MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp38

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017237	CATA	2	8	293	300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017237	AAAT	2	8	443	450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017237	ATAG	2	8	462	469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017237	CTAA	2	8	488	495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017237	AAAT	2	8	546	553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017237	ATTT	2	8	601	608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017237	TAAA	2	8	645	652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017237	TATT	2	8	668	675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017237	TAAA	2	8	1426	1433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017237	TTCT	2	8	1659	1666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017237	AATA	2	8	1888	1895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017237	AAAT	2	8	1978	1985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017237	TAAA	2	8	2097	2104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017237	ATTT	2	8	2339	2346	25 %	75 %	0 %	0 %	384207456
15	NC_017237	ATCA	2	8	2783	2790	50 %	25 %	0 %	25 %	384207456
16	NC_017237	CTTC	2	8	3267	3274	0 %	50 %	0 %	50 %	384207456
17	NC_017237	ATTT	2	8	3437	3444	25 %	75 %	0 %	0 %	384207456
18	NC_017237	TAAA	2	8	3925	3932	75 %	25 %	0 %	0 %	384207456
19	NC_017237	TACA	2	8	4054	4061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017237	AACA	2	8	4361	4368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017237	TTTA	2	8	4603	4610	25 %	75 %	0 %	0 %	384207457
22	NC_017237	AGCA	2	8	4786	4793	50 %	0 %	25 %	25 %	384207457
23	NC_017237	AAAT	2	8	5226	5233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017237	AATA	2	8	5635	5642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017237	AAAT	2	8	5790	5797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017237	TTTA	2	8	6014	6021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017237	TATT	2	8	6234	6241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017237	GAAA	2	8	6379	6386	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017237	ATTT	2	8	6612	6619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017237	AATT	2	8	6857	6864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017237	TATT	2	8	7088	7095	25 %	75 %	0 %	0 %	384207459
32	NC_017237	TATT	2	8	7149	7156	25 %	75 %	0 %	0 %	384207459
33	NC_017237	TATT	2	8	7387	7394	25 %	75 %	0 %	0 %	384207460
34	NC_017237	ATAA	2	8	7398	7405	75 %	25 %	0 %	0 %	384207460
35	NC_017237	ATTT	2	8	7898	7905	25 %	75 %	0 %	0 %	384207461
36	NC_017237	TATT	2	8	7994	8001	25 %	75 %	0 %	0 %	384207461
37	NC_017237	ATTT	2	8	8190	8197	25 %	75 %	0 %	0 %	384207461
38	NC_017237	AAAG	2	8	8274	8281	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017237	TTGG	2	8	8378	8385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017237	AAAG	2	8	8845	8852	75 %	0 %	25 %	0 %	384207462
41	NC_017237	AATT	2	8	8881	8888	50 %	50 %	0 %	0 %	384207462
42	NC_017237	GAAA	2	8	9295	9302	75 %	0 %	25 %	0 %	384207462
43	NC_017237	TAAA	2	8	9666	9673	75 %	25 %	0 %	0 %	384207462
44	NC_017237	ATTT	2	8	9761	9768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017237	CAAA	2	8	10049	10056	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017237	ATTG	2	8	10295	10302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017237	TATC	2	8	10646	10653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017237	TAAA	2	8	10877	10884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017237	TCTA	2	8	11153	11160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017237	AACT	2	8	11432	11439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017237	ATTA	2	8	11560	11567	50 %	50 %	0 %	0 %	384207465
52	NC_017237	AAAT	2	8	11894	11901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017237	TAAA	2	8	12030	12037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017237	AAAT	2	8	12900	12907	75 %	25 %	0 %	0 %	384207466
55	NC_017237	ATTA	2	8	13083	13090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017237	ATAA	2	8	13170	13177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017237	TAAT	2	8	13503	13510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017237	TATG	2	8	13787	13794	25 %	50 %	25 %	0 %	384207467
59	NC_017237	TAAA	2	8	13927	13934	75 %	25 %	0 %	0 %	384207467
60	NC_017237	TAAT	2	8	14159	14166	50 %	50 %	0 %	0 %	384207468
61	NC_017237	ATTT	2	8	14454	14461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017237	AAAT	2	8	14631	14638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017237	TGAT	2	8	14722	14729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017237	ATTA	2	8	14730	14737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017237	TTAT	2	8	14881	14888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017237	TTTA	2	8	15002	15009	25 %	75 %	0 %	0 %	384207469
67	NC_017237	TAAA	2	8	15505	15512	75 %	25 %	0 %	0 %	384207470
68	NC_017237	AACT	2	8	15580	15587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017237	AATT	2	8	15899	15906	50 %	50 %	0 %	0 %	384207471
