MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-2

Total Repeats: 382

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017239	TTA	2	6	50	55	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017239	AGA	3	9	190	198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206339
3	NC_017239	ATC	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206339
4	NC_017239	GCT	2	6	221	226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206339
5	NC_017239	AGA	2	6	346	351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206339
6	NC_017239	CTT	2	6	387	392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206339
7	NC_017239	TGG	2	6	460	465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206339
8	NC_017239	CTC	2	6	513	518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206339
9	NC_017239	TAG	2	6	625	630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206339
10	NC_017239	TAT	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206339
11	NC_017239	ACA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206339
12	NC_017239	GAA	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206339
13	NC_017239	TTA	2	6	824	829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206339
14	NC_017239	TCA	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206339
15	NC_017239	GAA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206339
16	NC_017239	AAT	2	6	1057	1062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206339
17	NC_017239	TAT	2	6	1065	1070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017239	TCT	2	6	1120	1125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017239	AAG	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017239	AAT	3	9	1180	1188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017239	TAA	2	6	1237	1242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017239	ACT	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017239	ATT	2	6	1418	1423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017239	AGG	2	6	1424	1429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017239	ATT	2	6	1463	1468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206340
26	NC_017239	AAT	2	6	1530	1535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206340
27	NC_017239	CTT	2	6	1590	1595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017239	TAA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017239	ATT	2	6	1833	1838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206342
30	NC_017239	AAT	2	6	1997	2002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017239	ACT	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017239	TTA	3	9	2106	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017239	ATA	2	6	2323	2328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017239	ACA	2	6	2401	2406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206343
35	NC_017239	AAG	2	6	2466	2471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206343
36	NC_017239	AAT	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
37	NC_017239	AAC	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206343
38	NC_017239	ACT	2	6	2599	2604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206343
39	NC_017239	TAA	2	6	2756	2761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
40	NC_017239	ATA	2	6	2794	2799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
41	NC_017239	ATA	3	9	2803	2811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
42	NC_017239	GAA	3	9	2820	2828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206343
43	NC_017239	CAA	2	6	2870	2875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206343
44	NC_017239	TTC	2	6	2899	2904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206343
45	NC_017239	TTA	2	6	2910	2915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206343
46	NC_017239	AAT	2	6	2948	2953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
47	NC_017239	TAA	2	6	2983	2988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
48	NC_017239	TAT	2	6	3158	3163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206343
49	NC_017239	ATA	2	6	3373	3378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
50	NC_017239	ATT	2	6	3404	3409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206343
51	NC_017239	TAA	2	6	3415	3420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
52	NC_017239	AAG	2	6	3448	3453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206343
53	NC_017239	TAA	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206344
54	NC_017239	ATG	2	6	3591	3596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206344
55	NC_017239	TAA	2	6	3617	3622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206344
56	NC_017239	AAG	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206344
57	NC_017239	ATT	2	6	3656	3661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206344
58	NC_017239	GAA	2	6	3678	3683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206344
59	NC_017239	GTT	2	6	3878	3883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206344
60	NC_017239	ATT	2	6	3920	3925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206344
61	NC_017239	TAA	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206344
62	NC_017239	GAG	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206345
63	NC_017239	CTT	2	6	4080	4085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206345
64	NC_017239	AAT	2	6	4087	4092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
65	NC_017239	TAA	2	6	4108	4113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
66	NC_017239	ATC	2	6	4182	4187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206345
67	NC_017239	TAA	2	6	4227	4232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
68	NC_017239	TGT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206345
69	NC_017239	AAG	2	6	4323	4328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206345
70	NC_017239	ATT	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206345
71	NC_017239	AGA	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206345
72	NC_017239	CTC	2	6	4407	4412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206345
73	NC_017239	ATC	2	6	4420	4425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206345
74	NC_017239	TAA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
75	NC_017239	AAT	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
76	NC_017239	ATT	2	6	4565	4570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206345
77	NC_017239	ATT	2	6	4731	4736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206345
78	NC_017239	ATA	3	9	4843	4851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206346
79	NC_017239	AAG	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206346
80	NC_017239	GAA	2	6	4891	4896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206346
81	NC_017239	GAT	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206346
82	NC_017239	AAG	2	6	5246	5251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206346
83	NC_017239	TCT	2	6	5292	5297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206346
84	NC_017239	AAC	2	6	5324	5329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206346
85	NC_017239	ATT	2	6	5539	5544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017239	TCT	2	6	5585	5590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017239	AAT	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017239	CTA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017239	TTC	2	6	6040	6045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017239	TTC	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017239	TCA	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206348
92	NC_017239	CTT	2	6	6385	6390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017239	TGT	2	6	6533	6538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206349
94	NC_017239	AGA	2	6	6590	6595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206349
95	NC_017239	TTA	2	6	6610	6615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206349
96	NC_017239	TTG	2	6	6674	6679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017239	ATC	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206350
98	NC_017239	TAA	2	6	6960	6965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017239	TCT	2	6	7043	7048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206352
100	NC_017239	CTC	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206352
101	NC_017239	AGC	2	6	7123	7128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206352
102	NC_017239	CTT	2	6	7158	7163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206353
103	NC_017239	TGG	2	6	7202	7207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206353
104	NC_017239	AAT	2	6	7270	7275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017239	GTA	2	6	7645	7650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017239	ATT	2	6	7742	7747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206355
107	NC_017239	ATT	2	6	7776	7781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206355
108	NC_017239	TAA	2	6	7845	7850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017239	TAT	2	6	7973	7978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017239	TAA	2	6	7997	8002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017239	ATA	2	6	8204	8209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017239	AAT	4	12	8259	8270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017239	TAA	2	6	8344	8349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017239	TAT	2	6	8371	8376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017239	AGT	2	6	8398	8403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017239	ATA	2	6	8548	8553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206356
117	NC_017239	TCC	2	6	8558	8563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206356
118	NC_017239	ATC	2	6	8660	8665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206356
119	NC_017239	TAA	2	6	8675	8680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206356
120	NC_017239	AAT	3	9	8718	8726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206356
121	NC_017239	ATA	2	6	8820	8825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017239	CTG	2	6	8857	8862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017239	TAT	2	6	8970	8975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017239	CTT	2	6	9051	9056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206357
125	NC_017239	ATC	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206357
126	NC_017239	CTT	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206357
127	NC_017239	ATA	3	9	9412	9420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017239	TTA	2	6	9522	9527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017239	TTA	3	9	9534	9542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017239	ATT	2	6	9595	9600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017239	ATA	2	6	9732	9737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017239	GAT	2	6	9762	9767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017239	ATA	2	6	9821	9826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206358
134	NC_017239	TGA	2	6	9925	9930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206358
135	NC_017239	ATT	2	6	9932	9937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206358
136	NC_017239	GTG	2	6	10032	10037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206358
137	NC_017239	TAA	2	6	10081	10086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206358
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.