MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	TGT	2	6	257	262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017240	TAA	2	6	476	481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017240	TTA	3	9	504	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017240	ATT	2	6	518	523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017240	TAA	2	6	525	530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017240	ATA	2	6	547	552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017240	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017240	AAT	2	6	723	728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017240	ATT	2	6	1534	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017240	ATG	2	6	1787	1792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017240	TTA	2	6	2372	2377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017240	TAT	2	6	2407	2412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017240	AAT	2	6	2490	2495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017240	AGC	2	6	2505	2510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017240	AGA	2	6	2613	2618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017240	AAG	2	6	2636	2641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017240	AGA	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017240	AAT	2	6	2688	2693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017240	TCA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017240	AGA	2	6	3018	3023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017240	AGA	2	6	3074	3079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017240	GAA	2	6	3096	3101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017240	ATA	2	6	3763	3768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017240	ACT	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017240	TAA	3	9	4357	4365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017240	TAT	2	6	4372	4377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017240	AAT	2	6	4395	4400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017240	TAT	2	6	4554	4559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017240	TAA	2	6	4562	4567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017240	TAA	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017240	ATT	2	6	5765	5770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017240	TAG	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017240	TAA	2	6	5916	5921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017240	TAA	2	6	6273	6278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017240	ATT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017240	AAG	2	6	6482	6487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017240	GTT	2	6	6492	6497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017240	TAA	2	6	7091	7096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017240	TTA	2	6	7100	7105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017240	TAA	2	6	7224	7229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017240	TAA	2	6	10536	10541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017240	ATT	2	6	10639	10644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017240	ATT	2	6	10811	10816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017240	TTA	2	6	10844	10849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017240	TAA	3	9	11051	11059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017240	TAA	2	6	11119	11124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017240	TTA	2	6	11131	11136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017240	GAA	2	6	13296	13301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017240	CTA	2	6	13346	13351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017240	GAA	2	6	13930	13935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017240	AAT	2	6	14526	14531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017240	AAC	2	6	14571	14576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017240	TTA	2	6	14625	14630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017240	AGA	2	6	14831	14836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017240	ATG	2	6	14935	14940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017240	TAA	2	6	15108	15113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017240	ATA	2	6	15721	15726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017240	AGT	2	6	15888	15893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017240	CCT	2	6	16200	16205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017240	AAC	2	6	16385	16390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017240	TAA	2	6	16476	16481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017240	AGG	2	6	16567	16572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017240	AGA	2	6	19913	19918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017240	TAA	2	6	19980	19985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017240	AGC	2	6	20061	20066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017240	TGA	2	6	20128	20133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017240	ATT	2	6	20136	20141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017240	TTA	2	6	20266	20271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017240	AAG	2	6	20281	20286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017240	ATA	2	6	20313	20318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017240	ATA	2	6	20543	20548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017240	ATA	2	6	20561	20566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017240	TTA	2	6	20575	20580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017240	TCT	2	6	20623	20628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017240	TAG	2	6	20631	20636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017240	TAA	2	6	20684	20689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017240	TAT	3	9	20718	20726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017240	TAA	2	6	20912	20917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017240	TAA	2	6	20921	20926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017240	TCT	2	6	21688	21693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017240	TTG	2	6	22124	22129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017240	GTT	2	6	22146	22151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017240	AAT	2	6	22407	22412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017240	CTA	2	6	22427	22432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017240	ATT	2	6	22532	22537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017240	TAT	2	6	22553	22558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017240	ATT	2	6	22663	22668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017240	ATT	2	6	22687	22692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017240	TAT	2	6	22932	22937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017240	TGA	2	6	23440	23445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017240	TTA	2	6	23686	23691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017240	TAA	2	6	23788	23793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017240	TGA	2	6	23797	23802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017240	TAA	2	6	23809	23814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017240	TAT	2	6	23851	23856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017240	TCT	2	6	23864	23869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017240	AAG	2	6	23874	23879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017240	TAT	2	6	23914	23919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017240	ATG	2	6	24285	24290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017240	CAT	2	6	24318	24323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017240	TAA	2	6	24401	24406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017240	ATT	2	6	24523	24528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017240	AAC	2	6	24556	24561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017240	CAT	2	6	24643	24648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017240	AAT	2	6	24812	24817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017240	TAG	2	6	24872	24877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017240	AAG	2	6	25089	25094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017240	ATT	2	6	25105	25110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017240	TTG	2	6	25288	25293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017240	AGA	2	6	25313	25318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017240	ATT	3	9	25437	25445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017240	ATT	3	9	25456	25464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017240	TAA	2	6	25465	25470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017240	TTG	2	6	26472	26477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017240	TTA	2	6	27282	27287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017240	AGA	2	6	27521	27526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017240	ATT	2	6	27555	27560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017240	AGG	2	6	27877	27882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017240	TTC	2	6	27895	27900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017240	TTA	2	6	28592	28597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017240	TAA	2	6	29429	29434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017240	ATA	2	6	29466	29471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.