MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp38

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017237	ATTGA	2	10	363	372	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017237	AGCTT	2	10	1522	1531	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017237	CAAAA	2	10	3184	3193	80 %	0 %	0 %	20 %	384207456
4	NC_017237	AAGAA	2	10	3758	3767	80 %	0 %	20 %	0 %	384207456
5	NC_017237	AAAAT	2	10	5354	5363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017237	AAAAT	2	10	5750	5759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017237	TAAAA	2	10	6421	6430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017237	TAAAT	2	10	7171	7180	60 %	40 %	0 %	0 %	384207459
9	NC_017237	TTAAT	2	10	7463	7472	40 %	60 %	0 %	0 %	384207461
10	NC_017237	ATATA	2	10	7967	7976	60 %	40 %	0 %	0 %	384207461
11	NC_017237	ATTAT	2	10	8026	8035	40 %	60 %	0 %	0 %	384207461
12	NC_017237	GAAAA	2	10	8691	8700	80 %	0 %	20 %	0 %	384207462
13	NC_017237	AAATT	2	10	8964	8973	60 %	40 %	0 %	0 %	384207462
14	NC_017237	TTCTA	2	10	9074	9083	20 %	60 %	0 %	20 %	384207462
15	NC_017237	GATTT	2	10	10499	10508	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017237	ATAAA	2	10	10571	10580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017237	ATTTT	2	10	11206	11215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017237	ATTAT	2	10	11824	11833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017237	TAATA	2	10	12389	12398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017237	TATCA	2	10	13332	13341	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017237	TAAAC	2	10	14088	14097	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017237	GAAAA	2	10	14383	14392	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017237	AATTC	2	10	14688	14697	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017237	AAAAC	2	10	16787	16796	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017237	AATTA	2	10	17199	17208	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017237	ATTAT	2	10	17209	17218	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017237	TCTTA	2	10	18129	18138	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017237	AATTA	2	10	18335	18344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017237	TTTAT	2	10	19716	19725	20 %	80 %	0 %	0 %	384207475
30	NC_017237	TTTCA	2	10	20051	20060	20 %	60 %	0 %	20 %	384207475
31	NC_017237	AAATA	2	10	20457	20466	80 %	20 %	0 %	0 %	384207476
32	NC_017237	TAAAT	2	10	20918	20927	60 %	40 %	0 %	0 %	384207477
33	NC_017237	AAGAT	2	10	22886	22895	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017237	TCAAA	2	10	23742	23751	60 %	20 %	0 %	20 %	384207479
35	NC_017237	TAAAG	2	10	24130	24139	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017237	TAAAT	2	10	25620	25629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017237	TATAT	2	10	25871	25880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017237	TATAT	2	10	25894	25903	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017237	ATAAG	2	10	26533	26542	60 %	20 %	20 %	0 %	384207482
40	NC_017237	AGTAT	2	10	26883	26892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017237	GGATA	2	10	29770	29779	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017237	ATTAA	2	10	30388	30397	60 %	40 %	0 %	0 %	384207486
43	NC_017237	TTGTA	2	10	32072	32081	20 %	60 %	20 %	0 %	384207490
44	NC_017237	CCCAA	2	10	32533	32542	40 %	0 %	0 %	60 %	384207490
45	NC_017237	ATTAT	2	10	32871	32880	40 %	60 %	0 %	0 %	384207490

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.