MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-2

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017239	A	6	6	88	93	100 %	0 %	0 %	0 %	384206339
2	NC_017239	T	9	9	322	330	0 %	100 %	0 %	0 %	384206339
3	NC_017239	A	6	6	339	344	100 %	0 %	0 %	0 %	384206339
4	NC_017239	T	6	6	428	433	0 %	100 %	0 %	0 %	384206339
5	NC_017239	T	6	6	584	589	0 %	100 %	0 %	0 %	384206339
6	NC_017239	A	6	6	601	606	100 %	0 %	0 %	0 %	384206339
7	NC_017239	A	6	6	640	645	100 %	0 %	0 %	0 %	384206339
8	NC_017239	T	7	7	804	810	0 %	100 %	0 %	0 %	384206339
9	NC_017239	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	384206340
10	NC_017239	A	7	7	1514	1520	100 %	0 %	0 %	0 %	384206340
11	NC_017239	T	9	9	1567	1575	0 %	100 %	0 %	0 %	384206340
12	NC_017239	T	6	6	1606	1611	0 %	100 %	0 %	0 %	384206341
13	NC_017239	A	6	6	1624	1629	100 %	0 %	0 %	0 %	384206341
14	NC_017239	T	8	8	1635	1642	0 %	100 %	0 %	0 %	384206341
15	NC_017239	A	8	8	1686	1693	100 %	0 %	0 %	0 %	384206341
16	NC_017239	T	6	6	1698	1703	0 %	100 %	0 %	0 %	384206341
17	NC_017239	A	6	6	1738	1743	100 %	0 %	0 %	0 %	384206341
18	NC_017239	A	7	7	1942	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	384206342
19	NC_017239	A	6	6	2375	2380	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
20	NC_017239	A	7	7	2660	2666	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
21	NC_017239	A	8	8	2701	2708	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
22	NC_017239	A	7	7	2813	2819	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
23	NC_017239	A	7	7	2858	2864	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
24	NC_017239	A	7	7	2937	2943	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
25	NC_017239	A	6	6	3066	3071	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
26	NC_017239	A	8	8	3079	3086	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
27	NC_017239	A	6	6	3121	3126	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
28	NC_017239	A	6	6	3228	3233	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
29	NC_017239	A	6	6	3302	3307	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
30	NC_017239	A	6	6	3528	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
31	NC_017239	A	8	8	3624	3631	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
32	NC_017239	A	6	6	3741	3746	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
33	NC_017239	A	6	6	3837	3842	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
34	NC_017239	T	6	6	3850	3855	0 %	100 %	0 %	0 %	384206344
35	NC_017239	A	7	7	3884	3890	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
36	NC_017239	A	6	6	3972	3977	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
37	NC_017239	A	7	7	4012	4018	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
38	NC_017239	A	6	6	4025	4030	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
39	NC_017239	A	6	6	4820	4825	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
40	NC_017239	A	6	6	4903	4908	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
41	NC_017239	A	6	6	4923	4928	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
42	NC_017239	A	6	6	5188	5193	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
43	NC_017239	A	7	7	5312	5318	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
44	NC_017239	A	6	6	5335	5340	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
45	NC_017239	T	8	8	6222	6229	0 %	100 %	0 %	0 %	384206348
46	NC_017239	T	7	7	6233	6239	0 %	100 %	0 %	0 %	384206348
47	NC_017239	T	7	7	6360	6366	0 %	100 %	0 %	0 %	384206348
48	NC_017239	T	6	6	6551	6556	0 %	100 %	0 %	0 %	384206349
49	NC_017239	T	6	6	6938	6943	0 %	100 %	0 %	0 %	384206351
50	NC_017239	A	7	7	7230	7236	100 %	0 %	0 %	0 %	384206353
51	NC_017239	A	6	6	7448	7453	100 %	0 %	0 %	0 %	384206354
52	NC_017239	A	7	7	7490	7496	100 %	0 %	0 %	0 %	384206354
53	NC_017239	T	7	7	7706	7712	0 %	100 %	0 %	0 %	384206355
54	NC_017239	T	7	7	8583	8589	0 %	100 %	0 %	0 %	384206356
55	NC_017239	T	6	6	9061	9066	0 %	100 %	0 %	0 %	384206357
56	NC_017239	T	6	6	9130	9135	0 %	100 %	0 %	0 %	384206357
57	NC_017239	T	6	6	9195	9200	0 %	100 %	0 %	0 %	384206357
58	NC_017239	T	7	7	9883	9889	0 %	100 %	0 %	0 %	384206358
59	NC_017239	A	6	6	10000	10005	100 %	0 %	0 %	0 %	384206358
60	NC_017239	A	6	6	10147	10152	100 %	0 %	0 %	0 %	384206358
61	NC_017239	A	6	6	10322	10327	100 %	0 %	0 %	0 %	384206358
62	NC_017239	T	6	6	10804	10809	0 %	100 %	0 %	0 %	384206359
63	NC_017239	C	8	8	10901	10908	0 %	0 %	0 %	100 %	384206359
