MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-2

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017239	A	6	6	6	11	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017239	A	6	6	88	93	100 %	0 %	0 %	0 %	384206339
3	NC_017239	T	9	9	322	330	0 %	100 %	0 %	0 %	384206339
4	NC_017239	A	6	6	339	344	100 %	0 %	0 %	0 %	384206339
5	NC_017239	T	6	6	428	433	0 %	100 %	0 %	0 %	384206339
6	NC_017239	T	6	6	584	589	0 %	100 %	0 %	0 %	384206339
7	NC_017239	A	6	6	601	606	100 %	0 %	0 %	0 %	384206339
8	NC_017239	A	6	6	640	645	100 %	0 %	0 %	0 %	384206339
9	NC_017239	T	7	7	804	810	0 %	100 %	0 %	0 %	384206339
10	NC_017239	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	384206340
11	NC_017239	A	7	7	1514	1520	100 %	0 %	0 %	0 %	384206340
12	NC_017239	T	9	9	1567	1575	0 %	100 %	0 %	0 %	384206340
13	NC_017239	T	6	6	1606	1611	0 %	100 %	0 %	0 %	384206341
14	NC_017239	A	6	6	1624	1629	100 %	0 %	0 %	0 %	384206341
15	NC_017239	T	8	8	1635	1642	0 %	100 %	0 %	0 %	384206341
16	NC_017239	A	8	8	1686	1693	100 %	0 %	0 %	0 %	384206341
17	NC_017239	T	6	6	1698	1703	0 %	100 %	0 %	0 %	384206341
18	NC_017239	A	6	6	1738	1743	100 %	0 %	0 %	0 %	384206341
19	NC_017239	A	7	7	1942	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	384206342
20	NC_017239	T	6	6	2175	2180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017239	A	7	7	2310	2316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017239	A	6	6	2375	2380	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
23	NC_017239	A	7	7	2660	2666	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
24	NC_017239	A	8	8	2701	2708	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
25	NC_017239	A	7	7	2813	2819	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
26	NC_017239	A	7	7	2858	2864	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
27	NC_017239	A	7	7	2937	2943	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
28	NC_017239	A	6	6	3066	3071	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
29	NC_017239	A	8	8	3079	3086	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
30	NC_017239	A	6	6	3121	3126	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
31	NC_017239	A	6	6	3228	3233	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
32	NC_017239	A	6	6	3302	3307	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
33	NC_017239	A	6	6	3528	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
34	NC_017239	A	8	8	3624	3631	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
35	NC_017239	A	6	6	3741	3746	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
36	NC_017239	A	6	6	3837	3842	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
37	NC_017239	T	6	6	3850	3855	0 %	100 %	0 %	0 %	384206344
38	NC_017239	A	7	7	3884	3890	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
39	NC_017239	A	6	6	3972	3977	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
40	NC_017239	A	7	7	4012	4018	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
41	NC_017239	A	6	6	4025	4030	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
42	NC_017239	A	7	7	4779	4785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017239	T	7	7	4801	4807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017239	A	6	6	4820	4825	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
45	NC_017239	A	6	6	4903	4908	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
46	NC_017239	A	6	6	4923	4928	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
47	NC_017239	A	6	6	5188	5193	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
48	NC_017239	A	7	7	5312	5318	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
49	NC_017239	A	6	6	5335	5340	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
50	NC_017239	T	7	7	5470	5476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017239	T	6	6	5565	5570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017239	T	6	6	5949	5954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017239	T	6	6	6030	6035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017239	T	6	6	6090	6095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017239	T	8	8	6222	6229	0 %	100 %	0 %	0 %	384206348
56	NC_017239	T	7	7	6233	6239	0 %	100 %	0 %	0 %	384206348
57	NC_017239	T	7	7	6360	6366	0 %	100 %	0 %	0 %	384206348
58	NC_017239	T	6	6	6420	6425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017239	T	6	6	6551	6556	0 %	100 %	0 %	0 %	384206349
60	NC_017239	A	6	6	6643	6648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017239	T	6	6	6938	6943	0 %	100 %	0 %	0 %	384206351
62	NC_017239	A	7	7	7230	7236	100 %	0 %	0 %	0 %	384206353
63	NC_017239	A	6	6	7448	7453	100 %	0 %	0 %	0 %	384206354
64	NC_017239	A	7	7	7490	7496	100 %	0 %	0 %	0 %	384206354
65	NC_017239	T	9	9	7609	7617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017239	T	7	7	7706	7712	0 %	100 %	0 %	0 %	384206355
67	NC_017239	A	6	6	8018	8023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017239	A	7	7	8209	8215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017239	T	7	7	8583	8589	0 %	100 %	0 %	0 %	384206356
70	NC_017239	T	6	6	9061	9066	0 %	100 %	0 %	0 %	384206357
71	NC_017239	T	6	6	9130	9135	0 %	100 %	0 %	0 %	384206357
72	NC_017239	T	6	6	9195	9200	0 %	100 %	0 %	0 %	384206357
73	NC_017239	T	7	7	9883	9889	0 %	100 %	0 %	0 %	384206358
74	NC_017239	A	6	6	10000	10005	100 %	0 %	0 %	0 %	384206358
75	NC_017239	A	6	6	10147	10152	100 %	0 %	0 %	0 %	384206358
76	NC_017239	A	6	6	10322	10327	100 %	0 %	0 %	0 %	384206358
