MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-8

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017236	ATATAA	2	12	505	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206483
2	NC_017236	TTAAAA	5	30	1117	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206483
3	NC_017236	TAAAAA	2	12	1236	1247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206484
4	NC_017236	TTAGAA	2	12	3081	3092	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384206486
5	NC_017236	ATTAAA	2	12	6103	6114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206489
6	NC_017236	CTATTC	2	12	9626	9637	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384206493
7	NC_017236	TTTTTG	2	12	15843	15854	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384206500
8	NC_017236	ACCATT	2	12	16613	16624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206501
9	NC_017236	CCAGCA	2	12	17046	17057	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384206501
10	NC_017236	CATTAG	3	18	17521	17538	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206501
11	NC_017236	CCTGAT	2	12	17695	17706	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384206501
12	NC_017236	CAGCCG	2	12	18359	18370	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384206502
13	NC_017236	ATCAGC	2	12	18729	18740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384206502
14	NC_017236	CATTAG	2	12	19187	19198	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206502
15	NC_017236	CAGCCG	2	12	19427	19438	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384206502
16	NC_017236	CACCAG	2	12	19451	19462	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384206502
17	NC_017236	CAGCAA	2	12	19664	19675	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384206502

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.