64	NC_017239	T	7	7	10923	10929	0 %	100 %	0 %	0 %	384206359
65	NC_017239	T	6	6	11048	11053	0 %	100 %	0 %	0 %	384206359
66	NC_017239	T	6	6	11079	11084	0 %	100 %	0 %	0 %	384206359
67	NC_017239	T	6	6	11533	11538	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
68	NC_017239	T	6	6	11642	11647	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
69	NC_017239	T	6	6	11653	11658	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
70	NC_017239	T	6	6	11660	11665	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
71	NC_017239	T	6	6	11793	11798	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
72	NC_017239	T	8	8	11919	11926	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
73	NC_017239	T	6	6	12002	12007	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
74	NC_017239	T	9	9	12047	12055	0 %	100 %	0 %	0 %	384206360
75	NC_017239	T	7	7	12175	12181	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
76	NC_017239	T	8	8	12191	12198	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
77	NC_017239	T	6	6	12323	12328	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
78	NC_017239	T	6	6	12510	12515	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
79	NC_017239	T	7	7	12668	12674	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
80	NC_017239	T	7	7	12680	12686	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
81	NC_017239	T	7	7	12835	12841	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
82	NC_017239	T	6	6	12878	12883	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
83	NC_017239	T	6	6	12966	12971	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
84	NC_017239	T	9	9	13073	13081	0 %	100 %	0 %	0 %	384206361
85	NC_017239	T	6	6	14580	14585	0 %	100 %	0 %	0 %	384206362
86	NC_017239	T	6	6	14808	14813	0 %	100 %	0 %	0 %	384206362
87	NC_017239	A	7	7	14901	14907	100 %	0 %	0 %	0 %	384206362
88	NC_017239	A	6	6	15132	15137	100 %	0 %	0 %	0 %	384206362
89	NC_017239	A	6	6	16445	16450	100 %	0 %	0 %	0 %	384206363
90	NC_017239	A	6	6	16452	16457	100 %	0 %	0 %	0 %	384206363
91	NC_017239	A	6	6	16463	16468	100 %	0 %	0 %	0 %	384206363
92	NC_017239	A	6	6	16572	16577	100 %	0 %	0 %	0 %	384206364
93	NC_017239	T	6	6	18116	18121	0 %	100 %	0 %	0 %	384206365
94	NC_017239	A	6	6	18441	18446	100 %	0 %	0 %	0 %	384206366
95	NC_017239	A	9	9	18508	18516	100 %	0 %	0 %	0 %	384206366
96	NC_017239	T	6	6	18616	18621	0 %	100 %	0 %	0 %	384206367
97	NC_017239	T	7	7	18641	18647	0 %	100 %	0 %	0 %	384206367
98	NC_017239	A	7	7	18666	18672	100 %	0 %	0 %	0 %	384206367
99	NC_017239	A	6	6	19080	19085	100 %	0 %	0 %	0 %	384206367
100	NC_017239	T	6	6	19114	19119	0 %	100 %	0 %	0 %	384206367
101	NC_017239	A	6	6	19129	19134	100 %	0 %	0 %	0 %	384206367
102	NC_017239	T	6	6	19200	19205	0 %	100 %	0 %	0 %	384206367
103	NC_017239	T	7	7	19817	19823	0 %	100 %	0 %	0 %	384206369
104	NC_017239	T	6	6	19846	19851	0 %	100 %	0 %	0 %	384206369
105	NC_017239	T	7	7	19862	19868	0 %	100 %	0 %	0 %	384206369
106	NC_017239	T	8	8	19890	19897	0 %	100 %	0 %	0 %	384206369
107	NC_017239	A	7	7	21458	21464	100 %	0 %	0 %	0 %	384206371
108	NC_017239	A	8	8	21468	21475	100 %	0 %	0 %	0 %	384206371
109	NC_017239	A	6	6	21494	21499	100 %	0 %	0 %	0 %	384206371
110	NC_017239	A	9	9	21533	21541	100 %	0 %	0 %	0 %	384206371
111	NC_017239	G	10	10	21571	21580	0 %	0 %	100 %	0 %	384206371
112	NC_017239	T	6	6	22564	22569	0 %	100 %	0 %	0 %	384206374
113	NC_017239	T	6	6	22574	22579	0 %	100 %	0 %	0 %	384206374
114	NC_017239	T	6	6	22588	22593	0 %	100 %	0 %	0 %	384206374
115	NC_017239	T	7	7	22660	22666	0 %	100 %	0 %	0 %	384206374
116	NC_017239	T	6	6	22735	22740	0 %	100 %	0 %	0 %	384206374
117	NC_017239	A	6	6	22947	22952	100 %	0 %	0 %	0 %	384206374
118	NC_017239	T	6	6	22999	23004	0 %	100 %	0 %	0 %	384206374
119	NC_017239	A	7	7	23789	23795	100 %	0 %	0 %	0 %	384206375
120	NC_017239	T	6	6	23954	23959	0 %	100 %	0 %	0 %	384206375
121	NC_017239	T	6	6	24461	24466	0 %	100 %	0 %	0 %	384206376
122	NC_017239	A	6	6	25111	25116	100 %	0 %	0 %	0 %	384206377
123	NC_017239	A	7	7	25231	25237	100 %	0 %	0 %	0 %	384206377
124	NC_017239	T	7	7	25484	25490	0 %	100 %	0 %	0 %	384206378
125	NC_017239	A	8	8	25639	25646	100 %	0 %	0 %	0 %	384206378
126	NC_017239	T	7	7	25933	25939	0 %	100 %	0 %	0 %	384206379
127	NC_017239	T	7	7	26316	26322	0 %	100 %	0 %	0 %	384206379
128	NC_017239	T	6	6	26335	26340	0 %	100 %	0 %	0 %	384206379
129	NC_017239	T	6	6	26426	26431	0 %	100 %	0 %	0 %	384206379

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.