MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-8

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017236	GTTG	2	8	470	477	0 %	50 %	50 %	0 %	384206483
2	NC_017236	CAAA	2	8	757	764	75 %	0 %	0 %	25 %	384206483
3	NC_017236	TATT	2	8	988	995	25 %	75 %	0 %	0 %	384206483
4	NC_017236	AATA	2	8	1005	1012	75 %	25 %	0 %	0 %	384206483
5	NC_017236	CTAA	2	8	1077	1084	50 %	25 %	0 %	25 %	384206483
6	NC_017236	AAAC	2	8	1097	1104	75 %	0 %	0 %	25 %	384206483
7	NC_017236	AAAT	2	8	1256	1263	75 %	25 %	0 %	0 %	384206484
8	NC_017236	ATAA	2	8	1658	1665	75 %	25 %	0 %	0 %	384206484
9	NC_017236	AATA	2	8	1723	1730	75 %	25 %	0 %	0 %	384206484
10	NC_017236	CTTT	2	8	1777	1784	0 %	75 %	0 %	25 %	384206485
11	NC_017236	TTAC	2	8	1917	1924	25 %	50 %	0 %	25 %	384206485
12	NC_017236	GAAT	2	8	2589	2596	50 %	25 %	25 %	0 %	384206485
13	NC_017236	TCTA	2	8	2666	2673	25 %	50 %	0 %	25 %	384206485
14	NC_017236	TAAC	2	8	2971	2978	50 %	25 %	0 %	25 %	384206485
15	NC_017236	TTAA	2	8	3073	3080	50 %	50 %	0 %	0 %	384206486
16	NC_017236	AACT	2	8	3341	3348	50 %	25 %	0 %	25 %	384206486
17	NC_017236	ATTT	2	8	3658	3665	25 %	75 %	0 %	0 %	384206486
18	NC_017236	ATAA	2	8	3832	3839	75 %	25 %	0 %	0 %	384206486
19	NC_017236	AATT	3	12	3889	3900	50 %	50 %	0 %	0 %	384206486
20	NC_017236	ATTA	2	8	4122	4129	50 %	50 %	0 %	0 %	384206486
21	NC_017236	AGTA	2	8	4409	4416	50 %	25 %	25 %	0 %	384206487
22	NC_017236	ATAA	2	8	4477	4484	75 %	25 %	0 %	0 %	384206487
23	NC_017236	AAAT	2	8	4521	4528	75 %	25 %	0 %	0 %	384206487
24	NC_017236	AAAT	2	8	4749	4756	75 %	25 %	0 %	0 %	384206487
25	NC_017236	TATT	2	8	5222	5229	25 %	75 %	0 %	0 %	384206488
26	NC_017236	AATA	2	8	5242	5249	75 %	25 %	0 %	0 %	384206488
27	NC_017236	AATT	2	8	5403	5410	50 %	50 %	0 %	0 %	384206489
28	NC_017236	AAAT	2	8	5587	5594	75 %	25 %	0 %	0 %	384206489
29	NC_017236	AAAT	2	8	5866	5873	75 %	25 %	0 %	0 %	384206489
30	NC_017236	AGTG	2	8	5959	5966	25 %	25 %	50 %	0 %	384206489
31	NC_017236	TTAA	2	8	6011	6018	50 %	50 %	0 %	0 %	384206489
32	NC_017236	ATAA	2	8	6285	6292	75 %	25 %	0 %	0 %	384206489
33	NC_017236	AAAT	2	8	6349	6356	75 %	25 %	0 %	0 %	384206489
34	NC_017236	TAAA	2	8	6461	6468	75 %	25 %	0 %	0 %	384206490
35	NC_017236	AAAT	2	8	6544	6551	75 %	25 %	0 %	0 %	384206490
36	NC_017236	TCTA	2	8	7071	7078	25 %	50 %	0 %	25 %	384206490
37	NC_017236	TAAA	2	8	7260	7267	75 %	25 %	0 %	0 %	384206490
38	NC_017236	ATTT	2	8	7692	7699	25 %	75 %	0 %	0 %	384206491
39	NC_017236	CAAG	2	8	7782	7789	50 %	0 %	25 %	25 %	384206491
40	NC_017236	TCCA	2	8	8026	8033	25 %	25 %	0 %	50 %	384206491
41	NC_017236	TAAA	2	8	8266	8273	75 %	25 %	0 %	0 %	384206492
42	NC_017236	AATA	2	8	8426	8433	75 %	25 %	0 %	0 %	384206492
43	NC_017236	CTTA	2	8	9065	9072	25 %	50 %	0 %	25 %	384206492
44	NC_017236	AAAC	2	8	9488	9495	75 %	0 %	0 %	25 %	384206493
45	NC_017236	AATA	2	8	9539	9546	75 %	25 %	0 %	0 %	384206493
46	NC_017236	TTTC	2	8	9860	9867	0 %	75 %	0 %	25 %	384206493
47	NC_017236	TTTG	2	8	10017	10024	0 %	75 %	25 %	0 %	384206493
48	NC_017236	AAAG	2	8	10114	10121	75 %	0 %	25 %	0 %	384206494
49	NC_017236	CTTT	2	8	10128	10135	0 %	75 %	0 %	25 %	384206494
50	NC_017236	CAAA	2	8	10320	10327	75 %	0 %	0 %	25 %	384206494
51	NC_017236	AAAT	2	8	10843	10850	75 %	25 %	0 %	0 %	384206494
52	NC_017236	CTCC	2	8	11141	11148	0 %	25 %	0 %	75 %	384206495
53	NC_017236	TAAT	2	8	11229	11236	50 %	50 %	0 %	0 %	384206495
54	NC_017236	ATAA	2	8	12736	12743	75 %	25 %	0 %	0 %	384206496
55	NC_017236	TCTT	2	8	13552	13559	0 %	75 %	0 %	25 %	384206497
56	NC_017236	ATGA	2	8	13569	13576	50 %	25 %	25 %	0 %	384206497
57	NC_017236	TTCT	2	8	13889	13896	0 %	75 %	0 %	25 %	384206498
58	NC_017236	GTTT	2	8	13927	13934	0 %	75 %	25 %	0 %	384206498
59	NC_017236	ATCA	2	8	14107	14114	50 %	25 %	0 %	25 %	384206498
60	NC_017236	TTTA	2	8	14182	14189	25 %	75 %	0 %	0 %	384206498
61	NC_017236	GTTT	2	8	15083	15090	0 %	75 %	25 %	0 %	384206500
62	NC_017236	TAAA	2	8	15134	15141	75 %	25 %	0 %	0 %	384206500
63	NC_017236	TCCT	2	8	15432	15439	0 %	50 %	0 %	50 %	384206500
64	NC_017236	TCTT	2	8	15502	15509	0 %	75 %	0 %	25 %	384206500
65	NC_017236	TTTG	2	8	15661	15668	0 %	75 %	25 %	0 %	384206500
66	NC_017236	TTTC	2	8	15692	15699	0 %	75 %	0 %	25 %	384206500

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.