77	NC_017239	T	6	6	10509	10514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017239	T	7	7	10552	10558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017239	T	8	8	10667	10674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017239	T	6	6	10804	10809	0 %	100 %	0 %	0 %	384206359
81	NC_017239	C	8	8	10901	10908	0 %	0 %	0 %	100 %	384206359
82	NC_017239	T	7	7	10923	10929	0 %	100 %	0 %	0 %	384206359
83	NC_017239	T	6	6	11048	11053	0 %	100 %	0 %	0 %	384206359
84	NC_017239	T	6	6	11079	11084	0 %	100 %	0 %	0 %	384206359
85	NC_017239	T	6	6	11109	11114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017239	T	6	6	11236	11241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017239	A	6	6	11325	11330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017239	T	6	6	11368	11373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017239	A	6	6	11385	11390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017239	A	7	7	11464	11470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017239	T	6	6	11533	11538	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
92	NC_017239	T	6	6	11642	11647	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
93	NC_017239	T	6	6	11653	11658	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
94	NC_017239	T	6	6	11660	11665	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
95	NC_017239	T	6	6	11793	11798	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
96	NC_017239	T	8	8	11919	11926	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
97	NC_017239	T	6	6	12002	12007	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
98	NC_017239	T	9	9	12047	12055	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
99	NC_017239	T	7	7	12175	12181	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
100	NC_017239	T	8	8	12191	12198	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
101	NC_017239	T	6	6	12323	12328	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
102	NC_017239	T	6	6	12510	12515	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
103	NC_017239	T	7	7	12668	12674	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
104	NC_017239	T	7	7	12680	12686	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
105	NC_017239	T	7	7	12835	12841	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
106	NC_017239	T	6	6	12878	12883	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
107	NC_017239	T	6	6	12966	12971	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
108	NC_017239	T	9	9	13073	13081	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
109	NC_017239	A	6	6	13545	13550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017239	A	6	6	13735	13740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017239	T	6	6	13790	13795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017239	A	6	6	13796	13801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017239	T	7	7	14003	14009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017239	A	6	6	14010	14015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017239	A	7	7	14017	14023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017239	A	9	9	14089	14097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017239	T	6	6	14278	14283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017239	A	8	8	14425	14432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017239	T	6	6	14580	14585	0 %	100 %	0 %	0 %	384206362
120	NC_017239	T	6	6	14808	14813	0 %	100 %	0 %	0 %	384206362
121	NC_017239	A	7	7	14901	14907	100 %	0 %	0 %	0 %	384206362
122	NC_017239	A	6	6	15132	15137	100 %	0 %	0 %	0 %	384206362
123	NC_017239	A	6	6	15367	15372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017239	A	6	6	15545	15550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017239	A	6	6	15661	15666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017239	T	6	6	15722	15727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017239	A	7	7	15731	15737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017239	A	6	6	15842	15847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017239	T	6	6	15889	15894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017239	A	6	6	15920	15925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017239	A	6	6	15991	15996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017239	A	7	7	16061	16067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017239	A	6	6	16104	16109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017239	A	7	7	16185	16191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017239	T	6	6	16287	16292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017239	A	6	6	16312	16317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017239	A	6	6	16445	16450	100 %	0 %	0 %	0 %	384206363
138	NC_017239	A	6	6	16452	16457	100 %	0 %	0 %	0 %	384206363
139	NC_017239	A	6	6	16463	16468	100 %	0 %	0 %	0 %	384206363
140	NC_017239	A	6	6	16572	16577	100 %	0 %	0 %	0 %	384206364
141	NC_017239	A	6	6	16712	16717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017239	T	8	8	16944	16951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017239	A	6	6	16952	16957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017239	A	8	8	16975	16982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017239	T	6	6	17090	17095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017239	A	6	6	17154	17159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017239	T	6	6	17314	17319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017239	A	6	6	17345	17350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017239	T	6	6	17726	17731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017239	T	6	6	17763	17768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017239	A	6	6	17793	17798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017239	A	7	7	17955	17961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017239	T	6	6	18116	18121	0 %	100 %	0 %	0 %	384206365