70	NC_017237	TAAT	2	8	15976	15983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017237	TTAA	2	8	16219	16226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017237	ATTG	2	8	16273	16280	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017237	GATA	2	8	16427	16434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017237	TAAG	2	8	16478	16485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017237	CTTA	2	8	16920	16927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017237	AATA	2	8	17132	17139	75 %	25 %	0 %	0 %	384207472
77	NC_017237	TAAA	2	8	17413	17420	75 %	25 %	0 %	0 %	384207473
78	NC_017237	AGAA	2	8	17479	17486	75 %	0 %	25 %	0 %	384207473
79	NC_017237	ATTT	2	8	18198	18205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017237	AATA	2	8	18214	18221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017237	TTAA	2	8	18435	18442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017237	TTAA	2	8	18678	18685	50 %	50 %	0 %	0 %	384207474
83	NC_017237	AATA	2	8	18933	18940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017237	AAGA	2	8	19199	19206	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017237	AACT	2	8	19395	19402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017237	GTTT	2	8	19450	19457	0 %	75 %	25 %	0 %	384207475
87	NC_017237	TCTT	2	8	19515	19522	0 %	75 %	0 %	25 %	384207475
88	NC_017237	ATTA	2	8	20178	20185	50 %	50 %	0 %	0 %	384207476
89	NC_017237	AAAG	2	8	21071	21078	75 %	0 %	25 %	0 %	384207477
90	NC_017237	CCAT	2	8	21095	21102	25 %	25 %	0 %	50 %	384207477
91	NC_017237	AATA	2	8	21150	21157	75 %	25 %	0 %	0 %	384207477
92	NC_017237	TTAT	2	8	21318	21325	25 %	75 %	0 %	0 %	384207477
93	NC_017237	AAAG	2	8	21612	21619	75 %	0 %	25 %	0 %	384207478
94	NC_017237	CTTT	2	8	22132	22139	0 %	75 %	0 %	25 %	384207478
95	NC_017237	TAAT	2	8	22270	22277	50 %	50 %	0 %	0 %	384207478
96	NC_017237	ATTT	2	8	22599	22606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017237	TAAA	2	8	22805	22812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017237	AATA	2	8	22857	22864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017237	TTAT	2	8	22905	22912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017237	TAAT	2	8	22949	22956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017237	AGTA	2	8	23587	23594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017237	AAAG	2	8	23660	23667	75 %	0 %	25 %	0 %	384207479
103	NC_017237	TAGA	2	8	23941	23948	50 %	25 %	25 %	0 %	384207479
104	NC_017237	ATCA	2	8	23957	23964	50 %	25 %	0 %	25 %	384207479
105	NC_017237	TAAA	3	12	24099	24110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017237	AAAT	2	8	25147	25154	75 %	25 %	0 %	0 %	384207481
107	NC_017237	TATT	2	8	25294	25301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017237	TAAT	2	8	25474	25481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017237	TAAT	2	8	25497	25504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017237	CAAA	2	8	25911	25918	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017237	AAAT	2	8	26899	26906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017237	CTTC	2	8	27090	27097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017237	AAAT	2	8	27397	27404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017237	TTGC	2	8	27604	27611	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017237	TTTA	2	8	27772	27779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017237	TAAA	2	8	27837	27844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017237	TAAA	2	8	28148	28155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017237	AAGC	2	8	28598	28605	50 %	0 %	25 %	25 %	384207483
119	NC_017237	TCAA	2	8	28606	28613	50 %	25 %	0 %	25 %	384207483
120	NC_017237	TAAG	2	8	28836	28843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017237	ATAA	2	8	28879	28886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017237	TTTG	2	8	28933	28940	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017237	GTAA	2	8	29342	29349	50 %	25 %	25 %	0 %	384207484
124	NC_017237	TTAA	2	8	29405	29412	50 %	50 %	0 %	0 %	384207484
125	NC_017237	TTAA	2	8	29550	29557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017237	ATAA	2	8	29570	29577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017237	ATTT	2	8	29676	29683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017237	AGAA	2	8	29694	29701	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017237	AATA	2	8	29975	29982	75 %	25 %	0 %	0 %	384207485
130	NC_017237	ATAA	2	8	30013	30020	75 %	25 %	0 %	0 %	384207486
131	NC_017237	TAAT	2	8	30191	30198	50 %	50 %	0 %	0 %	384207486
132	NC_017237	TAAA	2	8	30588	30595	75 %	25 %	0 %	0 %	384207487
133	NC_017237	TAAG	2	8	30879	30886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017237	AAAT	2	8	31277	31284	75 %	25 %	0 %	0 %	384207489
135	NC_017237	GTAT	2	8	31629	31636	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017237	GATT	2	8	31715	31722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017237	TTTG	2	8	31767	31774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017237	TAAT	2	8	31805	31812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017237	ATTA	2	8	31819	31826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017237	ATAC	2	8	32052	32059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017237	AACA	2	8	32855	32862	75 %	0 %	0 %	25 %	384207490
142	NC_017237	TTGG	2	8	33317	33324	0 %	50 %	50 %	0 %	384207491

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.