MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-2

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017239	ATTT	2	8	17	24	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017239	ATAG	2	8	311	318	50 %	25 %	25 %	0 %	384206339
3	NC_017239	CAAA	2	8	1509	1516	75 %	0 %	0 %	25 %	384206340
4	NC_017239	AAAT	2	8	1845	1852	75 %	25 %	0 %	0 %	384206342
5	NC_017239	AAAT	2	8	1929	1936	75 %	25 %	0 %	0 %	384206342
6	NC_017239	TAAA	2	8	2143	2150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017239	ATCA	2	8	2682	2689	50 %	25 %	0 %	25 %	384206343
8	NC_017239	AAAT	2	8	3109	3116	75 %	25 %	0 %	0 %	384206343
9	NC_017239	AAAT	2	8	3359	3366	75 %	25 %	0 %	0 %	384206343
10	NC_017239	CAAT	2	8	3662	3669	50 %	25 %	0 %	25 %	384206344
11	NC_017239	ATTT	2	8	3688	3695	25 %	75 %	0 %	0 %	384206344
12	NC_017239	TATT	2	8	3725	3732	25 %	75 %	0 %	0 %	384206344
13	NC_017239	AATT	2	8	4197	4204	50 %	50 %	0 %	0 %	384206345
14	NC_017239	TTTA	2	8	5166	5173	25 %	75 %	0 %	0 %	384206346
15	NC_017239	ATAA	2	8	5357	5364	75 %	25 %	0 %	0 %	384206346
16	NC_017239	AATT	2	8	5413	5420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017239	CTAA	2	8	5489	5496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017239	TTCG	2	8	5901	5908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017239	ATCG	2	8	6946	6953	25 %	25 %	25 %	25 %	384206351
20	NC_017239	TATG	2	8	7892	7899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017239	TATT	2	8	7988	7995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017239	TTAT	2	8	8404	8411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017239	TTAA	2	8	8485	8492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017239	GATT	2	8	8705	8712	25 %	50 %	25 %	0 %	384206356
25	NC_017239	AAAC	2	8	9287	9294	75 %	0 %	0 %	25 %	384206357
26	NC_017239	TGAT	2	8	9483	9490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017239	ATTT	3	12	9500	9511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017239	TATG	2	8	9552	9559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017239	ATTT	2	8	9578	9585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017239	ATCT	2	8	9696	9703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017239	ATTA	2	8	10419	10426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017239	ATAA	2	8	10427	10434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017239	ATTA	2	8	10562	10569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017239	TCTT	2	8	10638	10645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017239	TATT	2	8	10979	10986	25 %	75 %	0 %	0 %	384206359
36	NC_017239	TTCT	2	8	11067	11074	0 %	75 %	0 %	25 %	384206359
37	NC_017239	AATA	2	8	11304	11311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017239	ATTT	2	8	11545	11552	25 %	75 %	0 %	0 %	384206360
39	NC_017239	ATTT	2	8	12106	12113	25 %	75 %	0 %	0 %	384206361
40	NC_017239	ATTG	2	8	12160	12167	25 %	50 %	25 %	0 %	384206361
41	NC_017239	ATTT	2	8	12233	12240	25 %	75 %	0 %	0 %	384206361
42	NC_017239	TATT	2	8	12372	12379	25 %	75 %	0 %	0 %	384206361
43	NC_017239	GTTT	2	8	12400	12407	0 %	75 %	25 %	0 %	384206361
44	NC_017239	ATTT	2	8	12476	12483	25 %	75 %	0 %	0 %	384206361
45	NC_017239	TCTT	2	8	12709	12716	0 %	75 %	0 %	25 %	384206361
46	NC_017239	GATT	2	8	13062	13069	25 %	50 %	25 %	0 %	384206361
47	NC_017239	ATAA	2	8	14466	14473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017239	TGAA	2	8	14503	14510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017239	GTTG	2	8	15073	15080	0 %	50 %	50 %	0 %	384206362
50	NC_017239	GATT	2	8	15707	15714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017239	AAAG	2	8	16119	16126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017239	TAAA	2	8	16557	16564	75 %	25 %	0 %	0 %	384206363
53	NC_017239	TTAA	2	8	16600	16607	50 %	50 %	0 %	0 %	384206364
54	NC_017239	AAAT	2	8	17684	17691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017239	AATT	2	8	18357	18364	50 %	50 %	0 %	0 %	384206366
56	NC_017239	TAAA	2	8	18431	18438	75 %	25 %	0 %	0 %	384206366
57	NC_017239	ATAA	2	8	18496	18503	75 %	25 %	0 %	0 %	384206366
58	NC_017239	AGTA	2	8	18528	18535	50 %	25 %	25 %	0 %	384206366
59	NC_017239	GTAT	2	8	18545	18552	25 %	50 %	25 %	0 %	384206366
60	NC_017239	TTAT	2	8	18683	18690	25 %	75 %	0 %	0 %	384206367
61	NC_017239	TAAT	2	8	19259	19266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017239	AAAT	2	8	19458	19465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017239	TAAT	2	8	19515	19522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017239	TAAA	2	8	19546	19553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017239	AAGC	2	8	19577	19584	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017239	TGTT	2	8	19722	19729	0 %	75 %	25 %	0 %	384206368
67	NC_017239	ATTT	2	8	20029	20036	25 %	75 %	0 %	0 %	384206369
68	NC_017239	AGTT	2	8	20224	20231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017239	ATAA	2	8	20340	20347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017239	TTAT	2	8	20357	20364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017239	TTTA	2	8	20405	20412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017239	ATTA	2	8	20543	20550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017239	CTTT	2	8	20669	20676	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017239	TAAA	2	8	20930	20937	75 %	25 %	0 %	0 %	384206370
75	NC_017239	ACAA	2	8	21150	21157	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017239	AAGA	2	8	21406	21413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017239	TAAT	2	8	21686	21693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017239	ATTA	2	8	23062	23069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017239	TAAT	2	8	23092	23099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017239	TGTT	2	8	23287	23294	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017239	AATA	2	8	23464	23471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017239	AAAG	2	8	23606	23613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017239	TAAT	2	8	23664	23671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017239	AAAG	2	8	24041	24048	75 %	0 %	25 %	0 %	384206375
85	NC_017239	TAAA	2	8	24229	24236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017239	AAAT	2	8	24654	24661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017239	TAAA	2	8	24868	24875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017239	AGAT	2	8	25098	25105	50 %	25 %	25 %	0 %	384206377
89	NC_017239	GTAA	2	8	25280	25287	50 %	25 %	25 %	0 %	384206377
90	NC_017239	TAAT	2	8	25693	25700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017239	TATG	2	8	25904	25911	25 %	50 %	25 %	0 %	384206379
92	NC_017239	TTTG	2	8	26301	26308	0 %	75 %	25 %	0 %	384206379
93	NC_017239	GTTA	2	8	26572	26579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.