MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo chromosome

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017238	AT	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017238	AT	3	6	714	719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017238	AC	3	6	720	725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017238	AT	3	6	8353	8358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017238	TC	3	6	29451	29456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017238	TC	3	6	39818	39823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017238	CT	3	6	46917	46922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017238	AT	3	6	49301	49306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017238	TA	3	6	49328	49333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017238	AT	3	6	56746	56751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017238	TG	3	6	70330	70335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017238	AT	3	6	86823	86828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017238	AT	3	6	94152	94157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017238	TA	3	6	105766	105771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017238	TA	3	6	112716	112721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017238	AG	3	6	112722	112727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017238	TA	3	6	131015	131020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017238	TA	3	6	131039	131044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017238	AT	3	6	132311	132316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017238	TA	3	6	133737	133742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017238	TA	3	6	137693	137698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017238	AG	3	6	159781	159786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017238	AT	3	6	159791	159796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017238	AT	3	6	164568	164573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017238	TA	3	6	170841	170846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017238	AT	3	6	182545	182550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017238	TA	3	6	189570	189575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017238	CA	3	6	189693	189698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017238	TA	4	8	193235	193242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017238	AT	3	6	202305	202310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017238	AT	3	6	202507	202512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017238	AT	3	6	205807	205812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017238	AT	3	6	205936	205941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017238	AT	3	6	208297	208302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017238	AG	3	6	208334	208339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017238	AT	3	6	209237	209242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017238	TA	3	6	209798	209803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017238	AT	3	6	210765	210770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017238	AT	3	6	220358	220363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017238	TA	3	6	221065	221070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017238	TA	3	6	230711	230716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017238	AT	3	6	237410	237415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017238	AT	3	6	241533	241538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017238	TC	4	8	243483	243490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017238	AT	3	6	243499	243504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017238	TA	3	6	243735	243740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017238	AT	3	6	244570	244575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017238	AT	3	6	244867	244872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017238	AC	5	10	251511	251520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017238	TA	3	6	272818	272823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017238	TC	3	6	301956	301961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017238	AT	4	8	309597	309604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017238	TC	3	6	309621	309626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017238	AT	3	6	317164	317169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017238	AT	3	6	325837	325842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017238	AT	3	6	326925	326930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017238	AT	3	6	339347	339352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017238	AC	3	6	373296	373301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017238	AT	5	10	383273	383282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017238	AT	3	6	388035	388040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017238	CA	3	6	396225	396230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017238	AT	3	6	398284	398289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017238	AT	3	6	405987	405992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017238	TA	3	6	406388	406393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017238	GT	3	6	408990	408995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017238	TA	3	6	416590	416595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017238	CA	3	6	419118	419123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017238	AT	3	6	425211	425216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017238	AT	3	6	436128	436133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017238	TC	3	6	437286	437291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017238	GC	3	6	437292	437297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017238	CT	3	6	437433	437438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017238	TA	3	6	438656	438661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017238	AT	4	8	439072	439079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017238	AT	5	10	439099	439108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017238	AT	3	6	439365	439370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017238	TC	3	6	440523	440528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017238	GC	3	6	440529	440534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017238	CT	3	6	440670	440675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017238	TA	3	6	441893	441898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017238	AT	4	8	442309	442316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017238	TC	3	6	443308	443313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017238	AT	3	6	443393	443398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017238	TA	3	6	444493	444498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017238	TA	3	6	445563	445568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017238	TA	3	6	445606	445611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017238	AC	3	6	445730	445735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017238	TA	3	6	445958	445963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017238	TA	3	6	446012	446017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017238	AC	3	6	446036	446041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017238	GT	3	6	447136	447141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017238	GT	3	6	447305	447310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017238	TA	3	6	447492	447497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017238	TA	3	6	447535	447540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017238	TA	3	6	447937	447942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017238	TC	3	6	448605	448610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017238	AT	3	6	450090	450095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017238	TA	3	6	458983	458988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017238	TA	5	10	460644	460653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017238	AT	3	6	460701	460706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017238	TA	3	6	462290	462295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017238	AT	5	10	471094	471103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017238	AT	3	6	474931	474936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017238	AT	3	6	477041	477046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017238	TA	3	6	478753	478758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017238	GA	3	6	483598	483603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017238	TC	3	6	483679	483684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017238	GA	3	6	484730	484735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017238	TC	3	6	484808	484813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017238	TA	3	6	485096	485101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017238	AT	3	6	488076	488081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017238	AG	3	6	492297	492302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017238	TG	3	6	493173	493178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017238	TA	3	6	494894	494899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017238	AT	3	6	498541	498546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017238	CT	3	6	498553	498558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017238	GA	3	6	505162	505167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017238	AT	4	8	534049	534056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017238	GT	3	6	534118	534123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017238	GT	3	6	534207	534212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017238	AT	3	6	550108	550113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017238	AT	3	6	554391	554396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017238	AT	3	6	571559	571564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017238	AG	4	8	574216	574223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017238	CT	4	8	574231	574238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017238	AT	3	6	579692	579697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017238	TA	3	6	585781	585786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017238	TA	3	6	586377	586382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017238	TA	3	6	587320	587325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017238	TA	3	6	592583	592588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017238	AT	3	6	601720	601725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017238	TA	4	8	601760	601767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017238	AT	3	6	603199	603204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017238	TA	3	6	610248	610253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017238	TA	3	6	620957	620962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017238	TA	5	10	631340	631349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017238	TA	3	6	633062	633067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017238	TA	3	6	633072	633077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017238	TG	3	6	638379	638384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017238	AT	3	6	656170	656175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017238	TA	3	6	661168	661173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017238	TA	3	6	663850	663855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017238	TA	3	6	663857	663862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017238	TA	4	8	663866	663873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017238	TA	3	6	675525	675530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017238	AT	3	6	675600	675605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017238	AT	3	6	675613	675618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017238	AT	3	6	707304	707309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017238	TA	4	8	707897	707904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017238	AT	3	6	708988	708993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.