56	NC_017240	ATT	3	9	3594	3602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
57	NC_017240	ATT	2	6	3631	3636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
58	NC_017240	ATA	2	6	3763	3768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017240	TTG	2	6	3958	3963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207337
60	NC_017240	AAT	2	6	3980	3985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207337
61	NC_017240	GAT	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207337
62	NC_017240	GAA	2	6	4011	4016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207337
63	NC_017240	TAA	2	6	4027	4032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207337
64	NC_017240	AGA	2	6	4091	4096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207337
65	NC_017240	ATA	2	6	4161	4166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207337
66	NC_017240	ACT	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017240	TAA	3	9	4357	4365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017240	TAT	2	6	4372	4377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017240	AAT	2	6	4395	4400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017240	TAT	2	6	4554	4559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017240	TAA	2	6	4562	4567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017240	TAA	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017240	GGA	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207338
74	NC_017240	AGA	2	6	4758	4763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207338
75	NC_017240	TAA	2	6	4764	4769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207338
76	NC_017240	TGA	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207338
77	NC_017240	TAA	2	6	4926	4931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207338
78	NC_017240	TAA	2	6	4950	4955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207338
79	NC_017240	ATA	2	6	4988	4993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207338
80	NC_017240	GAT	2	6	5173	5178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207339
81	NC_017240	CAT	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207339
82	NC_017240	TTA	2	6	5400	5405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207339
83	NC_017240	TAA	2	6	5409	5414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207339
84	NC_017240	ATA	3	9	5498	5506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207339
85	NC_017240	TTA	2	6	5534	5539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207339
86	NC_017240	GAA	2	6	5608	5613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207339
87	NC_017240	ATT	2	6	5765	5770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017240	ATA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207340
89	NC_017240	AGA	2	6	5836	5841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207340
90	NC_017240	ATA	2	6	5865	5870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207340
91	NC_017240	GAA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207340
92	NC_017240	TAG	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017240	TAA	2	6	5916	5921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017240	TAA	2	6	6273	6278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017240	ATT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017240	AAG	2	6	6482	6487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017240	GTT	2	6	6492	6497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017240	ATA	2	6	6536	6541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207341
99	NC_017240	ATA	2	6	6601	6606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207341
100	NC_017240	AGC	2	6	6909	6914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207342
101	NC_017240	AAG	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207342
102	NC_017240	AAG	2	6	6974	6979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207342
103	NC_017240	TAA	2	6	7008	7013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207342
104	NC_017240	TAA	2	6	7091	7096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017240	TTA	2	6	7100	7105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017240	TAA	2	6	7224	7229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017240	ACA	2	6	7376	7381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207343
108	NC_017240	GAA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
109	NC_017240	TAG	2	6	7536	7541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207343
110	NC_017240	ATA	2	6	7626	7631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
111	NC_017240	AGA	2	6	7816	7821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
112	NC_017240	TAA	2	6	7957	7962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
113	NC_017240	TAA	3	9	8032	8040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
114	NC_017240	TAA	2	6	8062	8067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
115	NC_017240	ATA	2	6	8151	8156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
116	NC_017240	AGA	2	6	8173	8178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
117	NC_017240	ATT	2	6	8180	8185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
118	NC_017240	GTA	2	6	8189	8194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207343
119	NC_017240	TAT	2	6	8333	8338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
120	NC_017240	TGT	2	6	8350	8355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207343
121	NC_017240	GAA	2	6	8756	8761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
122	NC_017240	AAT	2	6	8843	8848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
123	NC_017240	ATG	2	6	8928	8933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207343
124	NC_017240	TTA	2	6	8946	8951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
125	NC_017240	GAA	2	6	8981	8986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
126	NC_017240	CTT	2	6	8990	8995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207343
127	NC_017240	TTA	2	6	9000	9005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
128	NC_017240	TAA	2	6	9007	9012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
129	NC_017240	ACA	2	6	9024	9029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207343
130	NC_017240	TGA	2	6	9124	9129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207343
131	NC_017240	TTA	2	6	9186	9191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
132	NC_017240	TAC	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207343
133	NC_017240	AGA	2	6	9259	9264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
134	NC_017240	AAT	2	6	9287	9292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
135	NC_017240	AGA	2	6	9466	9471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
136	NC_017240	AGA	3	9	9511	9519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
137	NC_017240	TAG	2	6	9646	9651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207343
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.