MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-8

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017236	TTA	2	6	74	79	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017236	GAT	2	6	212	217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017236	CTC	2	6	230	235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017236	AAT	2	6	281	286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017236	ATT	2	6	368	373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017236	ATT	2	6	380	385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017236	CAA	2	6	498	503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206483
8	NC_017236	CTA	2	6	642	647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206483
9	NC_017236	TAA	2	6	911	916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206483
10	NC_017236	TCA	2	6	948	953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206483
11	NC_017236	TCT	2	6	1037	1042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206483
12	NC_017236	ACA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206484
13	NC_017236	TAA	2	6	1339	1344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206484
14	NC_017236	AAC	2	6	1348	1353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206484
15	NC_017236	TAA	2	6	1354	1359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206484
16	NC_017236	ATT	2	6	1465	1470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206484
17	NC_017236	TAA	2	6	1539	1544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206484
18	NC_017236	ATT	2	6	1556	1561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206484
19	NC_017236	ATG	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206484
20	NC_017236	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206485
21	NC_017236	TAA	2	6	2021	2026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206485
22	NC_017236	ATC	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206485
23	NC_017236	CTT	2	6	2179	2184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206485
24	NC_017236	TTA	2	6	2211	2216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206485
25	NC_017236	TGC	2	6	2276	2281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206485
26	NC_017236	ATT	2	6	2322	2327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206485
27	NC_017236	TTA	2	6	2379	2384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206485
28	NC_017236	TAT	2	6	2459	2464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206485
29	NC_017236	CTG	2	6	2500	2505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206485
30	NC_017236	AGA	2	6	2744	2749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206485
31	NC_017236	TCT	2	6	2760	2765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206485
32	NC_017236	CCT	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206485
33	NC_017236	AGA	2	6	2927	2932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206485
34	NC_017236	ATA	2	6	2935	2940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206485
35	NC_017236	CAA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206485
36	NC_017236	ATA	2	6	3047	3052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206485
37	NC_017236	GAT	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206486
38	NC_017236	ATA	2	6	3308	3313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206486
39	NC_017236	TTA	2	6	3378	3383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206486
40	NC_017236	TTA	2	6	3519	3524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206486
41	NC_017236	CAA	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206486
42	NC_017236	AAT	2	6	3640	3645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206486
43	NC_017236	TTA	2	6	3646	3651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206486
44	NC_017236	GCT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206486
45	NC_017236	ATC	2	6	3770	3775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206486
46	NC_017236	TAT	2	6	3850	3855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206486
47	NC_017236	AGA	2	6	3959	3964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206486
48	NC_017236	TAA	2	6	4051	4056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206486
49	NC_017236	ATA	2	6	4103	4108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206486
50	NC_017236	ATT	2	6	4115	4120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206486
51	NC_017236	AGC	2	6	4154	4159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206487
52	NC_017236	AGC	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206487
53	NC_017236	TGA	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206487
54	NC_017236	AAT	2	6	4336	4341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206487
55	NC_017236	AGA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206487
56	NC_017236	ATT	2	6	4460	4465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206487
57	NC_017236	ATT	2	6	4508	4513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206487
58	NC_017236	CCT	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206487
59	NC_017236	CAG	2	6	4624	4629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206487
60	NC_017236	ATA	2	6	4631	4636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206487
61	NC_017236	AAG	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206487
62	NC_017236	CCA	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206487
63	NC_017236	AGC	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206487
64	NC_017236	TAA	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206487
65	NC_017236	CTT	2	6	4974	4979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206487
66	NC_017236	ATT	2	6	4985	4990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206487
67	NC_017236	ATT	2	6	5058	5063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017236	TAT	2	6	5135	5140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017236	CCT	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017236	TTA	2	6	5211	5216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017236	ACA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206488
72	NC_017236	TAA	2	6	5359	5364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206488
73	NC_017236	AAT	2	6	5486	5491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206489
74	NC_017236	CAT	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206489
75	NC_017236	ATC	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206489
76	NC_017236	AAT	2	6	5919	5924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206489
