MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo chromosome

Total Repeats: 290

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017238	TTAT	2	8	8347	8354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017238	AATA	2	8	12778	12785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017238	TAAA	2	8	12792	12799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017238	AAGT	2	8	15807	15814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017238	TAAT	2	8	20015	20022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017238	ATTT	2	8	25737	25744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017238	TATT	2	8	38154	38161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017238	ATTT	2	8	40743	40750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017238	ATAA	2	8	46010	46017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017238	AATT	2	8	46441	46448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017238	AAAT	2	8	46692	46699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017238	AAGC	2	8	46859	46866	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017238	ATAA	2	8	47856	47863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017238	TAAT	2	8	47880	47887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017238	ACAT	2	8	56761	56768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017238	AATC	2	8	57977	57984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017238	ATTT	2	8	59023	59030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017238	CAAA	2	8	60515	60522	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017238	GAAA	2	8	70102	70109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017238	AAAT	2	8	70110	70117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017238	GAAA	2	8	70196	70203	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017238	TCTT	2	8	80780	80787	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017238	TTTA	2	8	80875	80882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017238	TACA	2	8	83908	83915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017238	TCCT	2	8	85810	85817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017238	AATT	2	8	98730	98737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017238	ATAA	2	8	98765	98772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017238	ACGA	2	8	100163	100170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017238	TTTA	2	8	101332	101339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017238	ATTT	2	8	101348	101355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017238	TAAT	3	12	102868	102879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017238	TTAA	2	8	108139	108146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017238	TTTA	2	8	112753	112760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017238	TATT	2	8	114524	114531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017238	TTAT	2	8	114558	114565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017238	CCAA	2	8	120564	120571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017238	AAAC	2	8	120588	120595	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017238	TTCT	2	8	130978	130985	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017238	TATT	2	8	131103	131110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017238	AATA	2	8	137951	137958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017238	TTAA	2	8	143923	143930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017238	TAAT	2	8	147319	147326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017238	AAAT	2	8	150624	150631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017238	GGTA	2	8	156075	156082	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017238	AATC	2	8	162520	162527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017238	AAAT	2	8	162747	162754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017238	ATTA	2	8	169111	169118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017238	AAAC	2	8	170865	170872	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017238	AGCA	2	8	173783	173790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017238	TTTA	2	8	188250	188257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017238	ATCT	2	8	188758	188765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017238	GATT	2	8	189714	189721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017238	GCAA	2	8	191179	191186	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017238	ATAA	2	8	193211	193218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017238	CATT	2	8	193286	193293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017238	TATT	2	8	193345	193352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017238	TTTA	2	8	205793	205800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017238	TTAA	2	8	205832	205839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017238	ATTT	2	8	206140	206147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017238	TACA	2	8	208252	208259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017238	ACAA	2	8	209581	209588	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017238	AACA	2	8	209632	209639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017238	AAAT	2	8	209669	209676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017238	TTAA	2	8	209748	209755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017238	AAAG	2	8	209757	209764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017238	TTAT	3	12	210047	210058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017238	ATGG	2	8	210364	210371	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017238	CAAC	2	8	210608	210615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017238	ATTT	2	8	210839	210846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017238	ATTA	2	8	210924	210931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017238	ACAT	2	8	227940	227947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017238	TAAA	2	8	230647	230654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017238	AATA	2	8	230737	230744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017238	TCAA	2	8	237434	237441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017238	AAAT	2	8	243402	243409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017238	CAAA	2	8	243812	243819	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017238	GAAA	2	8	244675	244682	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017238	TTAA	2	8	244727	244734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017238	ATTA	2	8	244780	244787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017238	GAAA	2	8	244793	244800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017238	CAAA	2	8	251424	251431	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017238	ATTT	2	8	251442	251449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017238	AATT	2	8	255594	255601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017238	TTAA	2	8	309607	309614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017238	TAAA	2	8	317361	317368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017238	TTAA	2	8	318826	318833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017238	ATTA	2	8	325459	325466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017238	TATT	2	8	333727	333734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017238	AATA	2	8	333762	333769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017238	TTAT	2	8	333822	333829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017238	AATA	2	8	334033	334040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017238	TAAA	2	8	337338	337345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017238	TAAA	2	8	337421	337428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017238	TAAA	2	8	339165	339172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017238	AATA	2	8	339319	339326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017238	ACAT	2	8	344071	344078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017238	TAAA	2	8	345440	345447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017238	TATT	2	8	354398	354405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017238	GATT	2	8	364625	364632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017238	ATTC	2	8	367444	367451	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017238	AATA	2	8	373277	373284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017238	ATTT	2	8	373285	373292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017238	ATAG	2	8	383301	383308	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017238	TAAA	2	8	388041	388048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017238	TATT	2	8	390927	390934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017238	AATA	2	8	390942	390949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017238	CAAA	2	8	392059	392066	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017238	CATT	2	8	393453	393460	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017238	AATC	2	8	395925	395932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017238	ATTT	2	8	395946	395953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017238	CCAA	2	8	408755	408762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017238	TCCT	2	8	410168	410175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017238	TATT	2	8	413824	413831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017238	CAAA	2	8	415076	415083	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017238	AAAT	2	8	425274	425281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017238	TTAA	2	8	436778	436785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017238	TACG	2	8	437251	437258	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017238	ACCT	2	8	437315	437322	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017238	CTAC	2	8	437385	437392	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017238	GTTT	2	8	438146	438153	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017238	CTAA	2	8	438281	438288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017238	TCGC	2	8	438771	438778	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017238	TAGC	2	8	438870	438877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017238	TTAA	2	8	440015	440022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017238	TACG	2	8	440488	440495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017238	ACCT	2	8	440552	440559	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017238	CTAC	2	8	440622	440629	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017238	GTTT	2	8	441383	441390	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017238	CTAA	2	8	441518	441525	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017238	TCGC	2	8	442008	442015	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017238	TAGC	2	8	442107	442114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017238	AAAT	2	8	442372	442379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017238	TCAA	2	8	444193	444200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017238	ACAA	2	8	444532	444539	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017238	TAAA	2	8	444599	444606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017238	ATTT	2	8	444968	444975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017238	TAAA	2	8	445049	445056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017238	CATA	2	8	445373	445380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017238	AATA	2	8	445583	445590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017238	CTAC	2	8	446019	446026	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017238	AGTA	2	8	446093	446100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017238	ATTC	2	8	446198	446205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017238	ATTA	2	8	446477	446484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017238	CTAC	2	8	447753	447760	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017238	AACT	2	8	448279	448286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017238	AATT	2	8	448346	448353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017238	CTTA	2	8	448587	448594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017238	TTTA	2	8	450134	450141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017238	TATC	2	8	450182	450189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017238	AAAG	2	8	450251	450258	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017238	TTAA	2	8	450598	450605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017238	AAAC	2	8	451050	451057	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.