MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo chromosome

Total Repeats: 612

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017238	TGACCA	2	12	2442	2453	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384206506
2	NC_017238	TTTTTA	2	12	2889	2900	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384206506
3	NC_017238	TTAAAC	2	12	3087	3098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206506
4	NC_017238	GGATTA	2	12	3603	3614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206507
5	NC_017238	AAGAAA	2	12	7148	7159	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384206509
6	NC_017238	CAATAG	2	12	8644	8655	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384206511
7	NC_017238	CAATAA	2	12	9067	9078	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384206511
8	NC_017238	TCTATT	2	12	9099	9110	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384206511
9	NC_017238	AAAAAT	2	12	9474	9485	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206512
10	NC_017238	AATAAA	2	12	9507	9518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206512
11	NC_017238	TAAAGA	2	12	9933	9944	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384206512
12	NC_017238	TAAAAA	2	12	9977	9988	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206512
13	NC_017238	AGACAA	2	12	11126	11137	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384206514
14	NC_017238	CAGATA	2	12	11173	11184	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384206514
15	NC_017238	AAAATT	2	12	13489	13500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206517
16	NC_017238	ATTCAT	2	12	15207	15218	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206518
17	NC_017238	GAAAAA	2	12	15852	15863	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384206520
18	NC_017238	TAAAGG	2	12	16317	16328	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384206520
19	NC_017238	AACTAT	2	12	19066	19077	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206523
20	NC_017238	GTAAAT	2	12	26406	26417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206530
21	NC_017238	TAACCT	2	12	27639	27650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206532
22	NC_017238	TCAAAC	2	12	28759	28770	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384206534
23	NC_017238	ATTTAA	2	12	32184	32195	50 %	50 %	0 %	0 %	384206538
24	NC_017238	TATCAA	2	12	32844	32855	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206538
25	NC_017238	TAAAAA	2	12	36559	36570	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206540
26	NC_017238	AATATT	2	12	38473	38484	50 %	50 %	0 %	0 %	384206542
27	NC_017238	ATTTTT	2	12	38716	38727	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384206542
28	NC_017238	TAAATT	2	12	38980	38991	50 %	50 %	0 %	0 %	384206542
29	NC_017238	AATATA	2	12	39892	39903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206543
30	NC_017238	AAAATC	2	12	41096	41107	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384206544
31	NC_017238	CAAAAA	2	12	42446	42457	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384206545
32	NC_017238	TCAATA	2	12	42540	42551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206546
33	NC_017238	ATTAAA	2	12	42846	42857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206546
34	NC_017238	CTCTTT	2	12	43704	43715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206547
35	NC_017238	TAAATT	2	12	43788	43799	50 %	50 %	0 %	0 %	384206547
36	NC_017238	TATATC	2	12	47597	47608	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206551
37	NC_017238	ATTTTT	2	12	47634	47645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384206551
38	NC_017238	AAATAA	2	12	48378	48389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206552
39	NC_017238	TAAAAA	2	12	49649	49660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206554
40	NC_017238	AATAAA	2	12	49987	49998	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206554
41	NC_017238	TCAAAT	2	12	51433	51444	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206557
42	NC_017238	TTTATT	2	12	54035	54046	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384206559
43	NC_017238	TTTAAA	2	12	54447	54458	50 %	50 %	0 %	0 %	384206559
44	NC_017238	TAAATT	2	12	55648	55659	50 %	50 %	0 %	0 %	384206560
45	NC_017238	TTAAAA	2	12	57315	57326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206563
46	NC_017238	AAATTT	2	12	57336	57347	50 %	50 %	0 %	0 %	384206563
47	NC_017238	AAAAAT	2	12	57656	57667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206563
48	NC_017238	AATCAA	2	12	59210	59221	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384206565
49	NC_017238	TAAATT	2	12	62679	62690	50 %	50 %	0 %	0 %	384206568
50	NC_017238	TTTAAG	2	12	63389	63400	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206569
51	NC_017238	GATATT	2	12	64169	64180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206570
52	NC_017238	AAAAAT	2	12	67835	67846	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206573
53	NC_017238	TATTTT	2	12	69380	69391	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384206573
54	NC_017238	ATAAAA	2	12	69596	69607	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206574
55	NC_017238	TAATTT	2	12	69738	69749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206574
56	NC_017238	GAAATT	2	12	71408	71419	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206576
57	NC_017238	AATTGA	2	12	72145	72156	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206576
58	NC_017238	AATAGA	2	12	73279	73290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384206577
59	NC_017238	TGAATA	2	12	74283	74294	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206578
60	NC_017238	TTGCTA	2	12	76191	76202	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384206580
61	NC_017238	TGGAAT	2	12	77388	77399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206581
62	NC_017238	TAAGCT	2	12	77546	77557	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206581
