MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 303

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	AGA	2	6	11	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207329
2	NC_017240	ATT	2	6	54	59	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207329
3	NC_017240	TAG	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207329
4	NC_017240	CAA	2	6	288	293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207330
5	NC_017240	CAA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207330
6	NC_017240	TTG	2	6	343	348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207330
7	NC_017240	AAT	2	6	424	429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207330
8	NC_017240	ATT	2	6	753	758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207331
9	NC_017240	TAT	2	6	847	852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207331
10	NC_017240	TTA	2	6	884	889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207331
11	NC_017240	TAA	2	6	971	976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207331
12	NC_017240	CTC	2	6	1125	1130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207332
13	NC_017240	TTA	2	6	1305	1310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207332
14	NC_017240	ATT	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207332
15	NC_017240	CTT	2	6	1431	1436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207332
16	NC_017240	ATA	2	6	1650	1655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207333
17	NC_017240	ATG	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207333
18	NC_017240	TAA	2	6	1681	1686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207333
19	NC_017240	ATA	2	6	1982	1987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207334
20	NC_017240	TGT	2	6	2053	2058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207334
21	NC_017240	AAT	2	6	2760	2765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207335
22	NC_017240	AAT	2	6	2823	2828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207335
23	NC_017240	GAA	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207335
24	NC_017240	TTA	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207335
25	NC_017240	ATT	2	6	3177	3182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
26	NC_017240	AAC	2	6	3214	3219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207336
27	NC_017240	ATT	2	6	3307	3312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
28	NC_017240	AGA	2	6	3347	3352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207336
29	NC_017240	TAG	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207336
30	NC_017240	AGA	2	6	3422	3427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207336
31	NC_017240	ATT	2	6	3529	3534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
32	NC_017240	ATT	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
33	NC_017240	AAT	2	6	3569	3574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207336
34	NC_017240	ATT	3	9	3594	3602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
35	NC_017240	ATT	2	6	3631	3636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207336
36	NC_017240	TTG	2	6	3958	3963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207337
37	NC_017240	AAT	2	6	3980	3985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207337
38	NC_017240	GAT	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207337
39	NC_017240	GAA	2	6	4011	4016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207337
40	NC_017240	TAA	2	6	4027	4032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207337
41	NC_017240	AGA	2	6	4091	4096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207337
42	NC_017240	ATA	2	6	4161	4166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207337
43	NC_017240	GGA	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207338
44	NC_017240	AGA	2	6	4758	4763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207338
45	NC_017240	TAA	2	6	4764	4769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207338
46	NC_017240	TGA	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207338
47	NC_017240	TAA	2	6	4926	4931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207338
48	NC_017240	TAA	2	6	4950	4955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207338
49	NC_017240	ATA	2	6	4988	4993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207338
50	NC_017240	GAT	2	6	5173	5178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207339
51	NC_017240	CAT	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207339
52	NC_017240	TTA	2	6	5400	5405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207339
53	NC_017240	TAA	2	6	5409	5414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207339
54	NC_017240	ATA	3	9	5498	5506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207339
55	NC_017240	TTA	2	6	5534	5539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207339
56	NC_017240	GAA	2	6	5608	5613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207339
57	NC_017240	ATA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207340
58	NC_017240	AGA	2	6	5836	5841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207340
59	NC_017240	ATA	2	6	5865	5870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207340
60	NC_017240	GAA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207340
61	NC_017240	ATA	2	6	6536	6541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207341
62	NC_017240	ATA	2	6	6601	6606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207341
63	NC_017240	AGC	2	6	6909	6914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207342
64	NC_017240	AAG	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207342
65	NC_017240	AAG	2	6	6974	6979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207342
66	NC_017240	TAA	2	6	7008	7013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207342
67	NC_017240	ACA	2	6	7376	7381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207343
68	NC_017240	GAA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
69	NC_017240	TAG	2	6	7536	7541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207343
70	NC_017240	ATA	2	6	7626	7631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
71	NC_017240	AGA	2	6	7816	7821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
