MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	AT	3	6	934	939	50 %	50 %	0 %	0 %	384207331
2	NC_017240	AG	3	6	1198	1203	50 %	0 %	50 %	0 %	384207332
3	NC_017240	TA	3	6	1367	1372	50 %	50 %	0 %	0 %	384207332
4	NC_017240	TA	3	6	1599	1604	50 %	50 %	0 %	0 %	384207333
5	NC_017240	TA	3	6	2045	2050	50 %	50 %	0 %	0 %	384207334
6	NC_017240	AT	3	6	2837	2842	50 %	50 %	0 %	0 %	384207335
7	NC_017240	AT	3	6	2922	2927	50 %	50 %	0 %	0 %	384207335
8	NC_017240	TA	3	6	2934	2939	50 %	50 %	0 %	0 %	384207335
9	NC_017240	AT	3	6	3850	3855	50 %	50 %	0 %	0 %	384207337
10	NC_017240	AT	3	6	4072	4077	50 %	50 %	0 %	0 %	384207337
11	NC_017240	AT	3	6	4932	4937	50 %	50 %	0 %	0 %	384207338
12	NC_017240	AT	3	6	5805	5810	50 %	50 %	0 %	0 %	384207340
13	NC_017240	TA	3	6	6618	6623	50 %	50 %	0 %	0 %	384207341
14	NC_017240	CT	3	6	6665	6670	0 %	50 %	0 %	50 %	384207341
15	NC_017240	AT	3	6	7354	7359	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
16	NC_017240	AT	3	6	8109	8114	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
17	NC_017240	AT	3	6	8550	8555	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
18	NC_017240	AC	3	6	8691	8696	50 %	0 %	0 %	50 %	384207343
19	NC_017240	TA	3	6	9863	9868	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
20	NC_017240	TA	3	6	10239	10244	50 %	50 %	0 %	0 %	384207343
21	NC_017240	AC	3	6	11274	11279	50 %	0 %	0 %	50 %	384207344
22	NC_017240	AT	3	6	11804	11809	50 %	50 %	0 %	0 %	384207345
23	NC_017240	TA	3	6	12614	12619	50 %	50 %	0 %	0 %	384207347
24	NC_017240	AT	3	6	13645	13650	50 %	50 %	0 %	0 %	384207351
25	NC_017240	AT	3	6	14682	14687	50 %	50 %	0 %	0 %	384207353
26	NC_017240	AT	3	6	15162	15167	50 %	50 %	0 %	0 %	384207354
27	NC_017240	TA	4	8	18906	18913	50 %	50 %	0 %	0 %	384207359
28	NC_017240	AT	3	6	19282	19287	50 %	50 %	0 %	0 %	384207360
29	NC_017240	TA	3	6	19333	19338	50 %	50 %	0 %	0 %	384207360
30	NC_017240	AT	3	6	19757	19762	50 %	50 %	0 %	0 %	384207361
31	NC_017240	AT	3	6	20363	20368	50 %	50 %	0 %	0 %	384207362
32	NC_017240	TA	3	6	27454	27459	50 %	50 %	0 %	0 %	384207375
33	NC_017240	GT	3	6	28294	28299	0 %	50 %	50 %	0 %	384207378
34	NC_017240	TA	3	6	28364	28369	50 %	50 %	0 %	0 %	384207379
35	NC_017240	AT	3	6	28860	28865	50 %	50 %	0 %	0 %	384207380
36	NC_017240	AT	3	6	29676	29681	50 %	50 %	0 %	0 %	384207381

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.