63	NC_017238	AAAAGA	2	12	77637	77648	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384206581
64	NC_017238	TTTAGA	2	12	77771	77782	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206582
65	NC_017238	CATTTG	2	12	78451	78462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384206582
66	NC_017238	AGGAAT	2	12	80184	80195	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384206584
67	NC_017238	TTAAAT	2	12	80288	80299	50 %	50 %	0 %	0 %	384206584
68	NC_017238	TTTTAT	2	12	80656	80667	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384206584
69	NC_017238	ATAAAA	2	12	80730	80741	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206584
70	NC_017238	TACAAA	2	12	81275	81286	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384206585
71	NC_017238	AAAGAA	2	12	81743	81754	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384206586
72	NC_017238	AATACT	2	12	85795	85806	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206588
73	NC_017238	AGATAA	2	12	87945	87956	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384206591
74	NC_017238	ATAAAA	2	12	88232	88243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206591
75	NC_017238	TTAAAC	2	12	88634	88645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206591
76	NC_017238	CAATTT	2	12	88653	88664	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206591
77	NC_017238	ATTTTT	2	12	89630	89641	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384206592
78	NC_017238	CAGAAA	2	12	90639	90650	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384206593
79	NC_017238	TAACTT	2	12	92945	92956	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206595
80	NC_017238	TCTTTC	2	12	95335	95346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206598
81	NC_017238	GAAATA	2	12	96265	96276	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384206598
82	NC_017238	AACATA	2	12	98502	98513	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384206600
83	NC_017238	TGGACT	2	12	100063	100074	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384206601
84	NC_017238	TCAAAC	2	12	100332	100343	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384206602
85	NC_017238	GAAATA	2	12	105256	105267	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384206606
86	NC_017238	TTGCTG	2	12	105869	105880	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384206608
87	NC_017238	GGAATT	2	12	108547	108558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206610
88	NC_017238	TAAACT	2	12	111761	111772	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206613
89	NC_017238	CAATAT	2	12	111811	111822	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206614
90	NC_017238	AAATAG	2	12	114411	114422	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384206616
91	NC_017238	AGATCA	2	12	117725	117736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384206620
92	NC_017238	AATTTC	2	12	119734	119745	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206623
93	NC_017238	TAATTT	2	12	120043	120054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206623
94	NC_017238	CTTTCT	2	12	123521	123532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206627
95	NC_017238	CATTTC	2	12	124217	124228	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384206628
96	NC_017238	AATTCT	2	12	124795	124806	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384206629
97	NC_017238	ATCTGA	2	12	128096	128107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206632
98	NC_017238	ATTTTT	2	12	132548	132559	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384206635
99	NC_017238	ATTTCC	2	12	134941	134952	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384206636
100	NC_017238	TTAAAA	2	12	135252	135263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206636
101	NC_017238	AATAAA	3	18	135637	135654	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206636
102	NC_017238	AAACTA	2	12	137004	137015	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384206637
103	NC_017238	CCTATA	2	12	138395	138406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206639
104	NC_017238	TCCACT	2	12	138651	138662	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384206640
105	NC_017238	ATTTTA	2	12	139585	139596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206640
106	NC_017238	ATCCCA	2	12	140419	140430	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384206640
107	NC_017238	TCCTCA	2	12	142483	142494	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384206642
108	NC_017238	CTTATT	2	12	142515	142526	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384206642
109	NC_017238	ACTAAG	2	12	142543	142554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384206642
110	NC_017238	TGGAAT	2	12	142654	142665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206643
111	NC_017238	AAAAGA	2	12	143831	143842	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384206643
112	NC_017238	AATCAA	2	12	145893	145904	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384206646
113	NC_017238	TCTAAA	2	12	146191	146202	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206647
114	NC_017238	TTTCAT	2	12	146999	147010	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384206647
115	NC_017238	CATTGC	2	12	147386	147397	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384206648
116	NC_017238	GTCTGA	2	12	148028	148039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384206648
117	NC_017238	TCAACT	2	12	149432	149443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206649
118	NC_017238	CAAGAA	2	12	152343	152354	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384206651
119	NC_017238	TTGGAA	2	12	152442	152453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206651
120	NC_017238	AACTAC	2	12	154827	154838	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384206653
121	NC_017238	TAAAAA	2	12	156436	156447	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206654
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