MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-2

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017239	TTAAAA	2	12	2214	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017239	ATTTGT	2	12	2229	2240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017239	AAAATA	2	12	3421	3432	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206343
4	NC_017239	TTGATC	2	12	4134	4145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384206345
5	NC_017239	ATTCTT	2	12	4215	4226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384206345
6	NC_017239	TTGAGC	2	12	6834	6845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384206351
7	NC_017239	CATTCT	2	12	7138	7149	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384206352
8	NC_017239	AATATC	2	12	8909	8920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017239	TAATAT	2	12	9361	9372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017239	TGGAAA	2	12	9897	9908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384206358
11	NC_017239	GCATAC	2	12	10336	10347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384206358
12	NC_017239	TATTTT	2	12	10710	10721	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017239	ATTTGA	2	12	11250	11261	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017239	AATTTA	2	12	12687	12698	50 %	50 %	0 %	0 %	384206361
15	NC_017239	TTTTCT	2	12	12720	12731	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384206361
16	NC_017239	TTTGTA	2	12	13141	13152	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384206361
17	NC_017239	TAAAAA	3	18	13253	13270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017239	ATATAA	2	12	16042	16053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017239	TTAGAA	2	12	17744	17755	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017239	TAGATT	2	12	18245	18256	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017239	AAGGCT	2	12	21164	21175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017239	TAAAAA	2	12	21941	21952	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017239	TAAATA	2	12	23493	23504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017239	TTTGAG	2	12	24783	24794	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.