MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo chromosome

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017238	ATTTTA	2	12	22152	22163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017238	AATTAA	2	12	45379	45390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017238	TAAATT	2	12	79339	79350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017238	ATTAAA	2	12	86862	86873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017238	CAATAA	2	12	101318	101329	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017238	AAAACT	2	12	101413	101424	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017238	ATTAAA	2	12	109550	109561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017238	ATAGCA	2	12	148444	148455	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017238	AAAATA	2	12	203767	203778	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017238	TAAATA	2	12	244746	244757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017238	TTCAAA	2	12	286995	287006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017238	TAATAG	2	12	354458	354469	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017238	TTAAAA	2	12	358248	358259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017238	AAATTT	2	12	389429	389440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017238	CCTTTC	2	12	409119	409130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017238	TTAATA	2	12	411306	411317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017238	ATTAGT	2	12	436109	436120	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017238	TCGCTT	2	12	438305	438316	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017238	ATTAGT	2	12	439346	439357	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017238	TCGCTT	2	12	441542	441553	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017238	AATAAA	2	12	444762	444773	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017238	CAATTT	2	12	444812	444823	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017238	AAATTG	2	12	444827	444838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017238	TTCGCC	2	12	447796	447807	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017238	CTATTA	2	12	460628	460639	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017238	TAAACT	2	12	496826	496837	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017238	AGGTCT	2	12	507158	507169	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017238	AATAAG	2	12	550276	550287	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017238	TAAATT	2	12	579574	579585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017238	TAATTA	2	12	592570	592581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017238	AATTTT	2	12	613524	613535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017238	TTAGTT	2	12	631307	631318	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017238	TTGTTT	2	12	680211	680222	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017238	TCTTTA	2	12	690648	690659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017238	TTTAAT	2	12	707841	707852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017238	ATTATA	2	12	733475	733486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017238	AATTTT	2	12	760144	760155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017238	TTTATG	2	12	777904	777915	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017238	TATTTT	2	12	777948	777959	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017238	AAATTA	2	12	795724	795735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017238	GTTTTA	2	12	821568	821579	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017238	TAATGT	2	12	831197	831208	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017238	GAATTT	2	12	831234	831245	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017238	GTTCAA	2	12	833792	833803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017238	TTTTTC	2	12	854678	854689	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017238	TATTTT	2	12	888579	888590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.