72	NC_017240	TAA	2	6	7957	7962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
73	NC_017240	TAA	3	9	8032	8040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
74	NC_017240	TAA	2	6	8062	8067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
75	NC_017240	ATA	2	6	8151	8156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
76	NC_017240	AGA	2	6	8173	8178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
77	NC_017240	ATT	2	6	8180	8185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
78	NC_017240	GTA	2	6	8189	8194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207343
79	NC_017240	TAT	2	6	8333	8338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
80	NC_017240	TGT	2	6	8350	8355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207343
81	NC_017240	GAA	2	6	8756	8761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
82	NC_017240	AAT	2	6	8843	8848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
83	NC_017240	ATG	2	6	8928	8933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207343
84	NC_017240	TTA	2	6	8946	8951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
85	NC_017240	GAA	2	6	8981	8986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
86	NC_017240	CTT	2	6	8990	8995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207343
87	NC_017240	TTA	2	6	9000	9005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
88	NC_017240	TAA	2	6	9007	9012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
89	NC_017240	ACA	2	6	9024	9029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207343
90	NC_017240	TGA	2	6	9124	9129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207343
91	NC_017240	TTA	2	6	9186	9191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
92	NC_017240	TAC	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207343
93	NC_017240	AGA	2	6	9259	9264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
94	NC_017240	AAT	2	6	9287	9292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
95	NC_017240	AGA	2	6	9466	9471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
96	NC_017240	AGA	3	9	9511	9519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
97	NC_017240	TAG	2	6	9646	9651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207343
98	NC_017240	TTG	2	6	9744	9749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207343
99	NC_017240	CAA	2	6	9750	9755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207343
100	NC_017240	ATC	2	6	9763	9768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207343
101	NC_017240	AAT	2	6	9770	9775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
102	NC_017240	AGA	2	6	9871	9876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
103	NC_017240	TAA	2	6	9894	9899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
104	NC_017240	TTA	2	6	9951	9956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
105	NC_017240	AGA	2	6	9985	9990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
106	NC_017240	ATT	2	6	10133	10138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
107	NC_017240	TTA	2	6	10148	10153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
108	NC_017240	AAG	2	6	10245	10250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207343
109	NC_017240	TAT	2	6	10265	10270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
110	NC_017240	TGT	2	6	10280	10285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207343
111	NC_017240	TAA	2	6	10288	10293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
112	NC_017240	ACT	2	6	10347	10352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207343
113	NC_017240	TTA	2	6	10410	10415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207343
114	NC_017240	ATA	2	6	10460	10465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207343
115	NC_017240	ACT	2	6	11400	11405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207344
116	NC_017240	AAC	2	6	11533	11538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207344
117	NC_017240	CTA	2	6	11555	11560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207344
118	NC_017240	TAA	3	9	11592	11600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207345
119	NC_017240	AGA	2	6	11616	11621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207345
120	NC_017240	ATA	2	6	11650	11655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207345
121	NC_017240	TAA	2	6	11721	11726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207345
122	NC_017240	ACT	2	6	11775	11780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207345
123	NC_017240	TAT	2	6	11952	11957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207345
124	NC_017240	ACA	2	6	12117	12122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207346
125	NC_017240	ATT	2	6	12185	12190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207346
126	NC_017240	GAA	2	6	12212	12217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207346
127	NC_017240	TTC	2	6	12232	12237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207346
128	NC_017240	TTA	2	6	12423	12428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207347
129	NC_017240	TAC	2	6	12560	12565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207347
130	NC_017240	TAT	2	6	12583	12588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207347
131	NC_017240	AAT	2	6	12668	12673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207347
132	NC_017240	ACT	2	6	12731	12736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207347
133	NC_017240	TCA	2	6	12795	12800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207348
134	NC_017240	TAA	2	6	12884	12889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207348
135	NC_017240	ATG	2	6	12931	12936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207349
136	NC_017240	TGA	2	6	13034	13039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207349
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140	NC_017240	ACT	2	6	13455	13460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207351
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149	NC_017240	AAT	3	9	14439	14447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207352
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161	NC_017240	TAT	2	6	15452	15457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207355
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.