154	NC_017239	A	6	6	18441	18446	100 %	0 %	0 %	0 %	384206366
155	NC_017239	A	9	9	18508	18516	100 %	0 %	0 %	0 %	384206366
156	NC_017239	T	6	6	18616	18621	0 %	100 %	0 %	0 %	384206367
157	NC_017239	T	7	7	18641	18647	0 %	100 %	0 %	0 %	384206367
158	NC_017239	A	7	7	18666	18672	100 %	0 %	0 %	0 %	384206367
159	NC_017239	A	6	6	19080	19085	100 %	0 %	0 %	0 %	384206367
160	NC_017239	T	6	6	19114	19119	0 %	100 %	0 %	0 %	384206367
161	NC_017239	A	6	6	19129	19134	100 %	0 %	0 %	0 %	384206367
162	NC_017239	T	6	6	19200	19205	0 %	100 %	0 %	0 %	384206367
163	NC_017239	T	6	6	19275	19280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017239	A	6	6	19322	19327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017239	T	6	6	19364	19369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017239	A	6	6	19418	19423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017239	A	7	7	19429	19435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017239	T	6	6	19560	19565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017239	A	6	6	19606	19611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017239	T	6	6	19765	19770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017239	T	7	7	19817	19823	0 %	100 %	0 %	0 %	384206369
172	NC_017239	T	6	6	19846	19851	0 %	100 %	0 %	0 %	384206369
173	NC_017239	T	7	7	19862	19868	0 %	100 %	0 %	0 %	384206369
174	NC_017239	T	8	8	19890	19897	0 %	100 %	0 %	0 %	384206369
175	NC_017239	A	7	7	20123	20129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017239	A	6	6	20251	20256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017239	A	6	6	20284	20289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_017239	A	6	6	20727	20732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017239	A	8	8	21044	21051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017239	A	7	7	21060	21066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017239	T	8	8	21211	21218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017239	A	6	6	21299	21304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017239	A	7	7	21328	21334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017239	A	7	7	21458	21464	100 %	0 %	0 %	0 %	384206371
185	NC_017239	A	8	8	21468	21475	100 %	0 %	0 %	0 %	384206371
186	NC_017239	A	6	6	21494	21499	100 %	0 %	0 %	0 %	384206371
187	NC_017239	A	9	9	21533	21541	100 %	0 %	0 %	0 %	384206371
188	NC_017239	G	10	10	21571	21580	0 %	0 %	100 %	0 %	384206371
189	NC_017239	T	6	6	21604	21609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_017239	A	6	6	21633	21638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_017239	A	6	6	21708	21713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_017239	T	6	6	22564	22569	0 %	100 %	0 %	0 %	384206374
193	NC_017239	T	6	6	22574	22579	0 %	100 %	0 %	0 %	384206374
194	NC_017239	T	6	6	22588	22593	0 %	100 %	0 %	0 %	384206374
195	NC_017239	T	7	7	22660	22666	0 %	100 %	0 %	0 %	384206374
196	NC_017239	T	6	6	22735	22740	0 %	100 %	0 %	0 %	384206374
197	NC_017239	A	6	6	22947	22952	100 %	0 %	0 %	0 %	384206374
198	NC_017239	T	6	6	22999	23004	0 %	100 %	0 %	0 %	384206374
199	NC_017239	T	6	6	23056	23061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_017239	T	6	6	23205	23210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_017239	T	6	6	23417	23422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_017239	A	6	6	23423	23428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_017239	A	9	9	23454	23462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_017239	A	6	6	23471	23476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
205	NC_017239	A	7	7	23508	23514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_017239	A	7	7	23550	23556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
207	NC_017239	A	7	7	23565	23571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
208	NC_017239	T	6	6	23740	23745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
209	NC_017239	A	8	8	23758	23765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
210	NC_017239	A	7	7	23789	23795	100 %	0 %	0 %	0 %	384206375
211	NC_017239	T	6	6	23954	23959	0 %	100 %	0 %	0 %	384206375
212	NC_017239	A	7	7	24234	24240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
213	NC_017239	T	6	6	24461	24466	0 %	100 %	0 %	0 %	384206376
214	NC_017239	T	7	7	24585	24591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
215	NC_017239	A	6	6	24735	24740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
216	NC_017239	T	6	6	24760	24765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
217	NC_017239	A	6	6	25111	25116	100 %	0 %	0 %	0 %	384206377
218	NC_017239	A	7	7	25231	25237	100 %	0 %	0 %	0 %	384206377
219	NC_017239	T	6	6	25398	25403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_017239	T	7	7	25484	25490	0 %	100 %	0 %	0 %	384206378
221	NC_017239	A	8	8	25639	25646	100 %	0 %	0 %	0 %	384206378
222	NC_017239	A	6	6	25727	25732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_017239	A	7	7	25744	25750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
224	NC_017239	T	6	6	25772	25777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
225	NC_017239	T	7	7	25933	25939	0 %	100 %	0 %	0 %	384206379
226	NC_017239	T	7	7	26316	26322	0 %	100 %	0 %	0 %	384206379
227	NC_017239	T	6	6	26335	26340	0 %	100 %	0 %	0 %	384206379
228	NC_017239	T	6	6	26426	26431	0 %	100 %	0 %	0 %	384206379
229	NC_017239	T	7	7	26556	26562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.