MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-8

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017236	AT	3	6	201	206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017236	AT	3	6	535	540	50 %	50 %	0 %	0 %	384206483
3	NC_017236	TA	3	6	545	550	50 %	50 %	0 %	0 %	384206483
4	NC_017236	AT	3	6	585	590	50 %	50 %	0 %	0 %	384206483
5	NC_017236	AT	3	6	665	670	50 %	50 %	0 %	0 %	384206483
6	NC_017236	TA	3	6	790	795	50 %	50 %	0 %	0 %	384206483
7	NC_017236	AT	3	6	839	844	50 %	50 %	0 %	0 %	384206483
8	NC_017236	AT	3	6	977	982	50 %	50 %	0 %	0 %	384206483
9	NC_017236	AT	3	6	1409	1414	50 %	50 %	0 %	0 %	384206484
10	NC_017236	TC	3	6	2798	2803	0 %	50 %	0 %	50 %	384206485
11	NC_017236	TC	3	6	2884	2889	0 %	50 %	0 %	50 %	384206485
12	NC_017236	AT	3	6	4792	4797	50 %	50 %	0 %	0 %	384206487
13	NC_017236	TA	3	6	5077	5082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017236	AT	3	6	5367	5372	50 %	50 %	0 %	0 %	384206488
15	NC_017236	AT	4	8	5974	5981	50 %	50 %	0 %	0 %	384206489
16	NC_017236	AT	3	6	6092	6097	50 %	50 %	0 %	0 %	384206489
17	NC_017236	TA	3	6	7551	7556	50 %	50 %	0 %	0 %	384206491
18	NC_017236	TA	3	6	7956	7961	50 %	50 %	0 %	0 %	384206491
19	NC_017236	TA	3	6	8327	8332	50 %	50 %	0 %	0 %	384206492
20	NC_017236	CT	3	6	8498	8503	0 %	50 %	0 %	50 %	384206492
21	NC_017236	AT	3	6	9297	9302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017236	TA	3	6	9519	9524	50 %	50 %	0 %	0 %	384206493
23	NC_017236	AT	3	6	9658	9663	50 %	50 %	0 %	0 %	384206493
24	NC_017236	AT	3	6	10010	10015	50 %	50 %	0 %	0 %	384206493
25	NC_017236	TA	3	6	10813	10818	50 %	50 %	0 %	0 %	384206494
26	NC_017236	AT	3	6	10986	10991	50 %	50 %	0 %	0 %	384206495
27	NC_017236	AT	3	6	11282	11287	50 %	50 %	0 %	0 %	384206495
28	NC_017236	TA	3	6	11551	11556	50 %	50 %	0 %	0 %	384206495
29	NC_017236	TA	3	6	11563	11568	50 %	50 %	0 %	0 %	384206495
30	NC_017236	TA	3	6	11842	11847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017236	TA	4	8	11910	11917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017236	TA	4	8	12794	12801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017236	TA	3	6	13074	13079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017236	AT	3	6	13782	13787	50 %	50 %	0 %	0 %	384206498
35	NC_017236	AT	3	6	13800	13805	50 %	50 %	0 %	0 %	384206498
36	NC_017236	TA	3	6	14116	14121	50 %	50 %	0 %	0 %	384206498
37	NC_017236	AT	3	6	14556	14561	50 %	50 %	0 %	0 %	384206499
38	NC_017236	TA	3	6	14691	14696	50 %	50 %	0 %	0 %	384206499
39	NC_017236	TG	3	6	14934	14939	0 %	50 %	50 %	0 %	384206499
40	NC_017236	AT	3	6	14940	14945	50 %	50 %	0 %	0 %	384206499
41	NC_017236	AT	3	6	15242	15247	50 %	50 %	0 %	0 %	384206500
42	NC_017236	TA	3	6	16059	16064	50 %	50 %	0 %	0 %	384206500

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.