MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-2

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017239	AATTG	2	10	3218	3227	40 %	40 %	20 %	0 %	384206343
2	NC_017239	AGTTT	2	10	4765	4774	20 %	60 %	20 %	0 %	384206345
3	NC_017239	AAATA	2	10	4962	4971	80 %	20 %	0 %	0 %	384206346
4	NC_017239	ATTTT	2	10	5045	5054	20 %	80 %	0 %	0 %	384206346
5	NC_017239	GTTAG	2	10	5230	5239	20 %	40 %	40 %	0 %	384206346
6	NC_017239	TTTTG	2	10	5995	6004	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017239	TTTAT	2	10	8144	8153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017239	TTAAT	2	10	9350	9359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017239	TATTT	2	10	10968	10977	20 %	80 %	0 %	0 %	384206359
10	NC_017239	ATTTT	2	10	10991	11000	20 %	80 %	0 %	0 %	384206359
11	NC_017239	TTTAT	2	10	11210	11219	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017239	TAAAA	2	10	11448	11457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017239	TTTAA	2	10	11502	11511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017239	TTGAT	2	10	12243	12252	20 %	60 %	20 %	0 %	384206361
15	NC_017239	AAATT	2	10	12502	12511	60 %	40 %	0 %	0 %	384206361
16	NC_017239	GAATT	2	10	13307	13316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017239	TTATG	2	10	13471	13480	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017239	TAAGA	2	10	13586	13595	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017239	ATAAA	2	10	13718	13727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017239	CAAAG	2	10	14234	14243	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017239	TTTTG	2	10	14837	14846	0 %	80 %	20 %	0 %	384206362
22	NC_017239	TTAAA	2	10	15282	15291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017239	TATAT	2	10	16374	16383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017239	CAAAA	2	10	16680	16689	80 %	0 %	0 %	20 %	384206364
25	NC_017239	ATAAA	2	10	19181	19190	80 %	20 %	0 %	0 %	384206367
26	NC_017239	CTAAG	2	10	19906	19915	40 %	20 %	20 %	20 %	384206369
27	NC_017239	ATAAA	2	10	20094	20103	80 %	20 %	0 %	0 %	384206369
28	NC_017239	TTTAA	2	10	20290	20299	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017239	TAAAT	2	10	20427	20436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017239	ATATT	2	10	20514	20523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017239	CTAAA	2	10	20813	20822	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017239	ATTTT	2	10	21205	21214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017239	TCTTT	2	10	21223	21232	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017239	AATTT	2	10	21438	21447	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017239	AAAAT	2	10	21763	21772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017239	ATTAT	2	10	21789	21798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017239	CTCTT	2	10	22465	22474	0 %	60 %	0 %	40 %	384206374
38	NC_017239	CTTTA	2	10	22903	22912	20 %	60 %	0 %	20 %	384206374
39	NC_017239	ATTAA	2	10	22982	22991	60 %	40 %	0 %	0 %	384206374
40	NC_017239	AAAAT	2	10	23113	23122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017239	AAACA	2	10	23194	23203	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017239	AAAGC	2	10	23970	23979	60 %	0 %	20 %	20 %	384206375
43	NC_017239	TAAAA	2	10	24630	24639	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017239	AAGAA	2	10	26392	26401	80 %	0 %	20 %	0 %	384206379

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.