77	NC_017236	TAA	2	6	5935	5940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206489
78	NC_017236	TTC	2	6	5951	5956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206489
79	NC_017236	AAT	2	6	6048	6053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206489
80	NC_017236	ATA	2	6	6250	6255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206489
81	NC_017236	ACC	2	6	6377	6382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017236	TTC	2	6	6383	6388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017236	TTC	2	6	6400	6405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017236	ATT	3	9	6561	6569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206490
85	NC_017236	ATT	2	6	6648	6653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206490
86	NC_017236	TAT	2	6	6743	6748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206490
87	NC_017236	TAG	3	9	6900	6908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206490
88	NC_017236	ATA	2	6	7032	7037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206490
89	NC_017236	TTC	2	6	7053	7058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206490
90	NC_017236	ATA	2	6	7081	7086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206490
91	NC_017236	AAT	2	6	7184	7189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206490
92	NC_017236	CTT	2	6	7197	7202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206490
93	NC_017236	AAG	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206490
94	NC_017236	TAA	2	6	7247	7252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206490
95	NC_017236	TCA	2	6	7312	7317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206490
96	NC_017236	TAC	2	6	7343	7348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206490
97	NC_017236	GCT	2	6	7358	7363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206490
98	NC_017236	ATA	2	6	7369	7374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206490
99	NC_017236	ATT	2	6	7399	7404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206490
100	NC_017236	ACA	2	6	7418	7423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206490
101	NC_017236	ATT	2	6	7519	7524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206491
102	NC_017236	GAT	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206491
103	NC_017236	CAA	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206491
104	NC_017236	TAA	2	6	7623	7628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206491
105	NC_017236	TAT	2	6	7635	7640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206491
106	NC_017236	CAA	2	6	7719	7724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206491
107	NC_017236	GAT	2	6	7736	7741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206491
108	NC_017236	TCT	2	6	7796	7801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206491
109	NC_017236	AAT	2	6	7816	7821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206491
110	NC_017236	TAC	2	6	7887	7892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206491
111	NC_017236	AAC	2	6	8056	8061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206491
112	NC_017236	ATA	2	6	8162	8167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206491
113	NC_017236	ATT	2	6	8186	8191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206491
114	NC_017236	TAA	2	6	8224	8229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206492
115	NC_017236	GAA	2	6	8241	8246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206492
116	NC_017236	ATA	2	6	8297	8302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206492
117	NC_017236	CTG	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206492
118	NC_017236	ATT	2	6	8529	8534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206492
119	NC_017236	TAA	2	6	8564	8569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206492
120	NC_017236	TTA	2	6	8595	8600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206492
121	NC_017236	ATT	2	6	8717	8722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206492
122	NC_017236	TCA	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206492
123	NC_017236	CTA	2	6	9004	9009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206492
124	NC_017236	ATT	2	6	9188	9193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206492
125	NC_017236	AAT	2	6	9220	9225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206492
126	NC_017236	ACT	2	6	9284	9289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017236	TAA	2	6	9314	9319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017236	ACT	2	6	9324	9329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017236	ATC	2	6	9351	9356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017236	AAT	2	6	9424	9429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206493
131	NC_017236	TCT	2	6	9436	9441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206493
132	NC_017236	ATT	2	6	9507	9512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206493
133	NC_017236	TTC	2	6	9513	9518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206493
134	NC_017236	AAT	2	6	9591	9596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206493
135	NC_017236	TCC	2	6	9648	9653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206493
136	NC_017236	TAA	2	6	9765	9770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206493
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162	NC_017236	TAA	2	6	11815	11820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_017236	ATT	3	9	12905	12913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017236	TAA	2	6	12914	12919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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372	NC_017236	TCA	2	6	20449	20454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206502
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374	NC_017236	CAA	2	6	20465	20470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206502
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376	NC_017236	CAG	2	6	20549	20554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206502
377	NC_017236	AAC	2	6	20575	20580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206502
378	NC_017236	TCA	2	6	20602	20607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206502
379	NC_017236	CAG	2	6	20609	20614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206502
380	NC_017236	CAG	2	6	20660	20665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
381	NC_017236	CAA	2	6	20669	20674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.