MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-7

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017235	AAGTA	2	10	1689	1698	60 %	20 %	20 %	0 %	384206454
2	NC_017235	TTTGA	2	10	2375	2384	20 %	60 %	20 %	0 %	384206454
3	NC_017235	TAAGT	2	10	2676	2685	40 %	40 %	20 %	0 %	384206454
4	NC_017235	ATATT	2	10	3603	3612	40 %	60 %	0 %	0 %	384206454
5	NC_017235	TAAAA	2	10	4412	4421	80 %	20 %	0 %	0 %	384206454
6	NC_017235	CTTTG	2	10	4475	4484	0 %	60 %	20 %	20 %	384206454
7	NC_017235	ATATG	2	10	5363	5372	40 %	40 %	20 %	0 %	384206456
8	NC_017235	TAATT	2	10	5501	5510	40 %	60 %	0 %	0 %	384206456
9	NC_017235	TTTTA	2	10	6466	6475	20 %	80 %	0 %	0 %	384206457
10	NC_017235	TTTTC	2	10	9670	9679	0 %	80 %	0 %	20 %	384206461
11	NC_017235	GAATT	2	10	12591	12600	40 %	40 %	20 %	0 %	384206464
12	NC_017235	CTTGG	2	10	12961	12970	0 %	40 %	40 %	20 %	384206465
13	NC_017235	TAGAT	2	10	15365	15374	40 %	40 %	20 %	0 %	384206468
14	NC_017235	ACTGA	2	10	15925	15934	40 %	20 %	20 %	20 %	384206469
15	NC_017235	CTTGA	2	10	18363	18372	20 %	40 %	20 %	20 %	384206469
16	NC_017235	ATTTG	2	10	19691	19700	20 %	60 %	20 %	0 %	384206472
17	NC_017235	CCACA	2	10	21042	21051	40 %	0 %	0 %	60 %	384206475
18	NC_017235	ACAAA	2	10	22073	22082	80 %	0 %	0 %	20 %	384206476
19	NC_017235	GATTG	2	10	22161	22170	20 %	40 %	40 %	0 %	384206476
20	NC_017235	CCCCA	2	10	23103	23112	20 %	0 %	0 %	80 %	384206477

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.