MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-7

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017235	AAAT	2	8	201	208	75 %	25 %	0 %	0 %	384206452
2	NC_017235	ATCA	2	8	372	379	50 %	25 %	0 %	25 %	384206452
3	NC_017235	ACCA	2	8	555	562	50 %	0 %	0 %	50 %	384206452
4	NC_017235	ATTT	2	8	1011	1018	25 %	75 %	0 %	0 %	384206453
5	NC_017235	TATC	2	8	2095	2102	25 %	50 %	0 %	25 %	384206454
6	NC_017235	ATTA	2	8	3116	3123	50 %	50 %	0 %	0 %	384206454
7	NC_017235	GATA	2	8	3304	3311	50 %	25 %	25 %	0 %	384206454
8	NC_017235	TTTC	2	8	3857	3864	0 %	75 %	0 %	25 %	384206454
9	NC_017235	AAGT	2	8	3960	3967	50 %	25 %	25 %	0 %	384206454
10	NC_017235	ATTT	2	8	4285	4292	25 %	75 %	0 %	0 %	384206454
11	NC_017235	GCTA	2	8	4442	4449	25 %	25 %	25 %	25 %	384206454
12	NC_017235	AAAT	2	8	5281	5288	75 %	25 %	0 %	0 %	384206455
13	NC_017235	AAAC	2	8	5853	5860	75 %	0 %	0 %	25 %	384206456
14	NC_017235	ACTT	2	8	5881	5888	25 %	50 %	0 %	25 %	384206456
15	NC_017235	TTAC	2	8	6067	6074	25 %	50 %	0 %	25 %	384206457
16	NC_017235	ATAA	2	8	6378	6385	75 %	25 %	0 %	0 %	384206457
17	NC_017235	ATTA	2	8	7520	7527	50 %	50 %	0 %	0 %	384206459
18	NC_017235	TTCT	2	8	7528	7535	0 %	75 %	0 %	25 %	384206459
19	NC_017235	CAAA	2	8	7777	7784	75 %	0 %	0 %	25 %	384206459
20	NC_017235	AAAT	2	8	7811	7818	75 %	25 %	0 %	0 %	384206459
21	NC_017235	TTAT	2	8	7911	7918	25 %	75 %	0 %	0 %	384206459
22	NC_017235	TGAC	2	8	8259	8266	25 %	25 %	25 %	25 %	384206460
23	NC_017235	TATT	2	8	8421	8428	25 %	75 %	0 %	0 %	384206460
24	NC_017235	TCCC	2	8	8456	8463	0 %	25 %	0 %	75 %	384206460
25	NC_017235	TTGT	2	8	8706	8713	0 %	75 %	25 %	0 %	384206460
26	NC_017235	GTTT	2	8	9257	9264	0 %	75 %	25 %	0 %	384206461
27	NC_017235	AAAC	2	8	9266	9273	75 %	0 %	0 %	25 %	384206461
28	NC_017235	ATTT	2	8	9467	9474	25 %	75 %	0 %	0 %	384206461
29	NC_017235	CTTT	2	8	10204	10211	0 %	75 %	0 %	25 %	384206461
30	NC_017235	GATC	2	8	10284	10291	25 %	25 %	25 %	25 %	384206462
31	NC_017235	TTTC	2	8	10479	10486	0 %	75 %	0 %	25 %	384206462
32	NC_017235	CTTT	2	8	10491	10498	0 %	75 %	0 %	25 %	384206462
33	NC_017235	TCGC	2	8	11289	11296	0 %	25 %	25 %	50 %	384206462
34	NC_017235	TTCT	2	8	11488	11495	0 %	75 %	0 %	25 %	384206462
35	NC_017235	TTTG	2	8	11792	11799	0 %	75 %	25 %	0 %	384206462
36	NC_017235	TTCA	2	8	12166	12173	25 %	50 %	0 %	25 %	384206463
37	NC_017235	AAAC	2	8	12180	12187	75 %	0 %	0 %	25 %	384206463
38	NC_017235	AATT	2	8	12449	12456	50 %	50 %	0 %	0 %	384206464
39	NC_017235	ATTA	2	8	12822	12829	50 %	50 %	0 %	0 %	384206464
40	NC_017235	AATC	2	8	13450	13457	50 %	25 %	0 %	25 %	384206465
41	NC_017235	AATC	2	8	14359	14366	50 %	25 %	0 %	25 %	384206467
42	NC_017235	AACA	2	8	14996	15003	75 %	0 %	0 %	25 %	384206468
43	NC_017235	TTGG	2	8	15254	15261	0 %	50 %	50 %	0 %	384206468
44	NC_017235	GCTC	2	8	16368	16375	0 %	25 %	25 %	50 %	384206469
45	NC_017235	ATTG	2	8	17413	17420	25 %	50 %	25 %	0 %	384206469
46	NC_017235	ATTG	2	8	17845	17852	25 %	50 %	25 %	0 %	384206469
47	NC_017235	TTGC	2	8	18578	18585	0 %	50 %	25 %	25 %	384206470
48	NC_017235	TTTG	2	8	18676	18683	0 %	75 %	25 %	0 %	384206470
49	NC_017235	AAGA	2	8	18723	18730	75 %	0 %	25 %	0 %	384206470
50	NC_017235	TTTC	2	8	18950	18957	0 %	75 %	0 %	25 %	384206471
51	NC_017235	TCTA	2	8	19239	19246	25 %	50 %	0 %	25 %	384206472
52	NC_017235	TCTT	2	8	19933	19940	0 %	75 %	0 %	25 %	384206473
53	NC_017235	GTAC	2	8	20910	20917	25 %	25 %	25 %	25 %	384206474
54	NC_017235	TGCT	2	8	21679	21686	0 %	50 %	25 %	25 %	384206475
55	NC_017235	GTAT	2	8	22049	22056	25 %	50 %	25 %	0 %	384206476
56	NC_017235	TTGC	2	8	23335	23342	0 %	50 %	25 %	25 %	384206478
57	NC_017235	TTTG	2	8	23606	23613	0 %	75 %	25 %	0 %	384206478
58	NC_017235	AATT	2	8	23948	23955	50 %	50 %	0 %	0 %	384206478
59	NC_017235	TAAT	2	8	26276	26283	50 %	50 %	0 %	0 %	384206481
60	NC_017235	TTGA	2	8	26489	26496	25 %	50 %	25 %	0 %	384206481
61	NC_017235	TAAT	2	8	26697	26704	50 %	50 %	0 %	0 %	384206481
62	NC_017235	ATAG	2	8	26718	26725	50 %	25 %	25 %	0 %	384206481

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.