MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-2

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017239	ATAG	2	8	311	318	50 %	25 %	25 %	0 %	384206339
2	NC_017239	CAAA	2	8	1509	1516	75 %	0 %	0 %	25 %	384206340
3	NC_017239	AAAT	2	8	1845	1852	75 %	25 %	0 %	0 %	384206342
4	NC_017239	AAAT	2	8	1929	1936	75 %	25 %	0 %	0 %	384206342
5	NC_017239	ATCA	2	8	2682	2689	50 %	25 %	0 %	25 %	384206343
6	NC_017239	AAAT	2	8	3109	3116	75 %	25 %	0 %	0 %	384206343
7	NC_017239	AAAT	2	8	3359	3366	75 %	25 %	0 %	0 %	384206343
8	NC_017239	CAAT	2	8	3662	3669	50 %	25 %	0 %	25 %	384206344
9	NC_017239	ATTT	2	8	3688	3695	25 %	75 %	0 %	0 %	384206344
10	NC_017239	TATT	2	8	3725	3732	25 %	75 %	0 %	0 %	384206344
11	NC_017239	AATT	2	8	4197	4204	50 %	50 %	0 %	0 %	384206345
12	NC_017239	TTTA	2	8	5166	5173	25 %	75 %	0 %	0 %	384206346
13	NC_017239	ATAA	2	8	5357	5364	75 %	25 %	0 %	0 %	384206346
14	NC_017239	ATCG	2	8	6946	6953	25 %	25 %	25 %	25 %	384206351
15	NC_017239	GATT	2	8	8705	8712	25 %	50 %	25 %	0 %	384206356
16	NC_017239	AAAC	2	8	9287	9294	75 %	0 %	0 %	25 %	384206357
17	NC_017239	TATT	2	8	10979	10986	25 %	75 %	0 %	0 %	384206359
18	NC_017239	TTCT	2	8	11067	11074	0 %	75 %	0 %	25 %	384206359
19	NC_017239	ATTT	2	8	11545	11552	25 %	75 %	0 %	0 %	384206360
20	NC_017239	ATTT	2	8	12106	12113	25 %	75 %	0 %	0 %	384206361
21	NC_017239	ATTG	2	8	12160	12167	25 %	50 %	25 %	0 %	384206361
22	NC_017239	ATTT	2	8	12233	12240	25 %	75 %	0 %	0 %	384206361
23	NC_017239	TATT	2	8	12372	12379	25 %	75 %	0 %	0 %	384206361
24	NC_017239	GTTT	2	8	12400	12407	0 %	75 %	25 %	0 %	384206361
25	NC_017239	ATTT	2	8	12476	12483	25 %	75 %	0 %	0 %	384206361
26	NC_017239	TCTT	2	8	12709	12716	0 %	75 %	0 %	25 %	384206361
27	NC_017239	GATT	2	8	13062	13069	25 %	50 %	25 %	0 %	384206361
28	NC_017239	GTTG	2	8	15073	15080	0 %	50 %	50 %	0 %	384206362
29	NC_017239	TAAA	2	8	16557	16564	75 %	25 %	0 %	0 %	384206363
30	NC_017239	TTAA	2	8	16600	16607	50 %	50 %	0 %	0 %	384206364
31	NC_017239	AATT	2	8	18357	18364	50 %	50 %	0 %	0 %	384206366
32	NC_017239	TAAA	2	8	18431	18438	75 %	25 %	0 %	0 %	384206366
33	NC_017239	ATAA	2	8	18496	18503	75 %	25 %	0 %	0 %	384206366
34	NC_017239	AGTA	2	8	18528	18535	50 %	25 %	25 %	0 %	384206366
35	NC_017239	GTAT	2	8	18545	18552	25 %	50 %	25 %	0 %	384206366
36	NC_017239	TTAT	2	8	18683	18690	25 %	75 %	0 %	0 %	384206367
37	NC_017239	TGTT	2	8	19722	19729	0 %	75 %	25 %	0 %	384206368
38	NC_017239	ATTT	2	8	20029	20036	25 %	75 %	0 %	0 %	384206369
39	NC_017239	TAAA	2	8	20930	20937	75 %	25 %	0 %	0 %	384206370
40	NC_017239	AAAG	2	8	24041	24048	75 %	0 %	25 %	0 %	384206375
41	NC_017239	AGAT	2	8	25098	25105	50 %	25 %	25 %	0 %	384206377
42	NC_017239	GTAA	2	8	25280	25287	50 %	25 %	25 %	0 %	384206377
43	NC_017239	TATG	2	8	25904	25911	25 %	50 %	25 %	0 %	384206379
44	NC_017239	TTTG	2	8	26301	26308	0 %	75 %	25 %	0 %	384206379

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.