MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-2

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017239	ATTT	2	8	17	24	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017239	TAAA	2	8	2143	2150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017239	AATT	2	8	5413	5420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017239	CTAA	2	8	5489	5496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017239	TTCG	2	8	5901	5908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017239	TATG	2	8	7892	7899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017239	TATT	2	8	7988	7995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017239	TTAT	2	8	8404	8411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017239	TTAA	2	8	8485	8492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017239	TGAT	2	8	9483	9490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017239	ATTT	3	12	9500	9511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017239	TATG	2	8	9552	9559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017239	ATTT	2	8	9578	9585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017239	ATCT	2	8	9696	9703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017239	ATTA	2	8	10419	10426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017239	ATAA	2	8	10427	10434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017239	ATTA	2	8	10562	10569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017239	TCTT	2	8	10638	10645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017239	AATA	2	8	11304	11311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017239	ATAA	2	8	14466	14473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017239	TGAA	2	8	14503	14510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017239	GATT	2	8	15707	15714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017239	AAAG	2	8	16119	16126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017239	AAAT	2	8	17684	17691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017239	TAAT	2	8	19259	19266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017239	AAAT	2	8	19458	19465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017239	TAAT	2	8	19515	19522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017239	TAAA	2	8	19546	19553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017239	AAGC	2	8	19577	19584	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017239	AGTT	2	8	20224	20231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017239	ATAA	2	8	20340	20347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017239	TTAT	2	8	20357	20364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017239	TTTA	2	8	20405	20412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017239	ATTA	2	8	20543	20550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017239	CTTT	2	8	20669	20676	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017239	ACAA	2	8	21150	21157	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017239	AAGA	2	8	21406	21413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017239	TAAT	2	8	21686	21693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017239	ATTA	2	8	23062	23069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017239	TAAT	2	8	23092	23099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017239	TGTT	2	8	23287	23294	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017239	AATA	2	8	23464	23471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017239	AAAG	2	8	23606	23613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017239	TAAT	2	8	23664	23671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017239	TAAA	2	8	24229	24236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017239	AAAT	2	8	24654	24661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017239	TAAA	2	8	24868	24875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017239	TAAT	2	8	25693	25700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017239	GTTA	2	8	26572	26579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.