MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	AG	3	6	225	230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017240	TA	3	6	686	691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017240	AT	3	6	934	939	50 %	50 %	0 %	0 %	384207331
4	NC_017240	AG	3	6	1198	1203	50 %	0 %	50 %	0 %	384207332
5	NC_017240	TA	3	6	1367	1372	50 %	50 %	0 %	0 %	384207332
6	NC_017240	TA	3	6	1599	1604	50 %	50 %	0 %	0 %	384207333
7	NC_017240	TA	3	6	1929	1934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017240	AT	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017240	TA	3	6	2045	2050	50 %	50 %	0 %	0 %	384207334
10	NC_017240	AT	3	6	2252	2257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017240	AT	3	6	2286	2291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017240	AT	3	6	2518	2523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017240	AT	3	6	2837	2842	50 %	50 %	0 %	0 %	384207335
14	NC_017240	AT	3	6	2922	2927	50 %	50 %	0 %	0 %	384207335
15	NC_017240	TA	3	6	2934	2939	50 %	50 %	0 %	0 %	384207335
16	NC_017240	AT	3	6	3029	3034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017240	AT	3	6	3850	3855	50 %	50 %	0 %	0 %	384207337
18	NC_017240	AT	3	6	4072	4077	50 %	50 %	0 %	0 %	384207337
19	NC_017240	TA	4	8	4416	4423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017240	AT	3	6	4613	4618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017240	AT	3	6	4932	4937	50 %	50 %	0 %	0 %	384207338
22	NC_017240	AT	3	6	5086	5091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017240	AT	3	6	5805	5810	50 %	50 %	0 %	0 %	384207340
24	NC_017240	TA	3	6	6519	6524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017240	TA	3	6	6618	6623	50 %	50 %	0 %	0 %	384207341
26	NC_017240	CT	3	6	6665	6670	0 %	50 %	0 %	50 %	384207341
27	NC_017240	AT	3	6	7074	7079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017240	TA	3	6	7104	7109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017240	TA	3	6	7174	7179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017240	AT	3	6	7239	7244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017240	TA	3	6	7292	7297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017240	AT	3	6	7354	7359	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
33	NC_017240	AT	3	6	8109	8114	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
34	NC_017240	AT	3	6	8550	8555	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
35	NC_017240	AC	3	6	8691	8696	50 %	0 %	0 %	50 %	384207343
36	NC_017240	TA	3	6	9863	9868	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
37	NC_017240	TA	3	6	10239	10244	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
38	NC_017240	AT	3	6	10654	10659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017240	GT	3	6	10683	10688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017240	AC	3	6	11274	11279	50 %	0 %	0 %	50 %	384207344
41	NC_017240	AT	3	6	11804	11809	50 %	50 %	0 %	0 %	384207345
42	NC_017240	TA	3	6	12614	12619	50 %	50 %	0 %	0 %	384207347
43	NC_017240	AT	3	6	13244	13249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017240	AT	3	6	13645	13650	50 %	50 %	0 %	0 %	384207351
45	NC_017240	AT	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017240	AT	3	6	14539	14544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017240	AT	3	6	14682	14687	50 %	50 %	0 %	0 %	384207353
48	NC_017240	GC	3	6	14956	14961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017240	AT	3	6	15162	15167	50 %	50 %	0 %	0 %	384207354
50	NC_017240	TA	4	8	18906	18913	50 %	50 %	0 %	0 %	384207359
51	NC_017240	AT	3	6	19282	19287	50 %	50 %	0 %	0 %	384207360
52	NC_017240	TA	3	6	19333	19338	50 %	50 %	0 %	0 %	384207360
53	NC_017240	AT	3	6	19757	19762	50 %	50 %	0 %	0 %	384207361
54	NC_017240	AT	3	6	19844	19849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017240	AT	3	6	20363	20368	50 %	50 %	0 %	0 %	384207362
56	NC_017240	TC	4	8	22006	22013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017240	AT	3	6	22064	22069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017240	AT	3	6	23678	23683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017240	TG	3	6	23840	23845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017240	AG	3	6	23858	23863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017240	AT	3	6	23892	23897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017240	TG	3	6	24251	24256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017240	TA	4	8	24583	24590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017240	AT	3	6	25114	25119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017240	TA	3	6	27454	27459	50 %	50 %	0 %	0 %	384207375
66	NC_017240	GT	3	6	28294	28299	0 %	50 %	50 %	0 %	384207378
67	NC_017240	TA	3	6	28364	28369	50 %	50 %	0 %	0 %	384207379
68	NC_017240	AG	3	6	28598	28603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017240	AT	3	6	28860	28865	50 %	50 %	0 %	0 %	384207380
70	NC_017240	TA	3	6	29296	29301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017240	AT	3	6	29676	29681	50 %	50 %	0 %	0 %	384207381
72	NC_017240	TA	3	6	30048	30053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.